Vars1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Vars1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-06578

品系全称

C57BL/6JCya-Vars1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-22321-Vars1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Vars1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-06578) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
valyl-tRNA synthetase 1
基因别称
Bat6,D17H6S56E,G7a,Vars,Vars2
染色体号
Chr 17 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_011690 | Ensembl: ENSMUST00000087315
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3~8
敲除长度
~2.4 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
VARS1,即valyl-tRNA synthetase 1,是一种编码缬氨酰-tRNA合成酶的基因,该酶在蛋白质生物合成过程中负责将缬氨酸与相应的tRNA分子结合。缬氨酰-tRNA合成酶属于氨基酰-tRNA合成酶家族,这个家族在所有生物体中都是高度保守的,并在翻译过程中发挥着关键作用。VARS1基因突变与多种人类遗传性疾病相关,包括神经发育障碍、肿瘤发生和免疫疾病等。

在一项研究中,研究人员发现了一种新的VARS1基因变异,导致p.T1068M突变。携带这种突变的个体表现出神经发育障碍,包括难治性癫痫、运动迟缓和微头症等症状。通过结构建模和分析,研究人员发现p.T1068M突变位于VARS1基因的密码子结合域中一个由15个氨基酸组成的短片段上,这个片段包含了之前报道的VARS1突变中的四分之一。这些突变形成了一个螺旋-转角-螺旋结构,并可能破坏密码子结合域与tRNA合成酶域之间的相互作用,从而阻碍VARS1的最佳酶活性。这一发现为开发能够缓解这些突变功能影响的药物奠定了基础[1]。

另一项研究通过转录组学网络分析,发现VARS1是一个与M2型肿瘤相关巨噬细胞浸润相关的潜在治疗靶点,可以提高黑色素瘤免疫治疗的效果。研究发现,VARS1在M2型巨噬细胞相关的加权基因共表达网络分析(WGCNA)模块中是一个枢纽基因,并且对于黑色素瘤的生长是必要的。在体外实验中,VARS1的表达增加促进了黑色素瘤细胞的迁移和侵袭,而VARS1的表达下调则产生了相反的效果。此外,VARS1的表达与免疫相关信号通路和几个免疫检查点基因的表达呈负相关。这项研究揭示了VARS1在黑色素瘤进展、M2巨噬细胞极化和免疫治疗耐药性发展中的作用[2]。

在强直性脊柱炎(AS)的研究中,VARS1被认为是潜在的药物靶点或生物标志物。通过对蛋白定量性状位点(pQTLs)和单核苷酸多态性(SNP)的分析,研究人员发现VARS1与AS风险相关。这项研究强调了MR分析在AS研究中的作用,为识别生物标志物和治疗药物靶点提供了新的思路[3]。

此外,VARS1基因与疟原虫的药物抗性基因之间存在物理连锁,这导致了西太平洋地区疟原虫分离株中VARS基因的保守性。研究发现,varS2和varS3基因的存在与抗疟药的抗性基因型相关,而varS4基因与氯喹抗性基因型相关[4]。

在肝细胞癌(HCC)的研究中,定量蛋白质组学分析揭示了VARS1在HCC侵袭性中的作用。研究发现,VARS1是HCC中最一致过表达的氨基酰-tRNA合成酶(ARSs),并且与侵袭性相关。VARS1的表达下调与MAGI1的表达上调相关,而MAGI1是一种在HCC中的肿瘤抑制因子。这项研究表明,VARS1通过调节MAGI1的表达来促进HCC的侵袭性,使其成为HCC治疗的一个潜在靶点[5]。

最后,全外显子组关联研究发现,VARS1与中东地区乳头状甲状腺癌(PTC)风险相关。这项研究强调了VARS1在PTC易感性中的作用,并揭示了PTC遗传异质性的复杂性[6]。

总之,VARS1基因在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括神经发育、肿瘤发生、免疫疾病和寄生虫感染等。VARS1基因突变与多种人类遗传性疾病相关,并且在不同类型的癌症中表现出不同的表达模式和功能。进一步研究VARS1的功能和调控机制,将为理解这些疾病的发生和发展提供新的见解,并为开发新的治疗方法提供潜在靶点[7][8]。

参考文献:
1. Hiz, Semra, Kiliç, Seval, Bademci, Güney, Karaca, Ezgi, Öztürk, Mehmet. 2022. VARS1 mutations associated with neurodevelopmental disorder are located on a short amino acid stretch of the anticodon-binding domain. In Turkish journal of biology = Turk biyoloji dergisi, 46, 458-464. doi:10.55730/1300-0152.2631. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37529793/
2. Wu, Zhengquan, Lei, Ke, Li, Huaizhi, He, Jiali, Shi, Enxian. 2022. Transcriptome-based network analysis related to M2-like tumor-associated macrophage infiltration identified VARS1 as a potential target for improving melanoma immunotherapy efficacy. In Journal of translational medicine, 20, 489. doi:10.1186/s12967-022-03686-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36303162/
3. Zhang, Ye, Liu, Wei, Lai, Junda, Zeng, Huiqiong. 2024. Genetic associations in ankylosing spondylitis: circulating proteins as drug targets and biomarkers. In Frontiers in immunology, 15, 1394438. doi:10.3389/fimmu.2024.1394438. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38835753/
4. Fowler, Elizabeth V, Chavchich, Marina, Chen, Nanhua, Gatton, Michelle L, Cheng, Qin. 2006. Physical linkage to drug resistance genes results in conservation of var genes among West Pacific Plasmodium falciparum isolates. In The Journal of infectious diseases, 194, 939-48. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16960782/
5. Hermán-Sánchez, Natalia, Del Rio-Moreno, Mercedes, Ciria, Rubén, López-Cánovas, Juan L, Gahete, Manuel D. 2025. Quantitative proteomic analysis unveils a critical role of VARS1 in hepatocellular carcinoma aggressiveness through the modulation of MAGI1 expression. In Molecular cancer, 24, 15. doi:10.1186/s12943-024-02206-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39810176/
6. Bu, Rong, Siraj, Abdul K, Azam, Saud, Al-Dayel, Fouad, Al-Kuraya, Khawla S. 2023. Whole Exome-Wide Association Identifies Rare Variants in GALNT9 Associated with Middle Eastern Papillary Thyroid Carcinoma Risk. In Cancers, 15, . doi:10.3390/cancers15174235. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37686511/
7. Tjon, Jill K, Lakeman, Phillis, van Leeuwen, Elisabeth, van der Knoop, Bloeme J, de Vries, Johanna I P. 2021. Fetal akinesia deformation sequence and massive perivillous fibrin deposition resulting in fetal death in six fetuses from one consanguineous couple, including literature review. In Molecular genetics & genomic medicine, 9, e1827. doi:10.1002/mgg3.1827. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34636181/
8. Endo, T, Imanishi, T, Gojobori, T, Inoko, H. . Evolutionary significance of intra-genome duplications on human chromosomes. In Gene, 205, 19-27. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9461376/