BEND7,也称为BEND domain-containing family member 7,是一种在人类基因组中编码的蛋白质。该基因的详细功能和表达模式在多个生物学过程中具有重要作用,包括免疫调节、皮肤色素沉着和碳水化合物代谢。
在免疫调节方面,BEND7已被发现与败血症的发生发展密切相关。一项研究通过整合全基因组关联研究(GWAS)和表达数量性状位点(eQTL)数据,利用基于汇总数据的孟德尔随机化方法,鉴定了与败血症相关的基因。这些基因与来自基因表达综合数据库(GEO)的预后基因集进行交集,并在独立数据集中进行了验证。此外,研究还进行了全面的单细胞RNA测序分析,包括细胞聚类、差异表达分析、细胞间通讯图谱和假时间轨迹分析,以探索这些基因在败血症微环境中的作用。研究结果显示,BEND7是一个主要在血小板中表达的基因,通过细胞间粘附分子信号通路与免疫细胞,特别是单核细胞和中性粒细胞,有强烈的相互作用。功能富集分析表明,BEND7阳性的血小板在免疫调节和血小板活化中发挥作用。因此,BEND7被认为是一个与败血症相关的免疫调节基因,为败血症的治疗提供了新的治疗靶点[1]。
在皮肤色素沉着方面,BEND7与皮肤颜色相关。一项研究在非洲混血人群中进行了全基因组关联研究,分析了14百万个遗传变异,以揭示影响皮肤颜色的基因。研究发现,BEND7和PRPF18之间的基因间区域与皮肤颜色相关,其中该区域中最显著的变异在非洲血统的人群中很常见,而在欧洲人或美洲原住民中则不常见。这表明BEND7可能参与了皮肤颜色的调节[2]。
在碳水化合物代谢方面,BEND7与血糖水平相关。一项研究在印度人群中进行了全面的基因组研究,分析了4927名无糖尿病的印度人的遗传结构。研究发现,BEND7基因中的遗传变异与血糖水平相关,并在肠道组织中作为表达数量性状位点(eQTLs)发挥作用。此外,这些肠道eQTLs在印度人的外周血样本中也作为甲基化数量性状位点(meth-QTLs)存在,阐明了它们调节目标基因表达的潜在机制。研究结果表明,BEND7可能参与了印度人群的碳水化合物代谢[3]。
综上所述,BEND7是一个与免疫调节、皮肤色素沉着和碳水化合物代谢相关的基因。在败血症中,BEND7阳性的血小板在免疫调节和血小板活化中发挥作用,可能成为败血症治疗的新靶点。此外,BEND7还与皮肤颜色和血糖水平相关,可能参与了皮肤颜色的调节和印度人群的碳水化合物代谢。未来的研究需要进一步探讨BEND7在这些生物学过程中的具体作用机制,以及其作为治疗靶点的潜力。
[1] Ren, Chao, Liu, Yuyang, Ding, Zhangna, Feng, Hui, Liu, Qi. 2024. Exploring the Potential of BEND7 as an Immunomodulatory Biomarker in Sepsis through Integrative Genomic and Transcriptomic Analysis. In Shock (Augusta, Ga.), , . doi:10.1097/SHK.0000000000002529.
[2] Hernandez-Pacheco, Natalia, Flores, Carlos, Alonso, Santos, Burchard, Esteban G, Pino-Yanes, Maria. 2017. Identification of a novel locus associated with skin colour in African-admixed populations. In Scientific reports, 7, 44548. doi:10.1038/srep44548.
[3] Nair, Janaki M, Bandesh, Khushdeep, Giri, Anil K, Tandon, Nikhil, Bharadwaj, Dwaipayan. 2024. Uncovering novel regulatory variants in carbohydrate metabolism: a comprehensive multi-omics study of glycemic traits in the Indian population. In Molecular genetics and genomics : MGG, 299, 85. doi:10.1007/s00438-024-02176-9.
参考文献:
1. Ren, Chao, Liu, Yuyang, Ding, Zhangna, Feng, Hui, Liu, Qi. 2024. Exploring the Potential of BEND7 as an Immunomodulatory Biomarker in Sepsis through Integrative Genomic and Transcriptomic Analysis. In Shock (Augusta, Ga.), , . doi:10.1097/SHK.0000000000002529. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39617402/
2. Hernandez-Pacheco, Natalia, Flores, Carlos, Alonso, Santos, Burchard, Esteban G, Pino-Yanes, Maria. 2017. Identification of a novel locus associated with skin colour in African-admixed populations. In Scientific reports, 7, 44548. doi:10.1038/srep44548. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28300201/
3. Nair, Janaki M, Bandesh, Khushdeep, Giri, Anil K, Tandon, Nikhil, Bharadwaj, Dwaipayan. 2024. Uncovering novel regulatory variants in carbohydrate metabolism: a comprehensive multi-omics study of glycemic traits in the Indian population. In Molecular genetics and genomics : MGG, 299, 85. doi:10.1007/s00438-024-02176-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39230791/