Pklr-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Pklr-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-04315

品系全称

C57BL/6JCya-Pklrem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-18770-Pklr-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Pklr-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-04315) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
pyruvate kinase liver and red blood cell
基因别称
Pk-1,Pk1,R-PK
染色体号
Chr 3 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_013631 | Ensembl: ENSMUST00000047111
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3~9
敲除长度
~2.7 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:97604Mice homozygous for loss of function mutations in this gene suffer from hemolytic anemia. This is also a candidate gene for malaria resistance (QTL Char4) and immunity to Salmonella typhimurium (QTL Ity4).
PKLR,也称为Pyruvate Kinase L/R,是一种编码丙酮酸激酶L/R的基因。丙酮酸激酶是糖酵解途径中的关键酶,负责将磷酸烯醇丙酮酸转化为丙酮酸,并在此过程中产生ATP。PKLR基因主要在红细胞的成熟过程中表达,并参与维持红细胞的能量代谢和完整性。此外,PKLR基因还参与调节多种生物学过程,包括脂质代谢、胰岛素信号传导、PI3K-Akt信号传导、MAPK信号传导、AMPK信号传导、mTOR信号传导和PPAR信号传导等。

PKLR基因在牛奶生产性状中也发挥着重要作用。研究表明,PKLR基因的表达在不同泌乳期的奶牛中存在差异,并通过胰岛素、PI3K-Akt、MAPK、AMPK、mTOR和PPAR信号传导途径参与脂质代谢,从而影响牛奶产量和组成。在中国荷斯坦牛群中,研究人员通过重新测序PKLR基因的整个编码区域和部分侧翼区域,发现了21个单核苷酸多态性(SNPs)。其中,两个SNPs位于5'启动子区域,两个位于5'非编码区域(UTR),三个位于内含子,五个位于外显子,六个位于3' UTR,三个位于3'侧翼区域。单标记关联分析显示,所有SNPs都与牛奶产量、脂肪和蛋白质产量或蛋白质百分比显著相关(p ≤ 0.0497)。Haploview预测的包含所有SNPs的单倍型块与脂肪产量和蛋白质百分比显著相关(p ≤ 0.0145)。此外,预测显示,位于5'调节区域和UTR和外显子区域的四个SNPs可能会改变转录因子结合位点(TFBSs)和mRNA二级结构,从而影响PKLR的表达,导致牛奶生产表型的变化。这表明这些SNPs可能是牛奶生产性状的潜在功能性突变[1]。

除了在奶牛中的研究,PKLR基因在其他疾病和生物学过程中也发挥着重要作用。例如,2,3,7,8-TCDD暴露与PKLR基因拷贝数、表达水平和酶活性相关。研究表明,在Agent Orange/Dioxin暴露的个体中,PKLR拷贝数和基因表达水平显著升高,而丙酮酸激酶酶活性显著降低。此外,PKLR基因拷贝数和基因表达水平与2,3,7,8-TCDD浓度呈正相关,而丙酮酸激酶酶活性与2,3,7,8-TCDD浓度呈负相关。这表明PKLR基因拷贝数、表达水平和酶活性与2,3,7,8-TCDD暴露相关[2]。

PKLR基因的突变也与多种疾病相关。例如,Pyruvate Kinase Deficiency(PKD)是一种罕见的红细胞代谢疾病,由PKLR基因突变引起。PKD患者红细胞中的能量代谢失衡,易受溶血的影响。基因编辑技术在PKLR基因治疗PKD方面具有潜力。通过使用TALEN介导的同源重组策略,研究人员成功纠正了PKD-iPSC系的PKD表型。此外,使用带有5'和3'添加基序的TALEN mRNA进行基因编辑,在人类造血祖细胞和造血干细胞(HPSCs)中实现了高基因编辑频率和低毒性。这些研究结果表明,基因编辑技术在PKLR基因治疗PKD方面具有可行性,但仍需进一步改进才能应用于临床[3]。

此外,PKLR基因还与胰腺癌的生长和凋亡抗性相关。研究表明,肝细胞核因子-1a(HNF-1a)基因编码HNF-1a,是一种转录激活因子。HNF-1a在胰腺癌细胞中过表达,并促进增殖同时抑制凋亡。PKLR被确定为HNF-1a的下游目标基因,HNF-1a在PKLR启动子上的两个位点的结合调节PKLR转录。这表明HNF-1a通过其目标基因PKLR促进胰腺癌的生长和凋亡抗性[4]。

