Cyyr1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Cyyr1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-06744

品系全称

C57BL/6JCya-Cyyr1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-224405-Cyyr1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Cyyr1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-06744) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
cysteine and tyrosine-rich protein 1
基因别称
-
染色体号
Chr 16 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_144853 | Ensembl: ENSMUST00000114174
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~1.3 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
CYYR1,全称为Cysteine/tyrosine-rich 1,是一种位于人类21号染色体上的基因。该基因编码一种富含半胱氨酸和酪氨酸的蛋白质,其功能目前尚不清楚。CYYR1基因的发现是通过深入的生物信息学分析得出的,该分析揭示了21号染色体上一个以前未预测到的编码区域。CYYR1基因由四个外显子组成,跨度约为107kb,包括一个85.8kb的超大内含子。通过Northern blot分析,发现CYYR1 mRNA在广泛的组织中表达,存在两种大小分别为3.4kb和2.2kb的转录本[3]。此外,CYYR1在胺前体摄取和脱羧化系统相关的细胞中高表达[3]。对小鼠Cyyr1同源基因的克隆和定位,以及CYYR1家族成员的序列和系统发育分析,揭示了CYYR1蛋白家族的一个显著特征,即一个中央的、独特的富含半胱氨酸和酪氨酸的区域,该区域从低等脊椎动物(鱼类)到人类都高度保守,但在细菌和无脊椎动物中缺失[3]。

CYYR1基因的表达模式在不同的组织和细胞系中存在差异。在正常组织和肿瘤细胞系中,CYYR1的表达存在量化和质化的变化,这表明CYYR1可能参与复杂疾病的发病机制[1]。在神经内分泌肿瘤中,CYYR1 mRNA存在一种微妙的可变剪接,产生两种不同的转录本,分别称为CAG-和CAG+转录本。这两种转录本的差异在于CAG+转录本中存在一个额外的CAG密码子,导致CYYR1蛋白中在 exon 3/exon 4交界处存在一个额外的丙氨酸残基[5]。此外,CYYR1 CAG-转录本在神经内分泌肿瘤和正常组织中表达量显著高于CAG+转录本[5]。

CYYR1基因在多种生物学过程中发挥重要作用。研究发现,CYYR1与高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平的变化相关。在一项前瞻性家庭研究中,CYYR1基因与HDL-C水平的变化呈显著关联[4]。此外,CYYR1还与溃疡性结肠炎(UC)的严重程度相关。通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)和随机森林算法,发现CYYR1基因是UC严重程度的关键基因之一[2]。此外,CYYR1基因还与支气管肺发育不良(BPD)相关。通过差异表达基因分析和加权基因共表达网络分析,发现CYYR1基因是BPD的潜在生物标志物之一[6]。此外,CYYR1基因还与角膜内皮细胞的表达相关。研究发现,CYYR1基因在角膜内皮细胞中高表达,可以作为角膜内皮细胞的可靠表达标记[7]。最后,CYYR1基因还与铬中毒引起的肝代谢紊乱相关。在铬中毒的鸡肝脏中,CYYR1基因的表达显著上调[8]。

综上所述,CYYR1基因是一种重要的基因,参与调控多种生物学过程,包括HDL-C水平的变化、UC的严重程度、BPD的发生发展、角膜内皮细胞的表达以及铬中毒引起的肝代谢紊乱。CYYR1基因的研究有助于深入理解这些生物学过程的机制,为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Casadei, Raffaella, Pelleri, Maria Chiara, Vitale, Lorenza, Piva, Francesco, Frabetti, Flavia. 2014. Characterization of human gene locus CYYR1: a complex multi-transcript system. In Molecular biology reports, 41, 6025-38. doi:10.1007/s11033-014-3480-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24981926/
2. Wang, Yao, Zhuang, Hao, Jiang, Xiao-Han, Wang, Hai-Yang, Fan, Zhi-Ning. 2023. Unveiling the key genes, environmental toxins, and drug exposures in modulating the severity of ulcerative colitis: a comprehensive analysis. In Frontiers in immunology, 14, 1162458. doi:10.3389/fimmu.2023.1162458. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37539055/
3. Vitale, Lorenza, Casadei, Raffaella, Canaider, Silvia, Carinci, Paolo, Zannotti, Maria. . Cysteine and tyrosine-rich 1 (CYYR1), a novel unpredicted gene on human chromosome 21 (21q21.2), encodes a cysteine and tyrosine-rich protein and defines a new family of highly conserved vertebrate-specific genes. In Gene, 290, 141-51. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12062809/
4. Feitosa, Mary F, Lunetta, Kathryn L, Wang, Lihua, Murabito, Joanne M, Province, Michael A. 2020. Gene discovery for high-density lipoprotein cholesterol level change over time in prospective family studies. In Atherosclerosis, 297, 102-110. doi:10.1016/j.atherosclerosis.2020.02.005. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32109663/
5. Vitale, Lorenza, Frabetti, Flavia, Huntsman, Shane A, Coppola, Domenico, Strippoli, Pierluigi. 2007. Sequence, "subtle" alternative splicing and expression of the CYYR1 (cysteine/tyrosine-rich 1) mRNA in human neuroendocrine tumors. In BMC cancer, 7, 66. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17442112/
6. Luo, Liyan, Luo, Fei, Wu, Chuyan, Bao, Yunlei, Jiang, Feng. . Identification of potential biomarkers in the peripheral blood of neonates with bronchopulmonary dysplasia using WGCNA and machine learning algorithms. In Medicine, 103, e37083. doi:10.1097/MD.0000000000037083. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38277517/
7. Chng, Zhenzhi, Peh, Gary S L, Herath, Wishva B, Mehta, Jodhbir S, Colman, Alan. 2013. High throughput gene expression analysis identifies reliable expression markers of human corneal endothelial cells. In PloS one, 8, e67546. doi:10.1371/journal.pone.0067546. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23844023/
8. Tian, Xinxin, Zhang, Hui, Zhao, Yali, Javed, Muhammad Tariq, Zhou, Donghai. 2018. Transcriptome analysis reveals the molecular mechanism of hepatic metabolism disorder caused by chromium poisoning in chickens. In Environmental science and pollution research international, 25, 15411-15421. doi:10.1007/s11356-018-1653-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29564706/