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Rab40c-flox 基因敲除小鼠

Rab40c-flox 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Rab40c-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-06760

品系全称

C57BL/6JCya-Rab40cem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-224624-Rab40c-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Rab40c-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-06760) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
Rab40C, member RAS oncogene family
基因别称
RAR3
染色体号
Chr 17 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_139154.2 | Ensembl: ENSMUST00000026826
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 5~6
敲除长度
~1073 bp
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
更多信息
Rab40c，也称为RAB40C，是一种小GTPase，属于Ras超家族。GTPases是一类重要的信号转导分子，参与细胞内的多种生物学过程，包括细胞骨架重组、细胞器运输、膜融合和分裂等。Rab40c在细胞内的定位和功能尚未被完全阐明，但已有研究显示它可能在细胞内囊泡运输中发挥作用。

Rab40c与脂滴的形成和成熟有关。在HepG2细胞中，Rab40c与脂滴标记物Oil Red或Nile Red结合，但在高尔基体或内体标记物中未发现结合。Rab40c在脂滴形成和成熟过程中逐渐被招募到脂滴表面。Rab40c的敲低导致脂滴尺寸适度减小，表明Rab40c可能参与脂滴的生物发生。在3T3-L1细胞中，脂肪细胞分化的刺激会增加Rab40c的表达。Rab40c与TIP47相互作用，并与其标记的脂滴位置相邻。此外，Rab40c的过表达会导致脂滴聚集，这种聚集与其GTPase活性无关，但完全依赖于Rab40c中SOCS盒结构的完整性。Rab40c还表现出自我相互作用以及与TIP47的相互作用，SOCS盒对于Rab40c诱导脂滴聚集的能力至关重要。这些结果表明，Rab40c是一种与脂滴相关的新型Rab蛋白，可能参与调节脂滴的生物发生[4]。

Rab40c还与生殖发育有关。在农业害虫Bactrocera dorsalis中，Rab40c在成熟雌性的卵巢中富集。RNA干扰（RNAi）介导的BdRab40C敲低导致卵黄蛋白合成减少、卵巢发育不全和生育能力低下。此外，通过RNAi耗尽胰岛素受体InR或20-羟基蜕皮甾酮（20E）的异源二聚体受体（EcR或USP）显著降低了BdRab40C的转录，并导致生育能力降低。进一步的研究表明，胰岛素或20E的注射可以上调BdRab40C的转录。这些结果表明，Rab40c参与胰岛素和20E通路的协调，调节B. dorsalis的生殖发育[5]。

Rab40c还参与免疫调节。在黑色素细胞中，Rab40c与Varp（VPS9-ankyrin重复蛋白）相互作用，并通过其ANKR2结构域与Rab40C相互作用，从而负调节Varp蛋白水平。然而，RACK1（受体激酶C1）与Varp的ANKR2结构域结合，并竞争性地抑制Rab40C与Varp的相互作用。RACK1的敲低导致黑色素细胞中Varp蛋白水平显著降低和树突生长的抑制。有趣的是，RACK1的过表达抑制了Varp与Rab40C之间的相互作用，并抵消了Rab40c对树突生长的负面影响。这些发现表明，RACK1通过与Rab40C竞争结合Varp的ANKR2结构域，通过稳定Varp来调节树突生长[6]。

Rab40c与髓鞘形成有关。Rab40c是一种从少突胶质细胞cDNA文库中克隆的新型Rab蛋白。Rab40c的DNA序列包含一个843碱基对的开放阅读框。推定的氨基酸序列是一个含有281个氨基酸的蛋白质，分子量为31,466 Da，等电点为9.83。Rab40c具有几个独特的结构特征，包括羧基末端延伸和GTP结合基序中的氨基酸替代。羧基末端区域包含允许异戊二烯化和棕榈酰化的基序。结合研究表明，Rab40c与鸟苷酸5'-O-(3-硫三磷酸)（GTPγS）结合的Kd值为21微摩尔，对GTP的亲和力高于对GDP的亲和力。Rab40c定位于细胞核周循环区，表明它可能参与内吞作用，如受体循环。这种循环在髓鞘形成中的重要性表明，随着少突胶质细胞的分化，Rab40c mRNA和Rab40c蛋白水平都会增加[7]。

Rab40c的表达与多种疾病相关。例如，Rab40c的表达在肺鳞状细胞癌（LUSC）中显著升高。Rab40c的表达与免疫因素、免疫相关通路和微卫星不稳定性（MSI）显著相关。此外，Rab40c与LUSC相关的免疫浸润细胞、CD4记忆激活细胞、γδ T细胞、M1样巨噬细胞和免疫调节因子CD28显著负相关，而与调节性T细胞（Tregs）和自然杀伤细胞的激活正相关。进一步，由Rab40c和其相关免疫基因构建的风险模型表明，Rab40c可能是LUSC的一个独立预后因素。Rab40c可以用作LUSC的有效预后生物标志物和潜在的免疫治疗靶点[3]。

