Ccdc85a-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Ccdc85a-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-06013

品系全称

C57BL/6JCya-Ccdc85aem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-216613-Ccdc85a-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ccdc85a-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-06013) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
coiled-coil domain containing 85A
基因别称
-
染色体号
Chr 11 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001346759.1 | Ensembl: ENSMUST00000146385
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~1455 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
CCDC85A(Coiled-coil domain containing 85A)基因编码一种在多种生物学过程中发挥重要作用的蛋白质。该基因的编码序列位于染色体10上,并且包含一个已知的变异(c.689C > T),该变异与犬类特发性癫痫(IE)的遗传风险相关[1]。在人类中,CCDC85A的功能尚未完全阐明,但研究表明其在肿瘤微环境、生殖细胞功能以及上皮细胞形态发生等方面具有潜在作用。

在肿瘤研究中,CCDC85A被发现是miR-224-3p的靶基因。在胃癌患者的癌相关成纤维细胞(CAF)中,miR-224-3p的表达低于正常成纤维细胞(NF),而CCDC85A的表达则相反。下调CCDC85A的表达使癌细胞对内质网(ER)应激更加敏感,而CCDC85A的恢复可以减轻这种敏感性。这些数据表明,CCDC85A可能在肿瘤细胞抵抗ER应激和顺铂耐药性中发挥作用[2]。

在生殖细胞功能的研究中,CCDC85A基因启动子区域的单核苷酸多态性(SNPs)被发现与猪精子的冷冻耐受性有关。在冷冻耐受性良好的猪中,某些SNPs的等位基因频率与冷冻耐受性较差的猪存在显著差异。这些多态性可能影响基因转录活性,进而影响精子的冷冻耐受性[3]。

在皮肤疾病的研究中,CCDC85A被发现与银屑病(一种慢性炎症性皮肤病)的发生机制有关。通过分析银屑病患者皮肤病变和健康皮肤之间的m6A甲基化差异,发现CCDC85A是15个关键的m6A相关差异表达基因之一。这些基因与细胞和组织发育过程、细胞周期相关项目以及银屑病病理生理过程中的m6A表观遗传变化有关[4]。

在COVID-19与癫痫的关联研究中,通过孟德尔随机化(MR)和功能映射与注释(FUMA)分析,发现COVID-19的遗传易感性可能对癫痫(包括全身性和局灶性癫痫)有因果关系。FUMA分析确定了六个重叠基因,包括CCDC85A,这些基因在COVID-19和癫痫中都存在。这表明COVID-19可能是一个导致癫痫的因素,但没有证据表明癫痫对COVID-19有影响[5]。

在宫颈癌研究中,通过识别和验证NAD+代谢相关基因特征,发现CCDC85A是21个候选NAD+代谢相关基因之一,这些基因可以作为预测宫颈癌预后的独立指标。这些基因在低风险和高风险组之间存在显著差异,表明NAD+代谢相关基因在宫颈癌的预后预测中具有临床价值[6]。

在原发性青光眼的研究中,通过对美国可卡犬进行全基因组关联研究(GWAS),发现CCDC85A是CFA10染色体上与原发性青光眼相关的候选基因之一。虽然该基因的关联没有达到统计学意义,但CCDC85A在人类开放角型青光眼中已被证实具有作用[7]。

在非小细胞肺癌(NSCLC)中,CCDC85A被确定为ALK融合基因的一个新伙伴。研究发现,携带ALK融合基因v3变体的患者与一线克唑替尼治疗的预后较差相关。此外,克唑替尼耐药机制的研究发现,ALK融合基因v3变体更可能获得ALK活化突变[8]。

在细胞形态发生的研究中,CCDC85A被发现与C. elegans胚胎延长过程中的细胞连接和肌动蛋白组织有关。研究表明,CCDC85A在细胞连接的肌动蛋白调节中起作用,而不是细胞极化或连接组装[9]。

在p120-catenin家族的相互作用研究中,CCDC85A被发现与p120-catenin的1A亚型特异性结合,可能在神经管发育和脑积水等发育事件中发挥作用[10]。

