智鼠故事 
C57BL/6JCya-Rab20em1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称：
Rab20-flox
产品编号：
S-CKO-04652
品系背景：
C57BL/6JCya
* 使用本品系发表的文献需注明：Rab20-flox mice (Strain S-CKO-04652) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
只
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Rab20em1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-19332-Rab20-B6J-VA
产品编号
S-CKO-04652
基因名
Rab20
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
D8Ertd350e
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
MGI:102789 Mice homozygous for a knock-out allele fail to develop M. tuberculosis-containing proteolytic spacious phagosomes.
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
在研小鼠
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Rab20位于小鼠的8号染色体，采用基因编辑技术，通过高通量电转受精卵方式，获得Rab20基因条件性敲除小鼠，性成熟后取精子冻存。
Rab20-flox小鼠模型是由赛业生物（Cyagen）利用基因编辑技术构建的条件性敲除小鼠。Rab20基因位于小鼠8号染色体上，由两个外显子组成，其中ATG起始密码子位于1号外显子，TAA终止密码子位于2号外显子（转录本Rab20-201：ENSMUST00000033900）。2号外显子被选为条件性敲除区域（cKO区域），包含530个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Rab20基因功能的丧失。
赛业生物（Cyagen）通过PCR技术使用BAC克隆RP23-9O10作为模板生成同源臂和cKO区域，构建靶向载体。随后，将核糖核蛋白（RNP）和靶向载体共同注入受精卵，生成Rab20-flox小鼠。出生的小鼠通过PCR和测序分析进行基因型鉴定。
携带敲除等位基因的小鼠无法发育出包含M. tuberculosis的蛋白酶解性空泡。2号外显子覆盖了编码区的75.39%。5'-loxP位点的插入位置位于第一个内含子，长度为23801个碱基对。有效的cKO区域大小约为2.5千碱基对。该策略基于现有数据库中的遗传信息设计。由于生物过程的复杂性，现有技术水平的局限性，无法预测loxP插入对基因转录、RNA剪接和蛋白质翻译的影响。
Rab20-flox小鼠模型可用于研究Rab20基因在小鼠体内的功能，特别是在蛋白酶解性空泡发育中的作用。
基因研究概述
Rab20是一种小GTP结合蛋白，属于Rab蛋白家族，主要负责调控细胞内囊泡运输。Rab蛋白通过GTP结合和水解循环来调节囊泡的运输和融合过程，从而确保物质在细胞内的正确运输和定位。Rab20在多种细胞过程中发挥重要作用，包括细胞增殖、迁移、凋亡和代谢等。此外，Rab20的异常表达与多种人类疾病的发生发展密切相关，包括肿瘤、炎症和代谢性疾病等。
在急性淋巴细胞白血病（B-ALL）中，Ikaros蛋白可以直接调控Rab20的表达。Ikaros是一种DNA结合蛋白，可以作为肿瘤抑制因子发挥作用。研究发现，Ikaros通过染色质重塑抑制Rab20的转录。此外，CK2激酶的磷酸化可以降低Ikaros对RAB20启动子的亲和力，从而减弱Ikaros对Rab20的抑制作用。相反，PP1磷酸酶的去磷酸化可以增强Ikaros与RAB20启动子的结合，从而增强Ikaros对Rab20的抑制作用[1]。
在结核病诊断中，RAB20基因的表达水平可以作为生物标志物。研究发现，RAB20和INSL3基因的表达水平在患有活动性结核病和未患有结核病的患者中存在显著差异。这些基因的表达水平可以准确地区分结核病状态，并且在不同地理区域的队列中具有相似的诊断性能[2]。
在肝细胞癌（HCC）中，Rab20的表达水平降低，导致细胞外囊泡（EVs）中三磷酸异构酶1（TPI1）的表达水平降低。TPI1是一种糖酵解酶，其表达水平的降低可以促进细胞的有氧糖酵解，从而促进HCC的发生发展[3]。
在低氧条件下，Rab20是低氧诱导因子（HIF）的靶基因，并且可以定位于线粒体。Rab20的表达水平在低氧条件下会迅速上调，并且Rab20蛋白可以与线粒体共定位。研究发现，Rab20的敲低可以促进低氧诱导的细胞凋亡。这表明Rab20在低氧条件下可能通过调节线粒体稳态来发挥重要作用[4]。
在骨髓增生异常综合征（MDS）中，RAB20基因的表达水平上调。研究发现，RAB20基因的表达水平在MDS患者中显著高于健康对照组。此外，RAB20基因的表达水平在MDS的不同亚型和急性髓系白血病（AML）患者中也存在差异。这表明RAB20基因的表达水平可能可以作为MDS的诊断和预后标志物[5]。
在胰腺癌中，Rab20的表达水平上调。研究发现，Rab20在胰腺癌细胞系和原发性胰腺癌组织中都有表达，而在正常胰腺组织中表达较低。此外，Rab20的表达水平在胰腺癌的前期病变中也升高，提示Rab20的上调可能是胰腺癌发生发展的早期事件[6]。
综上所述，Rab20作为一种小GTP结合蛋白，在多种细胞过程中发挥重要作用，并且与多种人类疾病的发生发展密切相关。Rab20的表达水平和功能调控机制在疾病的发生发展中起着重要作用，为疾病的治疗和预防提供了新的思路和策略。
参考文献：
1. Payne, Jonathon L, Song, Chunhua, Ding, Yali, Gowda, Chandrika, Dovat, Sinisa. 2020. Regulation of Small GTPase Rab20 by Ikaros in B-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia. In International journal of molecular sciences, 21, . doi:10.3390/ijms21051718. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32138279/
2. Kulkarni, Vandana, Queiroz, Artur T L, Sangle, Shashi, Salgame, Padmini, Mave, Vidya. 2021. A Two-Gene Signature for Tuberculosis Diagnosis in Persons With Advanced HIV. In Frontiers in immunology, 12, 631165. doi:10.3389/fimmu.2021.631165. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33692804/
3. Liu, Bonnie Hei Man, Tey, Sze Keong, Mao, Xiaowen, Yun, Jing Ping, Yam, Judy Wai Ping. 2021. TPI1-reduced extracellular vesicles mediated by Rab20 downregulation promotes aerobic glycolysis to drive hepatocarcinogenesis. In Journal of extracellular vesicles, 10, e12135. doi:10.1002/jev2.12135. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34401050/
4. Hackenbeck, Thomas, Huber, Regina, Schietke, Ruth, Eckardt, Kai-Uwe, Wiesener, Michael S. 2010. The GTPase RAB20 is a HIF target with mitochondrial localization mediating apoptosis in hypoxia. In Biochimica et biophysica acta, 1813, 1-13. doi:10.1016/j.bbamcr.2010.10.019. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21056597/
5. Pellagatti, Andrea, Esoof, Noor, Watkins, Fiona, Wainscoat, James S, Boultwood, Jacqueline. . Gene expression profiling in the myelodysplastic syndromes using cDNA microarray technology. In British journal of haematology, 125, 576-83. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15147372/
6. Guardiola, Montse, Ibarretxe, Daiana, Plana, Núria, Masana, Lluís, Ribalta, Josep. 2021. DNA methylation pattern of hypertriglyceridemic subjects. In Clinica e investigacion en arteriosclerosis : publicacion oficial de la Sociedad Espanola de Arteriosclerosis, 34, 27-32. doi:10.1016/j.arteri.2021.09.002. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34879978/