Rab40c的表达与骨质疏松症相关。在一项病例对照研究中，RAB40C基因的rs62030917位点与酒精性股骨头坏死（ONFH）的风险增加显著相关。在等位基因模型中，rs62030917位点的G等位基因显著增加了酒精性ONFH的风险（OR = 1.47，95% CI = 1.07-2.02，p = 0.017）。此外，rs620930917位点在优势模型和加性模型中也增加了酒精性ONFH的风险。年龄分层分析表明，rs62030917位点增加了42岁以下个体酒精性ONFH的风险。此外，rs2269556位点的AA、GA和GG基因型携带者的低密度脂蛋白胆固醇（LDL-C）水平显著不同，其中GG基因型携带者的LDL-C水平最高。这些结果表明，RAB40C基因的rs62030917位点可能增加酒精性ONFH的风险，为RAB40C在酒精性ONFH中的作用机制提供了理论基础[1]。

Rab40c的表达与腰椎间盘突出症（LDH）相关。在一项病例对照研究中，RAB40C基因的rs62030917和rs2269556位点与LDH的风险增加显著相关。在等位基因模型中，rs62030917和rs2269556位点的G等位基因显著增加了LDH的风险。在遗传模型分析中，rs2269556位点与LDH的风险增加相关，而rs62030917位点仅在年龄分层分析中与LDH的风险增加相关。这些结果表明，RAB40C基因的rs62030917和rs2269556位点可能影响中国人汉族人群对LDH的遗传易感性[2]。

Rab40c的表达与肾移植耐受性相关。在一项研究中，研究者开发并验证了第一个共识基因表达特征，用于识别肾移植受者（KTRs）中的“操作耐受性”（OT）。该特征包括CD40、CTLA4、HSD11B1、IGKV4-1、MZB1、NR3C2和RAB40C等基因。该特征在交叉验证和六个月随访样本中表现出良好的性能。这些结果表明，Rab40c可能参与肾移植耐受性的调节[8]。

Rab40c的表达与骨肉瘤的生存相关。在一项基于TARGET-骨肉瘤数据库的研究中，研究者发现RAB40C基因在死亡患者中下调。这些结果表明，RAB40C基因可能是骨肉瘤的独立预后候选基因[9]。

综上所述，Rab40c是一种多功能的小GTPase，参与细胞内囊泡运输、脂滴形成、生殖发育、免疫调节和髓鞘形成等过程。Rab40c的表达与多种疾病相关，包括肺鳞状细胞癌、酒精性股骨头坏死、腰椎间盘突出症、肾移植耐受性和骨肉瘤。Rab40c的研究有助于深入理解其在多种生物学过程中的作用机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献：
1. Liu, Chang, Liu, Xuan, Li, Xiaowei. 2021. RAB40C Gene Polymorphisms Were Associated with Alcohol-Induced Osteonecrosis of the Femoral Head. In International journal of general medicine, 14, 3583-3591. doi:10.2147/IJGM.S316481. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34305407/
2. Liu, Kexun, Huo, Hongjun, Jia, Wenchao, Zuo, Yuan, Zhao, Yan. 2021. RAB40C gene polymorphisms rs62030917 and rs2269556 are associated with an increased risk of lumbar disc herniation development in the Chinese Han population. In The journal of gene medicine, 23, e3252. doi:10.1002/jgm.3252. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32656896/
3. Wu, Hong, Dong, Xuhui, Liao, Lixian, Huang, Lihaoyun. 2022. An Integrative Analysis Identifying RAB40C as an Oncogenic Immune Protein and Prognostic Marker of Lung Squamous Cell Carcinoma. In Pharmacogenomics and personalized medicine, 15, 525-537. doi:10.2147/PGPM.S357166. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35645578/
4. Tan, Ran, Wang, Weijie, Wang, Shicong, Hong, Wanjin, Wang, Tuanlao. 2013. Small GTPase Rab40c associates with lipid droplets and modulates the biogenesis of lipid droplets. In PloS one, 8, e63213. doi:10.1371/journal.pone.0063213. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23638186/
5. Zheng, Weiwei, Wu, Fangyu, Ye, Yinhao, Zhang, Zhenyu, Zhang, Hongyu. 2022. Small GTPase Rab40C is upregulated by 20-hydroxyecdysone and insulin pathways to regulate ovarian development and fecundity. In Insect science, 29, 1583-1600. doi:10.1111/1744-7917.13026. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35349758/
6. Marubashi, Soujiro, Ohbayashi, Norihiko, Fukuda, Mitsunori. 2016. A Varp-Binding Protein, RACK1, Regulates Dendrite Outgrowth through Stabilization of Varp Protein in Mouse Melanocytes. In The Journal of investigative dermatology, 136, 1672-1680. doi:10.1016/j.jid.2016.03.034. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27066885/
7. Rodriguez-Gabin, A G, Almazan, G, Larocca, J N. . Vesicle transport in oligodendrocytes: probable role of Rab40c protein. In Journal of neuroscience research, 76, 758-70. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15160388/
8. Christakoudi, Sofia, Runglall, Manohursingh, Mobillo, Paula, Lord, Graham M, Hernandez-Fuentes, Maria P. 2020. Development and validation of the first consensus gene-expression signature of operational tolerance in kidney transplantation, incorporating adjustment for immunosuppressive drug therapy. In EBioMedicine, 58, 102899. doi:10.1016/j.ebiom.2020.102899. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32707447/
9. Rothzerg, Emel, Xu, Jiake, Wood, David, Kõks, Sulev. 2021. 12 Survival-related differentially expressed genes based on the TARGET-osteosarcoma database. In Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.), 246, 2072-2081. doi:10.1177/15353702211007410. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33926256/

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