Pcdha12-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Pcdha12-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-04525

品系全称

C57BL/6JCya-Pcdha12em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-192164-Pcdha12-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Pcdha12-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-04525) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
protocadherin alpha 12
基因别称
Cnr5,Crnr5,Pcdha13
染色体号
Chr 18 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_138663.2 | Ensembl: ENSMUST00000047614
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~2654 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Pcdha12(Protocadherin Alpha 12)基因是protocadherin-alpha(Pcdha)基因簇中的一部分,位于人类染色体5q31.3。Pcdha基因簇由14个串联排列的基因组成,编码一系列细胞膜蛋白,这些蛋白在神经系统的发育和功能中发挥重要作用。Pcdha基因通过其特有的第一外显子(可变外显子)和共享的常向外显子进行转录和剪接。每个Pcdha基因的可变外显子由其自身的启动子驱动转录,而常向外显子则由所有Pcdha基因共享。这种结构允许Pcdha基因通过不同的剪接方式产生大量的异构体,从而增加蛋白质的多样性。

Pcdha基因在神经元之间以及神经元与支持细胞之间的信号传导中发挥作用,影响神经元的投射、突触形成、学习和记忆等过程。研究发现,在小鼠的脑中,Pcdha基因的表达受到复杂的调控机制的控制。例如,在小脑的浦肯野细胞中,Pcdha基因的表达模式表现出双重特性:每个浦肯野细胞随机表达一组5'基因,而3'基因(Pcdhac1和Pcdhac2)则在所有浦肯野细胞中组成性表达[4]。

Pcdha12基因的表达与多种神经发育疾病相关。例如,Pcdha12基因的突变与自闭症谱系障碍(ASD)的发生有关。研究发现,在自闭症患者的脑组织中,Pcdha12基因的DNA甲基化水平存在显著差异,这可能与自闭症的表观遗传机制有关[2]。此外,Pcdha12基因的突变还与多微脑回(PMG)的发生有关,PMG是一种常见的皮质发育畸形,导致患者出现各种神经发育障碍,包括智力障碍、癫痫和语言运动障碍等[3]。

除了神经发育疾病,Pcdha12基因还与肿瘤的发生发展相关。研究发现,在肺鳞状细胞癌(LUSC)中,Pcdha12基因的表达水平存在显著差异,这可能与LUSC的诊断和预后相关[1]。此外,Pcdha12基因的表达还与结直肠癌的复发风险相关。研究发现,基于包括Pcdha12在内的8个基因突变和肿瘤突变负荷/微卫星不稳定性(TMB/MSI)状态构建的复发预测模型,可以准确预测结直肠癌患者的复发风险[5]。

综上所述,Pcdha12基因在神经发育和肿瘤发生中发挥着重要作用。Pcdha12基因的表达调控机制复杂,包括DNA甲基化、基因突变和基因表达调控等。进一步研究Pcdha12基因的功能和调控机制,有助于深入理解神经发育疾病和肿瘤的发生发展机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Wang, Weiqing, Wang, Shaohua, Chu, Xiao, Liu, Hui, Xiang, Ming. 2019. Predicting the Lung Squamous Cell Carcinoma Diagnosis and Prognosis Markers by Unique DNA Methylation and Gene Expression Profiles. In Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology, 27, 1041-1054. doi:10.1089/cmb.2019.0138. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31710242/
2. Stathopoulos, Sofia, Gaujoux, Renaud, Lindeque, Zander, Van Der Westhuizen, Francois, O'Ryan, Colleen. 2020. DNA Methylation Associated with Mitochondrial Dysfunction in a South African Autism Spectrum Disorder Cohort. In Autism research : official journal of the International Society for Autism Research, 13, 1079-1093. doi:10.1002/aur.2310. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32490597/
3. Frolov, Andrey, Atwood, Stuart G, Guzman, Miguel A, Martin, John R. 2024. A Rare Case of Polymicrogyria in an Elderly Individual With Unique Polygenic Underlining. In Cureus, 16, e74300. doi:10.7759/cureus.74300. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39717325/
4. Noguchi, Yukiko, Hirabayashi, Takahiro, Katori, Shota, Uchimura, Arikuni, Yagi, Takeshi. 2009. Total expression and dual gene-regulatory mechanisms maintained in deletions and duplications of the Pcdha cluster. In The Journal of biological chemistry, 284, 32002-14. doi:10.1074/jbc.M109.046938. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19797050/
5. Gao, Zhaoya, Wan, Zhiyi, Yu, Pengfei, Liu, Haiyi, Gu, Jin. 2023. A recurrence-predictive model based on eight genes and tumor mutational burden/microsatellite instability status in Stage II/III colorectal cancer. In Cancer medicine, 13, e6720. doi:10.1002/cam4.6720. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38111983/