Syde2-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Syde2-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-05870

品系全称

C57BL/6JCya-Syde2em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-214804-Syde2-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Syde2-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-05870) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans)
基因别称
C430017H16Rik
染色体号
Chr 3 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001166064 | Ensembl: ENSMUST00000039517
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~1.6 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
SYDE2,全称Synapse Defective Protein 1 Homolog 2,编码一个Rho GTPase-activating蛋白,其功能性的致癌意义尚不明确。在高级别透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中,SYDE2的表达水平与患者的总生存期(OS)存在相关性。近期,泛癌分析使用癌症基因组图谱(TCGA)和基因型-组织表达(GTEx)数据表明,SYDE2在ccRCC中可能具有肿瘤抑制的作用。进一步的研究评估了SYDE2表达与ccRCC患者的临床数据和OS之间的相关性。此外,通过表达、关系和生存分析,确定了与SYDE2下调表达相关的miRNAs和lncRNAs。最终,在ccRCC中,鉴定出两种新型的lncRNAs,AL162377.1和AF111167.2,它们通过靶向miR-21-5p轴,在SYDE2上游非编码RNA(ncRNA)相关通路中发挥作用。SYDE2的表达水平高度依赖于肿瘤免疫细胞浸润和免疫检查点表达。这些数据表明,lncRNAs/miRNAs介导的SYDE2下调与肿瘤免疫浸润相关,为ccRCC的预后提供了新的见解[1]。

miR-503-5p在糖尿病大鼠的性功能障碍中发挥着重要作用。研究发现,在链脲佐菌素(STZ)诱导的糖尿病大鼠勃起功能障碍(ED)模型中,miR-503-5p的表达降低,而SYDE2的表达升高。通过注射miR-503-5p模拟物或si/oe-SYDE2,可以改变ED大鼠中的miR-503-5p和SYDE2的表达。证实了miR-503-5p与SYDE2之间存在靶向联系。研究发现,提高miR-503-5p的表达或沉默SYDE2可以增强ED大鼠的阴茎勃起率、ICP/MAP值、毛细血管密度和cGMP水平,但降低AGEs水平和阴茎平滑肌细胞凋亡率。同时,增强SYDE2的表达可以逆转提高miR-503-5p表达对ED大鼠阴茎勃起的影响。结果表明,miR-503-5p通过靶向SYDE2,保护STZ诱导的糖尿病大鼠性功能障碍[2]。

在智力障碍(ID)的研究中,基因组工具(如分子核型分析、多基因面板和全外显子测序)被用于诊断ID患者,并与标准临床评估进行了比较。研究发现,标准临床评估仅能诊断出16%的ID病例,而基因组方法则揭示了58%的ID病例的可能诊断。此外,全外显子测序还发现了32个基因中的新发和隐性变异,包括SYDE2,这些基因被作为ID的潜在候选基因[3]。

甲状腺激素(T3)和生长激素(GH)是鸟类和哺乳动物生长发育的重要调节因子。研究发现,甲状腺状态和/或GH注射可以改变雏鸡的肝基因表达。T3+GH处理组中,34个基因的表达发生了改变,包括SYDE2。这表明T3+GH协同作用可以减少体脂,可能与通过改变Ras超家族分子开关的活性来调节激素信号有关[4]。

在胎儿的生长受限研究中,发现SYDE1与胎儿的生长受限相关,SYDE1调节胎盘细胞的迁移和侵袭。研究发现,在Syde1基因敲除的小鼠中,Syde2的表达升高,这可能是对Syde1功能缺失的补偿。临床研究中,还检测到与正常妊娠年龄匹配的早产和足月IUGR胎盘中的SYDE1表达降低。这表明SYDE1和SYDE2在调节胎盘发育过程中的绒毛细胞迁移和侵袭方面发挥着重要作用[5]。

综上所述,SYDE2作为一种Rho GTPase-activating蛋白,在多种生物学过程中发挥着重要作用。SYDE2的表达水平与ccRCC患者的预后相关,并且受到miRNAs和lncRNAs的调控。SYDE2还在糖尿病大鼠的性功能障碍中发挥作用,并且与智力障碍和胎儿的生长受限相关。这些研究结果表明,SYDE2在多种疾病和生物学过程中发挥着重要作用,为相关疾病的治疗和预防提供了新的思路和策略。

参考文献:
1. Cui, Yuanshan, Wu, Jitao, Zhou, Zhongbao, Ma, Jian, Dong, Liying. 2022. Two novel lncRNAs AF111167.2 and AL162377.1 targeting miR-21-5p mediated down expression of SYDE2 correlates with poor prognosis and tumor immune infiltration of ccRCC. In Heliyon, 8, e11079. doi:10.1016/j.heliyon.2022.e11079. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36311369/
2. Li, Gangqin, Jiang, Lin, Bai, Kuan, Tan, Guangxing. 2024. MicroRNA-503-5p protects streptozotocin-induced erectile dysfunction in diabetic rats by downregulating SYDE2. In Cellular and molecular biology (Noisy-le-Grand, France), 70, 48-53. doi:10.14715/cmb/2024.70.3.7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38650154/
3. Anazi, S, Maddirevula, S, Faqeih, E, Shaheen, R, Alkuraya, F S. 2016. Clinical genomics expands the morbid genome of intellectual disability and offers a high diagnostic yield. In Molecular psychiatry, 22, 615-624. doi:10.1038/mp.2016.113. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27431290/
4. Wang, X, Carré, W, Saxton, A M, Cogburn, L A. . Manipulation of thyroid status and/or GH injection alters hepatic gene expression in the juvenile chicken. In Cytogenetic and genome research, 117, 174-88. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17675858/
5. Lo, Hsiao-Fan, Tsai, Ching-Yen, Chen, Chie-Pein, Cheong, Mei-Leng, Chen, Hungwen. 2016. Association of dysfunctional synapse defective 1 (SYDE1) with restricted fetal growth - SYDE1 regulates placental cell migration and invasion. In The Journal of pathology, 241, 324-336. doi:10.1002/path.4835. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27917469/