Inpp5k,也称为Inositol Polyphosphate-5-Phosphatase K或SKIP(Skeletal muscle and Kidney enriched Inositol Phosphatase),是一种磷脂酰肌醇5-磷酸酶家族的成员。其蛋白结构包含一个N-末端催化结构域,该结构域能够水解PtdIns(4,5)P2和PtdIns(3,4,5)P3,随后是一个C-末端的SKICH结构域,负责蛋白质-蛋白质相互作用和Inpp5k的亚细胞定位。Inpp5k主要定位于内质网,尽管它也在质膜、细胞质和细胞核中被检测到。最近,在患有罕见常染色体隐性遗传性先天性肌营养不良、白内障、身材矮小和智力障碍的患者中检测到了Inpp5k的突变。Inpp5k的功能涵盖了胰岛素信号传导的控制、内质网应激反应和结构完整性、肌母细胞分化、细胞骨架组织、细胞粘附和迁移、肾脏渗透压调节以及癌症等[1]。
在子宫内膜癌(EC)的研究中,发现了一个基于五个与代谢相关的基因(Inpp5k、PLPP2、MBOAT2、DDC和ITPKA)的预后风险签名。该签名能够准确预测EC患者的预后,并且与免疫浸润细胞和免疫功能相关。此外,该签名还与特定的免疫检查点(PD-1、CTLA4和CD40)相关,这些免疫检查点可以预测免疫治疗在EC患者中的临床反应[2]。
在黎巴嫩进行的一项为期20年的临床和遗传性神经肌肉疾病(NMD)队列分析显示,Inpp5k的突变与一种罕见的常染色体隐性遗传性先天性肌营养不良相关,该疾病表现为智力障碍、白内障、肌肉疾病和身材矮小[6]。
在子宫内膜癌的研究中,发现了一个独立于TP53位点的肿瘤抑制基因位点,该位点位于17号染色体臂上。通过分析该位点上的19个基因,发现Inpp5k和Myo1c是潜在的肿瘤抑制基因候选者。这两个基因在多种人类肿瘤中表现出低表达水平,提示它们可能以杂合子不足的模式发挥作用[3]。
在斑马鱼模型中,Inpp5k的两个同源基因inpp5ka和inpp5kb在表达模式和功能上存在差异。inpp5ka在头部、眼睛和尾部的表达水平远高于inpp5kb,并且具有更高的催化活性。因此,inpp5ka可能更适合用于复制人类疾病的表型[4]。
Inpp5k参与内质网(ER)组织的精细控制。研究发现,Inpp5k的募集到ER是由ARL6IP1介导的,ARL6IP1具有ER塑造蛋白的特征。Inpp5k和ARL6IP1都优先定位于ER管状结构中,并且在新生成的管状结构中富集。Inpp5k或ARL6IP1的消耗会导致ER片状结构的增加。此外,在秀丽线虫中,CIL-1(Inpp5k的线虫同源物)突变导致ER网络分布的异常,而野生型CIL-1的表达可以挽救这种表型[5]。
在巴基斯坦的一个家族中,发现了一个Inpp5k的突变,该突变导致常染色体隐性遗传性先天性白内障。这个家族中的受影响个体还表现出轻到中度的智力障碍和言语障碍,以及肌肉的易激性。这些表型的变异性可能与表观遗传因素或遗传修饰有关[7]。
Inpp5k在神经系统中也发挥重要作用。研究发现,Inpp5k的过表达可以增强皮质脊髓束轴突在CNS损伤后的发芽。Inpp5k通过提高可变生长锥中活性cofilin的密度来刺激轴突生长,从而促进肌动蛋白聚合和微管突出进入远端丝状伪足[8]。
在肝细胞癌的研究中,发现Inpp5k的表达与患者的预后相关。低Inpp5k表达与较差的总体生存率和无复发生存率相关,提示Inpp5k可能作为肝细胞癌的预后生物标志物[9]。
Inpp5k的基因多态性与帕金森病(PD)的易感性相关。研究发现,NUCKS1基因上的一个单核苷酸多态性(SNP)与PD的易感性降低相关,而Inpp5k基因上的SNP与PD的易感性没有显著相关性[10]。
Inpp5k是一种重要的磷脂酰肌醇5-磷酸酶,参与多种生物学过程,包括胰岛素信号传导、内质网应激反应、细胞骨架组织、细胞粘附和迁移、肾脏渗透压调节以及癌症等。Inpp5k的功能与其亚细胞定位和与其他蛋白质的相互作用密切相关。Inpp5k的突变与多种疾病相关,包括先天性肌营养不良、白内障、智力障碍、子宫内膜癌和肝细胞癌等。此外,Inpp5k在神经系统发育和修复中也发挥重要作用。Inpp5k的研究有助于深入理解磷脂酰肌醇信号传导和细胞内信号传导的机制,为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Schurmans, Stéphane, Vande Catsyne, Charles-Andrew, Desmet, Christophe, Moës, Bastien. 2020. The phosphoinositide 5-phosphatase INPP5K: From gene structure to in vivo functions. In Advances in biological regulation, 79, 100760. doi:10.1016/j.jbior.2020.100760. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33060052/
2. Huang, Huaqing, Cai, Xintong, Lin, Jiexiang, Liu, Bin, Lin, Jie. 2023. A novel five-gene metabolism-related risk signature for predicting prognosis and immune infiltration in endometrial cancer: A TCGA data mining. In Computers in biology and medicine, 155, 106632. doi:10.1016/j.compbiomed.2023.106632. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36805217/
