Nrde2-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Nrde2-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-06200

品系全称

C57BL/6JCya-Nrde2em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-217827-Nrde2-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Nrde2-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-06200) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
nrde-2 necessary for RNA interference, domain containing
基因别称
6720454P05Rik
染色体号
Chr 12 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001290303.1 | Ensembl: ENSMUST00000021596
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 5~6
敲除长度
~2797 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
NRDE2,即核RNA干扰缺陷蛋白2,是一种在真核生物中高度保守的蛋白质。最初,NRDE2因其在线虫(Caenorhabditis elegans)中参与核RNA干扰(RNAi)和遗传基因沉默而受到关注。NRDE2在人类中发挥着至关重要的作用,包括RNA剪接、RNA降解和基因组稳定性维持。NRDE2通过直接与U5小核核糖核蛋白(snRNP)、外显子连接复合物和RNA外泌体相互作用,参与RNA剪接过程,特别是对于含有短、GC丰富的内含子和相对较弱的5'和3'剪接位点的pre-mRNA的剪接至关重要。NRDE2缺失的细胞表现出基因组不稳定性和DNA损伤增加,以及中心体成熟和有丝分裂进展的缺陷。NRDE2还与中心粒卫星蛋白CEP131的直接结合和促进其高效剪接,CEP131蛋白表达的减少导致在有丝分裂期间向纺锤极招募关键中心粒蛋白(如γ-微管蛋白和Aurora激酶A)受损[3]。此外,NRDE2与MTR4形成1:1复合物,通过保守的MTR4相互作用结构域(MID)与MTR4结合,MTR4是核外泌体共因子,对核外泌体募集至关重要。NRDE2主要定位于核斑点,它在那里抑制MTR4的募集和RNA降解,从而确保mRNA的稳定性和核输出。NRDE2与MTR4的关键残基相互作用,将MTR4锁定在闭合构象中,并抑制MTR4与外泌体的相互作用,以及与MTR4募集相关的蛋白质,如帽结合复合物(CBC)和ZFC3H1。MID缺失导致小鼠胚胎干细胞自我更新的丧失[2]。

NRDE2在人类肿瘤中也起着重要作用。研究发现,NRDE2缺陷会损害同源重组修复(HR)并使肝细胞癌(HCC)细胞对PARP抑制剂敏感。NRDE2通过与casein激酶2(CK2)的亚基结合,促进CK2全酶的组装和活性。这种NRDE2介导的CK2活性增强会增加MDC1的磷酸化,从而促进HR修复。NRDE2-p.N377I变异体几乎完全消除了这些功能,使HCC细胞对PARP抑制剂敏感,尤其是在与化疗联合使用时[1]。这些发现强调了罕见变异与HCC遗传易感性的相关性,这将对这种恶性肿瘤的精确治疗有所帮助。

Kaposi肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)是一种人类致瘤性核DNA病毒,其基因表达使用宿主细胞的转录和RNA处理机制。KSHV转录物至少受到两种宿主介导的核RNA降解途径的降解,PABPN1-和poly(A)聚合酶α/γ(PAPα/γ)介导的RNA降解(PPD)途径和ARS2依赖性降解途径。KSHV通过调节PPD活性来微调其基因的时间表达,防止其早期转录的晚期转录物过早积累。在晚期转录物适当表达的时间,KSHV晚期转录物通过宿主因子NRDE2的活动逃避PPD。NRDE2以前被报道通过隔离降解因子来保护细胞RNA[4]。

NRDE2在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括RNA剪接、RNA降解、基因组稳定性维持、细胞分化和发育。NRDE2在人类疾病中也发挥着重要作用,包括肝细胞癌和KSHV感染。NRDE2的研究有助于深入理解RNA剪接、RNA降解和基因组稳定性维持的机制,为人类疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Wang, Yahui, Liu, Xinyi, Zuo, Xianbo, Li, Yuanfeng, Zhou, Gangqiao. 2024. NRDE2 deficiency impairs homologous recombination repair and sensitizes hepatocellular carcinoma to PARP inhibitors. In Cell genomics, 4, 100550. doi:10.1016/j.xgen.2024.100550. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38697125/
2. Wang, Jianshu, Chen, Jiyun, Wu, Guifen, Yun, Caihong, Cheng, Hong. 2019. NRDE2 negatively regulates exosome functions by inhibiting MTR4 recruitment and exosome interaction. In Genes & development, 33, 536-549. doi:10.1101/gad.322602.118. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30842217/
3. Jiao, Alan L, Perales, Roberto, Umbreit, Neil T, Kennedy, Scott, Slack, Frank J. 2018. Human nuclear RNAi-defective 2 (NRDE2) is an essential RNA splicing factor. In RNA (New York, N.Y.), 25, 352-363. doi:10.1261/rna.069773.118. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30538148/
4. Ruiz, Julio C, Devlin, Anne M, Kim, Jiwoong, Conrad, Nicholas K. 2020. Kaposi's Sarcoma-Associated Herpesvirus Fine-Tunes the Temporal Expression of Late Genes by Manipulating a Host RNA Quality Control Pathway. In Journal of virology, 94, . doi:10.1128/JVI.00287-20. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32376621/