Spata13-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Spata13-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-06360

品系全称

C57BL/6JCya-Spata13em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-219140-Spata13-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Spata13-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-06360) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
spermatogenesis associated 13
基因别称
ESTM11,asef2,mFLJ00298
染色体号
Chr 14 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001033272 | Ensembl: ENSMUST00000022566
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 5
敲除长度
~0.6 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:104838Mice homozygous for a knock-out allele are viable, fertile and overtly normal. Behavioral tests indicate that mutant mice exhibit submissive social hierarchy behavior and females exhibit increased voluntary activity in the dark phase of the light-dark cycle.
Spata13基因,全称为Spermatogenesis Associated Protein 13,也被称为ASEF2(Adenomatous polyposis coli-stimulated guanine nucleotide exchange factor 2),是一种重要的基因,与多种生物学过程和疾病相关。Spata13基因编码一个1277个氨基酸残基的蛋白质,该蛋白质定位于细胞核,并部分与核斑点共定位。在细胞进行有丝分裂时,Spata13的I型异构体成为着丝粒复合物的一部分,与两个着丝粒标记物—— polo样激酶1(PLK-1)和中心体相关蛋白E(CENP-E)共定位[4]。

Spata13基因在多种疾病中发挥重要作用。例如,研究发现,Spata13基因的突变是导致原发性闭角型青光眼(PACG)的原因之一。在一个具有变量表达和不完全外显率的七代白人英国家族中,研究人员发现了一个9个碱基的缺失突变,该突变存在于所有患有闭角型疾病的个体中[4]。此外,Spata13基因还与先天性膈疝(CDH)的发生相关。在一项研究中,研究人员通过高分辨率阵列比较基因组杂交(array-CGH)技术,在47个先天性膈疝胎儿和新生儿中发现了一个平均10.2个拷贝数变异(CNVs),其中包括11个潜在的候选基因,其中之一就是Spata13基因[7]。

Spata13基因还与某些癌症的发生和预后相关。例如,在一项关于肾细胞癌(RCC)的研究中,研究人员使用机器学习分析了来自癌症基因组图谱(TCGA)的数据,并验证了60个韩国RCC患者的DNA样本。他们发现并验证了40个与生存相关的基因,其中SPATA13是其中之一。在TCGA-KIRP数据库和韩国-KIRP数据库中,SPATA13基因在总生存期(OS)和无病生存期(DFS)方面都显示出生存特异性[6]。此外,Spata13基因还与膀胱原发性印戒细胞癌(SRCC)的发生相关。在一项研究中,研究人员对一名58岁的男性患者进行了大规模并行全外显子测序(WES),并比较了普通尿路上皮癌(UC)的基因。他们发现,SPATA13是几个驱动基因之一,这些基因可能在SRCC的发病机制中发挥作用[8]。

Spata13基因还与一些药物的药效反应相关。例如,在一项关于吸入性短效β受体激动剂(SABA)的研究中,研究人员使用基于基因的关联测试进行全基因组关联研究。他们发现,SPATA13-AS1与SABA扩张反应显著相关,并且在哮喘患者中得到了验证[3]。

此外,Spata13基因还与一些疾病的预后相关。例如,在一项关于胃癌的研究中,研究人员构建了一个铜死亡相关的六基因签名,其中包括SPATA13基因。该签名能够预测胃癌患者的预后,并可能为胃癌患者制定新的治疗方法[5]。

Spata13基因还与其他一些疾病相关,例如自身免疫性甲状腺疾病(AITD)和乳腺癌。在一项关于AITD的研究中,研究人员使用转录组关联研究(TWAS)方法,发现Spata13基因在AITD病例和对照组之间存在显著差异[1]。在一项关于乳腺癌的研究中,研究人员进行了一项全基因组基因-环境相互作用(GxE)研究,发现SPATA13基因与乳腺癌风险相关[2]。

综上所述,Spata13基因是一种重要的基因,参与调控细胞有丝分裂、基因表达和多种生物学过程。Spata13基因的突变和表达异常与多种疾病的发生和预后相关,包括原发性闭角型青光眼、先天性膈疝、肾细胞癌、膀胱原发性印戒细胞癌、胃癌、自身免疫性甲状腺疾病和乳腺癌等。此外,Spata13基因还与某些药物的药效反应相关。Spata13基因的研究有助于深入理解疾病的发病机制和预测疾病预后,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Liu, Xueying, Miao, Yahu, Liu, Chao, Feng, Qing, Zhang, Qiu. 2023. Identification of multiple novel susceptibility genes associated with autoimmune thyroid disease. In Frontiers in immunology, 14, 1161311. doi:10.3389/fimmu.2023.1161311. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37197658/
2. Middha, Pooja, Wang, Xiaoliang, Behrens, Sabine, Easton, Douglas F, Chang-Claude, Jenny. 2023. A genome-wide gene-environment interaction study of breast cancer risk for women of European ancestry. In Breast cancer research : BCR, 25, 93. doi:10.1186/s13058-023-01691-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37559094/
3. Padhukasahasram, B, Yang, J J, Levin, A M, Lanfear, D E, Williams, L K. 2014. Gene-based association identifies SPATA13-AS1 as a pharmacogenomic predictor of inhaled short-acting beta-agonist response in multiple population groups. In The pharmacogenomics journal, 14, 365-71. doi:10.1038/tpj.2013.49. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24418963/
4. Waseem, Naushin H, Low, Sancy, Shah, Amna Z, Waseem, Ahmad, Foster, Paul J. 2020. Mutations in SPATA13/ASEF2 cause primary angle closure glaucoma. In PLoS genetics, 16, e1008721. doi:10.1371/journal.pgen.1008721. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32339198/
5. Hu, Yongli, Du, Yan, Qiu, Zhisheng, Liang, Tong, Da, Mingxu. 2023. Construction of a Cuproptosis-Related Gene Signature for Predicting Prognosis in Gastric Cancer. In Biochemical genetics, 62, 40-58. doi:10.1007/s10528-023-10406-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37243753/
6. Hwang, Jia, Bang, Seokhwan, Choi, Moon Hyung, Park, Un Sang, Choi, Yeong Jin. 2024. Discovery and Validation of Survival-Specific Genes in Papillary Renal Cell Carcinoma Using a Customized Next-Generation Sequencing Gene Panel. In Cancers, 16, . doi:10.3390/cancers16112006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38893126/
7. Boisson, Marie, Cordier, Anne-Gael, Martinovic, Jelena, Tachdjian, Gérard, Tosca, Lucie. 2022. Copy number variations analysis in a cohort of 47 fetuses and newborns with congenital diaphragmatic hernia. In Prenatal diagnosis, 42, 1627-1635. doi:10.1002/pd.6268. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36403094/
8. Alradhi, Mohammed, Wen, Shuang, Safi, Mohammed, Fan, Bo, Li, Xiancheng. 2022. Molecular genetic and clinical characteristic analysis of primary signet ring cell carcinoma of urinary bladder identified by a novel OR2L5 mutation. In Cancer medicine, 12, 3931-3951. doi:10.1002/cam4.5121. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36779496/