智鼠故事 
C57BL/6JCya-Urb1em1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称：
Urb1-flox
产品编号：
S-CKO-05281
品系背景：
C57BL/6JCya
* 使用本品系发表的文献需注明：Urb1-flox mice (Strain S-CKO-05281) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
只
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Urb1em1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-207932-Urb1-B6J-VA
产品编号
S-CKO-05281
基因名
Urb1
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
mKIAA0539；4921511H13Rik；5730405K23Rik
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
MGI:2146468 Mice homozygous for a null allele exhibit absent blastocoele, arrest at the morula stage at E4.5, and die.
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
在研小鼠
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Urb1位于小鼠的16号染色体，采用基因编辑技术，通过高通量电转受精卵方式，获得Urb1基因条件性敲除小鼠，性成熟后取精子冻存。
Urb1-flox小鼠模型是由赛业生物（Cyagen）采用基因编辑技术构建的条件性敲除小鼠。Urb1基因位于小鼠16号染色体上，由39个外显子组成，其中ATG起始密码子在1号外显子，TGA终止密码子在39号外显子。条件性敲除区域（cKO区域）位于2号至4号外显子，包含425个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Urb1基因功能的丧失。
Urb1-flox小鼠模型的构建过程包括将核糖核蛋白（RNP）和靶向载体共同注入受精卵。随后，对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。此外，2号至4号外显子的敲除会导致基因的移码，覆盖了6.22%的编码区域。5'-loxP位点插入的1号内含子大小为4661个碱基对，3'-loxP位点插入的4号内含子大小为3210个碱基对。有效的cKO区域大小约为2.7千碱基对。
该模型可用于研究Urb1基因在小鼠体内的功能。由于生物过程的复杂性，现有技术水平的限制，loxP插入对基因转录、RNA剪接和蛋白质翻译的影响无法完全预测。
基因研究概述
URB1（也称为KIAA0539）是一个编码核糖体组装因子的基因。核糖体是细胞中负责蛋白质合成的分子机器，而URB1在核糖体的生物合成过程中发挥着关键作用。核糖体生物合成是一个复杂的、多步骤的过程，涉及多个蛋白质和RNA分子的相互作用。URB1通过与其他蛋白质和RNA分子的相互作用，参与核糖体的组装，确保细胞能够有效地合成蛋白质，这是细胞进行正常生物学功能的基础。
URB1的表达与多种疾病的发生和发展相关，尤其是在癌症中。例如，在结直肠癌（CRC）中，URB1的表达上调，并且与肿瘤的发生和发展密切相关[2]。URB1通过转录激活转录因子4（ATF4）和X-盒结合蛋白1（XBP1）的表达，促进CRC细胞的增殖和生长。此外，URB1还与mTORC1信号通路相关，mTORC1是细胞生长和代谢的关键调节因子[4]。RAPTOR是mTORC1的一个组成部分，通过激活mTORC1信号通路，RAPTOR上调URB1的表达，进而促进CRC细胞的增殖和迁移。
除了在CRC中的作用外，URB1还在其他癌症中发挥作用。例如，在肝细胞癌（HCC）中，URB1的表达与索拉非尼耐药性相关[1]。索拉非尼是一种用于治疗晚期HCC的分子靶向药物，而URB1的表达上调与索拉非尼诱导的铁死亡抑制相关。铁死亡是一种程序性细胞死亡形式，在HCC的治疗中具有重要意义。URB1的表达上调通过诱导铁蛋白相分离和减少细胞内游离铁含量，从而抑制索拉非尼诱导的铁死亡。此外，URB1的表达上调还与HCC患者的预后不良相关。
除了在癌症中的作用外，URB1还与其他疾病相关。例如，在非功能性垂体腺瘤（NFPAs）中，URB1的表达上调[3]。NFPAs是一种常见的垂体肿瘤，而URB1的表达上调与NFPAs的发生和发展密切相关。此外，URB1的突变还与猪的胚胎致死性相关[5]。URB1的突变导致核糖体组装受损，进而影响细胞的正常生长和发育。
此外，URB1的表达还与其他生物学过程相关。例如，在动脉粥样硬化斑块和缺血性卒中（IS）中，URB1的表达上调[6]。动脉粥样硬化斑块和IS是心血管疾病的重要类型，而URB1的表达上调与这些疾病的发生和发展密切相关。URB1可能通过影响信号通路和免疫细胞的功能，参与动脉粥样硬化斑块和IS的进展。
综上所述，URB1是一种编码核糖体组装因子的基因，在核糖体生物合成中发挥着关键作用。URB1的表达与多种疾病的发生和发展相关，包括CRC、HCC、NFPAs、猪的胚胎致死性、动脉粥样硬化斑块和IS。URB1通过影响细胞生长、代谢、信号通路和免疫细胞的功能，参与这些疾病的发生和发展。URB1的研究有助于深入理解核糖体组装因子的生物学功能和疾病发生机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献：
1. Gao, Yuan, Tong, Man, Wong, Tin-Lok, Li, Meng, Ma, Stephanie. 2023. Long Noncoding RNA URB1-Antisense RNA 1 (AS1) Suppresses Sorafenib-Induced Ferroptosis in Hepatocellular Carcinoma by Driving Ferritin Phase Separation. In ACS nano, 17, 22240-22258. doi:10.1021/acsnano.3c01199. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37966480/
2. Wang, Tao, Li, Lai-Yuan, Chen, Yi-Feng, Hao, Xiang-Yong, Guo, Tian-Kang. 2020. Ribosome assembly factor URB1 contributes to colorectal cancer proliferation through transcriptional activation of ATF4. In Cancer science, 112, 101-116. doi:10.1111/cas.14643. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32888357/
3. Taheri, Mohammad, Safarzadeh, Arash, Bahranian, Arefe, Ghafouri-Fard, Soudeh, Sharifi, Guive. 2023. Upregulation of MAPKAPK5-AS1, PXN-AS1 and URB1-AS1 lncRNAs in non-functioning pituitary adenoma. In Journal of cellular and molecular medicine, 27, 1550-1556. doi:10.1111/jcmm.17763. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37154079/
4. Wang, Tao, Zhang, Wei-Sheng, Wang, Zheng-Xia, Hao, Xiang-Yong, Guo, Tian-Kang. 2019. RAPTOR promotes colorectal cancer proliferation by inducing mTORC1 and upregulating ribosome assembly factor URB1. In Cancer medicine, 9, 1529-1543. doi:10.1002/cam4.2810. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31886628/
5. Derks, Martijn F L, Gjuvsland, Arne B, Bosse, Mirte, Groenen, Martien A M, Megens, Hendrik-Jan. 2019. Loss of function mutations in essential genes cause embryonic lethality in pigs. In PLoS genetics, 15, e1008055. doi:10.1371/journal.pgen.1008055. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30875370/
6. Zhang, Xianjing, Han, Tingting, Xu, Tengxiao, Wang, Huimin, Ma, Haijun. 2023. Uncovering Candidate mRNAs, Signaling Pathways and Immune Cells in Atherosclerotic Plaque and Ischemic Stroke. In International journal of general medicine, 16, 2999-3012. doi:10.2147/IJGM.S418913. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37465552/
