Ppp1r13b-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Ppp1r13b-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-06416

品系全称

C57BL/6NCya-Ppp1r13bem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6NCya

品系编号

CKOCMP-21981-Ppp1r13b-B6N-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ppp1r13b-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-06416) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
protein phosphatase 1, regulatory subunit 13B
基因别称
ASPP1,Tp53bp2,Trp53bp2,p85
染色体号
Chr 12 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_011625 | Ensembl: ENSMUST00000054815
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~0.6 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1336199Homozygous null mutants show lymphatic vascular phenotypes with subcutaneous edema detected only during embryogenesis, delayed lymphatic vessel formation, and mispatterned collecting lymphatic vessels.
Ppp1r13b,也称为凋亡刺激蛋白p53-1(ASPP1),是一种重要的p53结合蛋白。它通过刺激p53转录激活特定促凋亡靶基因来增强细胞凋亡。Ppp1r13b在造血干细胞(HSC)中优先表达,并与p53一起维持HSC群体的基因组完整性。因此,ASPP1功能障碍与恶性转化和急性淋巴细胞白血病和淋巴瘤的发展有关,而启动子区域的甲基化则与ASPP1转录减少和表达下调有关。ASPP1在急性髓系白血病(AML)中的作用尚不清楚。

最近的研究表明,Ppp1r13b的调节受损会导致AML的发病机制和原发性治疗耐药性。Ppp1r13b的mRNA表达模式定义了一个独特的预后特征,这与欧洲白血病网络(ELN)风险评分不一致。这些发现具有直接的疗效意义,并提供了使用去甲基化剂恢复ASPP1蛋白水平的策略,以使细胞对促凋亡药物敏感。需要进行前瞻性临床试验,以调查ASPP1(Ppp1r13B)作为风险分层生物标志物和潜在治疗靶点的作用,以恢复对化疗的敏感性[1]。

此外,全转录组关联研究(spTWAS)发现,Ppp1r13b基因的剪接变体与阿尔茨海默病(AD)的易感性相关。这项研究使用了12种脑组织的内含子切除表达遗传预测模型,并分析了111,326例AD病例和677,663例对照者。研究人员发现了343个与AD风险相关的剪接内含子,其中18个剪接内含子属于15个新基因,包括Ppp1r13b。这些发现为AD的发病机制提供了新的见解[2]。

在骨骼肌发育方面,研究发现了Ppp1r13b基因的环状RNA(circPPP1R13B)。circPPP1R13B通过与miR-9-5p结合,负调节miR-9-5p的表达,从而促进胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白3(IGF2BP3)的表达,并进一步激活下游胰岛素样生长因子(IGF)/磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/AKT丝氨酸/苏氨酸激酶(AKT)信号通路。circPPP1R13B的过表达促进了鸡骨骼肌卫星细胞(SMSCs)的增殖和分化,而circPPP1R13B的敲低则抑制了这些过程。这些结果表明,circPPP1R13B通过靶向miR-9-5p和激活IGF/PI3K/AKT信号通路促进了鸡SMSCs的增殖和分化[3]。

在儿童肺功能方面,研究发现Ppp1r13b基因的表达与肺功能受损相关。一项多民族儿童队列的全基因组关联分析发现,Ppp1r13b基因的启动子-增强子相互作用与肺功能相关变异相关。这表明Ppp1r13b基因可能在儿童肺功能受损的遗传机制中发挥作用[4]。

在自闭症谱系障碍(ASD)方面,全基因组测序发现Ppp1r13b基因是潜在的候选基因。研究人员在ASD患者中发现了一个罕见的Ppp1r13b基因外显子变异,该变异可能与ASD的发生有关[5]。

在青光眼方面,系统遗传学研究发现Ppp1r13b基因是调节视网膜神经节细胞(RGC)轴突退化的候选基因之一。研究发现Ppp1r13b基因的表达与RGC轴突坏死数量相关,提示Ppp1r13b基因可能在青光眼的发病机制中发挥作用[6]。

