TAPBP(TAP-associated protein)基因编码的蛋白质是TAP(transporter associated with antigen processing)复合物的一部分,TAP复合物负责将内源性抗原从细胞质转运到内质网中,以便与MHC I类分子结合并呈现给CD8+ T细胞,从而启动细胞介导的免疫反应。TAPBP基因位于人类染色体6p21.3,与MHC I类基因簇相邻,这一区域在免疫系统中扮演着关键角色。TAPBP蛋白通过其C端与TAP复合物的其他成员TAP1和TAP2相互作用,而其N端则锚定MHC I类分子,确保它们在内质网中正确折叠和组装。
在遗传学研究中,TAPBP基因的变异被发现与多种免疫相关疾病和癌症的易感性有关。例如,研究发现TAPBP基因的特定单核苷酸多态性(SNPs)与慢性鼻窦炎的严重程度有关,这可能通过影响MHC I类分子的表达和功能来发挥作用[2]。此外,TAPBP基因的突变或缺陷可能导致MHC I类分子表达异常,进而影响细胞对肿瘤的免疫监视,这可能增加个体患某些癌症的风险,如宫颈癌[1]。在宫颈癌患者中,TAPBP基因的某些遗传变异被发现与m6A修饰水平升高有关,而m6A修饰是一种RNA上的表观遗传标记,可以影响RNA的稳定性和功能。这些变异可能通过影响TAPBP的表达或功能,进而影响MHC I类分子对肿瘤相关抗原的呈递,最终影响宫颈癌的发生和发展[1]。
在甲状腺癌的研究中,TAPBP基因被发现与患者的预后相关。通过分析自然杀伤(NK)细胞相关基因的表达,研究者构建了一个包含TAPBP基因的风险签名,用于预测甲状腺癌患者的生存率。高风险组的患者整体生存率较低,这表明TAPBP基因可能在甲状腺癌的免疫逃避机制中发挥作用[3]。
此外,TAPBP基因的表达水平还与某些癌症的复发风险相关。例如,在非小细胞肺癌的研究中,研究者发现正常肺组织中TAPBP基因的表达水平与患者的无复发生存期(RFS)相关,表达水平较高的患者预后较好[4]。这表明TAPBP基因可能参与了调节肺癌患者的免疫系统反应,从而影响疾病的进展和预后。
在免疫系统的其他方面,TAPBP基因的表达和功能也与一些自身免疫疾病有关。例如,在类风湿性关节炎(RA)的研究中,TAPBP基因被发现与疾病的发生和进展相关。通过对全基因组关联研究(GWAS)和基因表达谱的分析,研究者发现TAPBP基因与其他MHC I类基因一起构成了RA相关的基因模块,这些基因可能通过影响抗原呈递和免疫反应参与RA的发病机制[5]。
综上所述,TAPBP基因在免疫系统中发挥着重要作用,其表达和功能与多种免疫相关疾病和癌症的发生、发展和预后密切相关。通过深入研究TAPBP基因的生物学功能及其在疾病中的作用机制,可以为我们提供新的治疗策略和预防措施。
参考文献:
1. Hu, Jing, Wang, Shizhi, Zhang, Xing, Lu, Yiran, Jin, Hua. 2024. A genetic variant in the TAPBP gene enhances cervical cancer susceptibility by increasing m6A modification. In Archives of toxicology, 98, 3425-3438. doi:10.1007/s00204-024-03820-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38992170/
2. Alromaih, Saud, Mfuna-Endam, Leandra, Bosse, Yohan, Filali-Mouhim, Abdelali, Desrosiers, Martin. 2013. CD8A gene polymorphisms predict severity factors in chronic rhinosinusitis. In International forum of allergy & rhinology, 3, 605-11. doi:10.1002/alr.21174. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23640800/
3. Jin, Zhen, Han, Yadong, Zhang, Jiaxin, Li, Ran, Liu, Zhao. . Prognosis and therapy in thyroid cancer by gene signatures related to natural killer cells. In The journal of gene medicine, 26, e3657. doi:10.1002/jgm.3657. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38282150/
4. Peters, Brandilyn A, Pass, Harvey I, Burk, Robert D, Hayes, Richard B, Ahn, Jiyoung. 2022. The lung microbiome, peripheral gene expression, and recurrence-free survival after resection of stage II non-small cell lung cancer. In Genome medicine, 14, 121. doi:10.1186/s13073-022-01126-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36303210/
5. Xiao, X, Hao, J, Wen, Y, Guo, X, Zhang, F. . Genome-wide association studies and gene expression profiles of rheumatoid arthritis: An analysis. In Bone & joint research, 5, 314-9. doi:10.1302/2046-3758.57.2000502. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27445359/