综上所述,CCDC85A基因在多种生物学过程中发挥重要作用,包括肿瘤发生、生殖细胞功能、皮肤疾病、神经系统疾病以及细胞形态发生等。研究表明,CCDC85A的变异与犬类特发性癫痫的遗传风险相关,而其在人类中的功能尚未完全阐明。未来的研究需要进一步探索CCDC85A在人类疾病中的作用机制,以便为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Beckers, Evy, Bhatti, Sofie F M, Van Poucke, Mario, Peelman, Luc, Broeckx, Bart J G. 2023. Identification of a Novel Idiopathic Epilepsy Risk Locus and a Variant in the CCDC85A Gene in the Dutch Partridge Dog. In Animals : an open access journal from MDPI, 13, . doi:10.3390/ani13050810. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36899667/
2. Takahashi, So, Takagane, Kurara, Itoh, Go, Iijima, Katsunori, Tanaka, Masamitsu. 2023. CCDC85A is regulated by miR-224-3p and augments cancer cell resistance to endoplasmic reticulum stress. In Frontiers in oncology, 13, 1196546. doi:10.3389/fonc.2023.1196546. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37534255/
3. Brym, Paweł, Wasilewska-Sakowska, Karolina, Mogielnicka-Brzozowska, Marzena, Kondracki, Stanisław, Fraser, Leyland. 2021. Gene promoter polymorphisms in boar spermatozoa differing in freezability. In Theriogenology, 166, 112-123. doi:10.1016/j.theriogenology.2021.02.018. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33735665/
4. Gan, Lu, Wu, Xuejingzi, Song, Jiquan. . Comprehensive Analysis of Crucial m6A-Related Differentially Expressed Genes in Psoriasis. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 29, 311. doi:10.31083/j.fbl2909311. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39344312/
5. You, Mingyao, Yuan, Ping, Li, Liangqian, Peng, Zijun, Xu, Hongbei. 2023. The association between epilepsy and COVID-19: analysis based on Mendelian randomization and FUMA. In Frontiers in neuroscience, 17, 1235822. doi:10.3389/fnins.2023.1235822. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37781245/
6. Chen, Aozheng, Jing, Wanling, Qiu, Jin, Zhang, Runjie. 2022. Prediction of Cervical Cancer Outcome by Identifying and Validating a NAD+ Metabolism-Derived Gene Signature. In Journal of personalized medicine, 12, . doi:10.3390/jpm12122031. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36556252/
7. Gomes, Filipe Espinheira, Casanova, Maria Isabel, Mouttham, Lara, McDonald, Jessica, Hayward, Jessica J. 2022. A genome-wide association study to investigate genetic loci associated with primary glaucoma in American Cocker Spaniels. In American journal of veterinary research, 83, 1-8. doi:10.2460/ajvr.22.07.0106. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36170212/
8. Liu, Chang, Liu, Cuicui, Liao, Jiatao, Shao, Yang, Wang, Jialei. 2022. Genetic correlation of crizotinib efficacy and resistance in ALK- rearranged non-small-cell lung cancer. In Lung cancer (Amsterdam, Netherlands), 171, 18-25. doi:10.1016/j.lungcan.2022.07.011. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35870258/
9. Zilberman, Yuliya, Abrams, Joshua, Anderson, Dorian C, Nance, Jeremy. 2017. Cdc42 regulates junctional actin but not cell polarization in the Caenorhabditis elegans epidermis. In The Journal of cell biology, 216, 3729-3744. doi:10.1083/jcb.201611061. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28903999/
10. Markham, Nicholas O, Doll, Caleb A, Dohn, Michael R, Gamse, Joshua T, Reynolds, Albert B. 2014. DIPA-family coiled-coils bind conserved isoform-specific head domain of p120-catenin family: potential roles in hydrocephalus and heterotopia. In Molecular biology of the cell, 25, 2592-603. doi:10.1091/mbc.E13-08-0492. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25009281/