在细胞增殖和凋亡方面,研究发现Ppp1r13b基因是E2F转录因子调控的靶基因之一。Ppp1r13b基因在E2F转录因子过度激活的情况下被激活,并参与细胞凋亡和生长抑制过程[7]。

最后,在一项针对林奇综合征(LS)的研究中,发现Ppp1r13b基因的遗传变异与LS的易感性相关。研究发现Ppp1r13b基因的某些变异与LS的风险增加相关[8]。

综上所述,Ppp1r13b基因在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括AML的发病机制和治疗、AD的易感性、骨骼肌发育、儿童肺功能、ASD的遗传机制、青光眼的发病机制以及细胞增殖和凋亡。这些发现为Ppp1r13b基因在疾病发生和发展中的作用提供了新的见解,并为进一步研究Ppp1r13b基因的生物学功能和治疗应用提供了基础。

参考文献:
1. Schittenhelm, Marcus M, Kaiser, Max, Győrffy, Balázs, Kampa-Schittenhelm, Kerstin M. 2024. Evaluation of apoptosis stimulating protein of TP53-1 (ASPP1/PPP1R13B) to predict therapy resistance and overall survival in acute myeloid leukemia (AML). In Cell death & disease, 15, 25. doi:10.1038/s41419-023-06372-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38195541/
2. Sun, Yanfa, Bae, Ye Eun, Zhu, Jingjing, Wu, Chong, Wu, Lang. 2023. A splicing transcriptome-wide association study identifies novel altered splicing for Alzheimer's disease susceptibility. In Neurobiology of disease, 184, 106209. doi:10.1016/j.nbd.2023.106209. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37354922/
3. Shen, Xiaoxu, Wei, Yuanhang, You, Guishuang, Zhu, Qing, Yin, Huadong. 2021. Circular PPP1R13B RNA Promotes Chicken Skeletal Muscle Satellite Cell Proliferation and Differentiation via Targeting miR-9-5p. In Animals : an open access journal from MDPI, 11, . doi:10.3390/ani11082396. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34438852/
4. Dapas, Matthew, Thompson, Emma E, Wentworth-Sheilds, William, Jackson, Daniel J, Ober, Carole. 2023. Multi-omic association study identifies DNA methylation-mediated genotype and smoking exposure effects on lung function in children living in urban settings. In PLoS genetics, 19, e1010594. doi:10.1371/journal.pgen.1010594. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36638096/
5. Tuncay, Islam Oguz, Parmalee, Nancy L, Khalil, Raida, Scherer, Stephen W, Chahrour, Maria H. 2022. Analysis of recent shared ancestry in a familial cohort identifies coding and noncoding autism spectrum disorder variants. In NPJ genomic medicine, 7, 13. doi:10.1038/s41525-022-00284-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35190550/
6. Stiemke, Andrew B, Sah, Eric, Simpson, Raven N, Williams, Robert W, Jablonski, Monica M. 2020. Systems Genetics of Optic Nerve Axon Necrosis During Glaucoma. In Frontiers in genetics, 11, 31. doi:10.3389/fgene.2020.00031. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32174956/
7. Kitamura, Hodaka, Ozono, Eiko, Iwanaga, Ritsuko, Toh, Hiroyuki, Ohtani, Kiyoshi. 2015. Identification of novel target genes specifically activated by deregulated E2F in human normal fibroblasts. In Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms, 20, 739-57. doi:10.1111/gtc.12268. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26201719/
8. Barbirou, Mouadh, Miller, Amanda A, Mezlini, Amel, Bouhaouala-Zahar, Balkiss, Tonellato, Peter J. 2023. Variant Characterization of a Representative Large Pedigree Suggests "Variant Risk Clusters" Convey Varying Predisposition of Risk to Lynch Syndrome. In Cancers, 15, . doi:10.3390/cancers15164074. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37627102/