Rbmxl1,也称为RBMX样1,是一种RNA结合蛋白(RBP),在细胞的转录后调控中发挥着重要作用。RBP是一类能够与RNA分子结合并影响其稳定性、转运、剪接和翻译的蛋白质。Rbmxl1作为RBP家族的一员,其功能与细胞分化、发育、代谢和疾病发生密切相关。
在急性髓系白血病(AML)中,Rbmxl1的表达水平显著高于健康个体。Rbmxl1与RBMX共同作用,通过直接结合mRNA,影响多个基因的转录,包括CBX5(HP1α)。CBX5是一种组蛋白变体,参与维持染色质状态和基因表达的调控。Rbmxl1通过调节CBX5的转录,进而控制染色质状态,影响白血病细胞的生存和生长[1]。
在骨肉瘤(OS)中,Rbmxl1与能量代谢相关。通过共表达网络分析,研究者发现Rbmxl1与能量代谢相关的基因共表达,并通过构建七基因签名,用于预测OS的进展和预后。Rbmxl1的上调表达与OS风险降低相关,提示Rbmxl1可能在OS的发生和发展中发挥保护作用[2]。
在长寿研究中,Rbmxl1与极端老化相关。对百岁老人的全外显子测序发现,Rbmxl1是三个与极端老化相关的基因之一。这表明Rbmxl1可能在长寿和神经退行性疾病的风险中发挥重要作用[3]。
在染色质研究中,Rbmxl1与异染色质的形成和维持有关。研究者发现,Rbmxl1能够与H3K9me3和H3K27me3结合,阻碍异染色质区域的基因激活,维持细胞身份和抑制细胞重编程[4]。
在肺腺癌(LUAD)中,Rbmxl1通过A-to-I RNA编辑产生突变,影响肿瘤的发生和发展。研究者发现,Rbmxl1的I40M突变与LUAD患者的肿瘤进展和不良预后相关。Rbmxl1的突变通过激活RHOA-GTP/p-ROCK1/2信号通路,促进肿瘤细胞的增殖和迁移[5]。
在多发性骨融合综合征(SYNS4)中,Rbmxl1的表达降低。研究者发现,GDF6基因的敲低导致Rbmxl1的表达降低,与SYNS4的发生和发展相关。Rbmxl1的降低可能通过影响骨骼关节的发育和抑制异常骨化和融合,导致SYNS4的发生[6]。
在胃癌中,Rbmxl1的表达与miR-421的表达相关。研究者发现,miR-421在胃癌组织中高表达,抑制miR-421的表达可以上调Rbmxl1和CBX7的表达,抑制胃癌细胞的生长[7]。
在造血干细胞衰老研究中,Rbmxl1的表达降低。研究者发现,Rbmxl1在衰老的造血干细胞中表达降低,可能通过影响mRNA剪接,导致造血干细胞的衰老[8]。
在黑色素瘤细胞系中,Rbmxl1发生突变。研究者发现,黑色素瘤细胞系中存在Rbmxl1的突变,这些突变可能与黑色素瘤的发生和发展相关[9]。
综上所述,Rbmxl1是一种重要的RNA结合蛋白,在细胞的转录后调控和染色质调控中发挥重要作用。Rbmxl1的表达和功能与多种疾病的发生和发展相关,包括白血病、骨肉瘤、神经退行性疾病、肺腺癌、多发性骨融合综合征、胃癌和黑色素瘤。Rbmxl1的研究有助于深入理解RNA结合蛋白的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Prieto, Camila, Nguyen, Diu T T, Liu, Zhaoqi, Rabadan, Raul, Kharas, Michael G. 2021. Transcriptional control of CBX5 by the RNA binding proteins RBMX and RBMXL1 maintains chromatin state in myeloid leukemia. In Nature cancer, 2, 741-757. doi:10.1038/s43018-021-00220-w. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34458856/
2. Zhu, Naiqiang, Hou, Jingyi, Ma, Guiyun, Zhao, Chengliang, Chen, Bin. 2020. Co-expression network analysis identifies a gene signature as a predictive biomarker for energy metabolism in osteosarcoma. In Cancer cell international, 20, 259. doi:10.1186/s12935-020-01352-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32581649/
3. Nygaard, Haakon B, Erson-Omay, E Zeynep, Wu, Xiujuan, Vilariño-Güell, Carles, Strittmatter, Stephen M. . Whole-Exome Sequencing of an Exceptional Longevity Cohort. In The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences, 74, 1386-1390. doi:10.1093/gerona/gly098. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29750252/
4. Becker, Justin S, McCarthy, Ryan L, Sidoli, Simone, Garcia, Benjamin A, Zaret, Kenneth S. . Genomic and Proteomic Resolution of Heterochromatin and Its Restriction of Alternate Fate Genes. In Molecular cell, 68, 1023-1037.e15. doi:10.1016/j.molcel.2017.11.030. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29272703/
5. Chen, Kuan-Ju, Huang, Jing-Hsiang, Shih, Jou-Ho, Hsiao, Chen-Hao, Jou, Yuh-Shan. 2022. Somatic A-to-I RNA-edited RHOA isoform 2 specific-R176G mutation promotes tumor progression in lung adenocarcinoma. In Molecular carcinogenesis, 62, 348-359. doi:10.1002/mc.23490. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36453714/
6. Clarke, Raymond A, Fang, Zhiming, Murrell, Dedee, Sheriff, Tabrez, Eapen, Valsamma. 2021. GDF6 Knockdown in a Family with Multiple Synostosis Syndrome and Speech Impairment. In Genes, 12, . doi:10.3390/genes12091354. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34573339/
7. Jiang, Zhen, Guo, Junming, Xiao, Bingxiu, Li, Dong, Zhang, Yuanyuan. 2009. Increased expression of miR-421 in human gastric carcinoma and its clinical association. In Journal of gastroenterology, 45, 17-23. doi:10.1007/s00535-009-0135-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19802518/
8. Lian, Xiaolan, Zhao, Mingyi, Xia, Ji, He, Yulei, Zhang, Lina. 2020. Isobaric tags for relative and absolute quantitation (iTRAQ)-based proteomic analysis of mRNA splicing relevant proteins in aging HSPCs. In Aging clinical and experimental research, 33, 3123-3134. doi:10.1007/s40520-020-01509-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32141009/
9. Cifola, Ingrid, Pietrelli, Alessandro, Consolandi, Clarissa, De Bellis, Gianluca, Battaglia, Cristina. 2013. Comprehensive genomic characterization of cutaneous malignant melanoma cell lines derived from metastatic lesions by whole-exome sequencing and SNP array profiling. In PloS one, 8, e63597. doi:10.1371/journal.pone.0063597. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23704925/