3. Hedberg Oldfors, Carola, Dios, Diego Garcia, Linder, Anna, Nilsson, Staffan, Behboudi, Afrouz. 2015. Analysis of an independent tumor suppressor locus telomeric to Tp53 suggested Inpp5k and Myo1c as novel tumor suppressor gene candidates in this region. In BMC genetics, 16, 80. doi:10.1186/s12863-015-0238-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26170120/
4. Shukla, Dhyanam, Gural, Brian M, Cauley, Edmund S, Swan, Laura E, Manzini, M Chiara. 2023. Duplicated zebrafish (Danio rerio) inositol phosphatases inpp5ka and inpp5kb diverged in expression pattern and function. In Development genes and evolution, 233, 25-34. doi:10.1007/s00427-023-00703-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37184573/
5. Dong, Rui, Zhu, Ting, Benedetti, Lorena, Shen, Kang, De Camilli, Pietro. 2018. The inositol 5-phosphatase INPP5K participates in the fine control of ER organization. In The Journal of cell biology, 217, 3577-3592. doi:10.1083/jcb.201802125. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30087126/
6. Yousaf, S, Sheikh, S A, Riazuddin, S, Waryah, A M, Ahmed, Z M. 2018. INPP5K variant causes autosomal recessive congenital cataract in a Pakistani family. In Clinical genetics, 93, 682-686. doi:10.1111/cge.13143. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28940338/
7. Kauer, Sierra D, Fink, Kathryn L, Li, Elizabeth H F, Golan, Noa, Cafferty, William B J. 2022. Inositol Polyphosphate-5-Phosphatase K (Inpp5k) Enhances Sprouting of Corticospinal Tract Axons after CNS Trauma. In The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience, 42, 2190-2204. doi:10.1523/JNEUROSCI.0897-21.2022. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35135857/
8. Wang, Ruobing, Jiao, Yan, Li, Yanqing, Hua, Fang, Liu, Yahui. 2020. The Prediction and Prognostic Significance of INPP5K Expression in Patients with Liver Cancer. In BioMed research international, 2020, 9519235. doi:10.1155/2020/9519235. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32420386/
9. Zhu, Wenqing, Luo, Xiaoguang, Adnan, Atif, Xu, Qin, Pang, Hao. 2018. Association analysis of NUCKS1 and INPP5K polymorphism with Parkinson's disease. In Genes & genetic systems, 93, 59-64. doi:10.1266/ggs.17-00038. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29607885/