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C57BL/6JCya-Sox13em1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称:
Sox13-flox
产品编号:
S-CKO-05180
品系背景:
C57BL/6JCya
小鼠资源库
* 使用本品系发表的文献需注明:Sox13-flox mice (Strain S-CKO-05180) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Sox13em1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-20668-Sox13-B6J-VA
产品编号
S-CKO-05180
基因名
Sox13
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
Sox-13
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
MGI:98361 Mice homozygous for a knock-out allele display impaired development of gamma-delta T cells and severe postnatal growth defects.
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
在研小鼠
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Sox13位于小鼠的1号染色体,采用基因编辑技术,通过高通量电转受精卵方式,获得Sox13基因条件性敲除小鼠,性成熟后取精子冻存。
Sox13-flox小鼠模型是由赛业生物(Cyagen)采用基因编辑技术构建的条件性敲除小鼠。Sox13基因位于小鼠1号染色体上,由14个外显子组成,其中ATG起始密码子在2号外显子,TGA终止密码子在14号外显子。条件性敲除区域(cKO区域)位于3号外显子到4号外显子之间,包含199个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Sox13基因功能的丧失。 Sox13-flox小鼠模型的构建过程包括将基因编辑技术生成的靶向载体和核糖核蛋白(RNP)共同注入受精卵中。经过胚胎发育和筛选,最终获得携带条件性敲除等位基因的小鼠。随后,对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。 携带条件性敲除等位基因的小鼠表现出γ-δ T细胞发育受损和严重的出生后生长缺陷。敲除3号外显子到4号外显子区域导致基因移码,覆盖了编码区域的10.82%。第2号内含子用于5'-loxP位点的插入,大小为2232个碱基对;第4号内含子用于3'-loxP位点的插入,大小为1062个碱基对。有效的条件性敲除区域大小约为0.9千碱基对。 该策略是基于现有数据库中的遗传信息设计的。由于生物过程的复杂性,现有技术水平下无法预测loxP插入对基因转录、RNA剪接和蛋白质翻译的影响。Sox13-flox小鼠模型可用于研究Sox13基因在小鼠体内的功能。
基因研究概述
Sox13,也称为SRY相关高移动性组框13,是SRY相关高移动性组框(Sox)转录因子家族的成员之一。Sox家族是一类含有高移动性组(HMG)盒结构的转录因子,其成员在胚胎发育、细胞命运决定和癌症发生中发挥着重要作用。Sox13作为Sox家族D组成员,与Sox5、Sox6和Sox23具有相似的结构特征,包括一个保守的HMG DNA结合域和一个富含亮氨酸拉链/谷氨酰胺富集的二聚化结构域。
Sox13在多种组织中表达,包括小鼠的精原细胞、胰岛细胞和动脉壁。在人基因组中,Sox13基因定位于染色体1q31.3-32.1,该区域与1型糖尿病易感性和家族性扩张型心肌病相关。Sox13基因跨越超过15.5kb的基因组DNA,包含14个外显子,其内含子插入编码HMG DNA结合域和亮氨酸拉链/谷氨酰胺富集二聚化结构域的区域。与小鼠Sox13基因的比较表明,Sox13蛋白可能存在长型和短型,这些形式可能通过在胚胎发生不同阶段的差异剪接产生。人类Sox13与小鼠、非洲爪蟾和鲤鱼直系同源基因之间的高度序列保守性表明,Sox13在脊椎动物中具有保守的功能[7]。
Sox13在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括早期毛囊发育、癌症发生和免疫调节。研究发现,Sox13在早期毛囊发育过程中发挥着标记作用,尽管它对于表皮和附属结构的发育并非必需[5]。在癌症发生中,Sox13被证明在多种癌症中发挥着重要作用,包括乳腺癌、结直肠癌和肝细胞癌。在乳腺癌中,Sox13的高表达与不良预后相关,并与肿瘤微环境和免疫细胞浸润相关[2]。在结直肠癌中,Sox13通过转录激活SNAI2和c-MET促进肿瘤的迁移、侵袭和转移[4]。在肝细胞癌中,Sox13通过转录激活Twist1促进肿瘤的侵袭、迁移和上皮-间质转化(EMT),并与Twist1在mRNA和蛋白水平上呈正相关[6]。此外,Sox13还与肿瘤干性相关,抑制Sox13的表达可以降低肝细胞癌细胞的干性相关基因表达,并增强对药物治疗的敏感性[8]。
除了在癌症发生中的重要作用外,Sox13还在免疫调节中发挥作用。研究发现,Sox13在Klinefelter综合征(KS)患者的周围血单核细胞中显著下调,这可能与KS患者的精子细胞丢失有关[1]。此外,肠道微生物群产生的短链脂肪酸(SCFAs)可以通过抑制组蛋白去乙酰化酶活性,增加Sox13在位点K30的乙酰化,从而降低Sox13的表达,进而调节肝细胞癌中的免疫浸润[3]。
综上所述,Sox13作为一种重要的Sox家族转录因子,在多种生物学过程中发挥着重要作用。它在早期毛囊发育、癌症发生和免疫调节中发挥着重要作用,并可能成为癌症治疗和免疫治疗的新靶点。
参考文献:
1. Cannarella, Rossella, Salemi, Michele, Condorelli, Rosita A, La Vignera, Sandro, Calogero, Aldo E. . SOX13 gene downregulation in peripheral blood mononuclear cells of patients with Klinefelter syndrome. In Asian journal of andrology, 23, 157-162. doi:10.4103/aja.aja_37_20. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33109779/
2. Gao, Ting, Jiang, Baohong, Zhou, Yu, Xie, Liming, Li, Yuehua. 2024. SOX13 is a novel prognostic biomarker and associates with immune infiltration in breast cancer. In Frontiers in immunology, 15, 1369892. doi:10.3389/fimmu.2024.1369892. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38707897/
3. Hu, Chupeng, Xu, Bingqing, Wang, Xiaodong, Feng, Dongju, Chen, Yun. 2022. Gut microbiota-derived short-chain fatty acids regulate group 3 innate lymphoid cells in HCC. In Hepatology (Baltimore, Md.), 77, 48-64. doi:10.1002/hep.32449. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35262957/
4. Du, Feng, Li, Xiaowei, Feng, Weibo, Wu, Kaichun, Xia, Limin. 2020. SOX13 promotes colorectal cancer metastasis by transactivating SNAI2 and c-MET. In Oncogene, 39, 3522-3540. doi:10.1038/s41388-020-1233-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32111984/
5. Noto, Mai, Noguchi, Natsuko, Ishimura, Akihiko, Manabe, Motomu, Osada, Shin-Ichi. 2019. Sox13 is a novel early marker for hair follicle development. In Biochemical and biophysical research communications, 509, 862-868. doi:10.1016/j.bbrc.2018.12.163. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30638933/
6. Feng, Min, Fang, Fei, Fang, Ting, Wang, Xiaomin, Zhao, Wenxiu. 2020. Sox13 promotes hepatocellular carcinoma metastasis by transcriptionally activating Twist1. In Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology, 100, 1400-1410. doi:10.1038/s41374-020-0445-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32461589/
7. Argentaro, A, Olsson, J, Critcher, R, McDowall, S G, Harley, V R. . Genomic characterisation and fine mapping of the human SOX13 gene. In Gene, 250, 181-9. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/10854791/
8. Jiao, Hui, Fang, Fei, Fang, Ting, Yin, Zhenyu, Zhao, Wenxiu. 2021. SOX13 regulates cancer stem-like properties and tumorigenicity in hepatocellular carcinoma cells. In American journal of cancer research, 11, 760-772. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33791152/