PKLR基因还与结核病和麻风病的易感性相关。研究发现,PKLR基因中的单核苷酸多态性(SNPs)与结核病和麻风病的易感性相关。例如,在巴西和非洲人群中,PKLR基因中的SNPs与麻风病和结核病的易感性相关。这些研究发现为理解PKLR基因在疾病易感性中的作用提供了新的线索[5]。

为了进一步研究PKLR基因的功能,研究人员使用计算机分析工具对牛PKLR基因中的非同义单核苷酸多态性(nsSNPs)进行了研究。通过使用SIFT、Polyphen-2、SNAP2和Panther等计算机分析工具,研究人员发现,在170个nsSNPs中,只有18个被预测为有害。此外,蛋白质稳定性分析表明,9个nsSNPs导致蛋白质稳定性降低。这些研究结果为理解PKLR基因在牛中的功能提供了有用的信息[6]。

PKLR基因还与神经内分泌分化(NED)相关。研究表明,雄激素剥夺疗法(ADT)诱导的PCa复发可能导致AR阴性表型,并具有神经内分泌(NE)的组织学特征。PKLR在ADT诱导的PCa中的过表达介导了通过ROMO1上调的氧化应激,从而促进了NED和PCa的侵袭性。ADT介导PKLR的核易位,PKLR与MYCN/MAX复合物结合,上调ROMO1和NE相关基因,导致线粒体功能改变和PCa的NED。靶向核PKLR/MYCN使用溴域和末端模体(BET)抑制剂可以减少PKLR/MYCN驱动的NED。血清中ROMO1的丰富可能为ADT患者的预后提供信息[7]。

最后,PKLR基因突变的研究也取得了进展。例如,研究人员报道了一例2岁女孩,她患有严重的皮肤和巩膜黄染,并逐渐恶化。通过对家系进行全外显子组测序,发现了一个新的复合杂合突变,包括c.1097del(p.P366Lfs*12)和c.1493G > A(p.R498H),位于丙酮酸激酶肝脏和红细胞基因中。此外,通过分子动力学模拟,研究人员揭示了野生型和突变型丙酮酸激酶肝脏和红细胞蛋白之间的差异,包括结构稳定性、蛋白质灵活性、二级结构和整体构象。这些研究结果表明,PKLR基因突变与丙酮酸激酶缺乏症的临床表型相关,并为基因咨询和分子诊断提供了证据[8]。

综上所述,PKLR基因在多种生物学过程中发挥着重要作用。它不仅参与调节牛奶生产性状,还与2,3,7,8-TCDD暴露、PKD、胰腺癌、结核病和麻风病的易感性以及神经内分泌分化相关。此外,PKLR基因突变与丙酮酸激酶缺乏症的临床表型相关。这些研究结果表明,PKLR基因是一个重要的基因,对多种生物学过程和疾病的发生发展具有重要影响。未来,对PKLR基因的深入研究将为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Du, Aixia, Zhao, Fengru, Liu, Yanan, Sun, Dongxiao, Han, Bo. 2022. Genetic polymorphisms of PKLR gene and their associations with milk production traits in Chinese Holstein cows. In Frontiers in genetics, 13, 1002706. doi:10.3389/fgene.2022.1002706. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36118870/
2. Vuong, Nguyen Ba, Quang, Ha Van, Linh Trang, Bui Ngoc, Toan, Nguyen Linh, Tong, Hoang Van. 2023. Association of PKLR gene copy number, expression levels and enzyme activity with 2,3,7,8-TCDD exposure in individuals exposed to Agent Orange/Dioxin in Vietnam. In Chemosphere, 329, 138677. doi:10.1016/j.chemosphere.2023.138677. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37060958/
3. Quintana-Bustamante, Oscar, Fañanas-Baquero, Sara, Orman, Israel, Bueren, Juan A, Segovia, Jose C. 2019. Gene editing of PKLR gene in human hematopoietic progenitors through 5' and 3' UTR modified TALEN mRNA. In PloS one, 14, e0223775. doi:10.1371/journal.pone.0223775. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31618280/
4. Fan, Zhiyao, Fan, Kun, Deng, Shengming, Liu, Chen, Yu, Xianjun. . HNF-1a promotes pancreatic cancer growth and apoptosis resistance via its target gene PKLR. In Acta biochimica et biophysica Sinica, 52, 241-250. doi:10.1093/abbs/gmz169. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32072180/
5. Bezerra, Ohanna Cavalcanti de Lima, Alvarado-Arnez, Lucia Elena, Mabunda, Nédio, Pacheco, Antonio Guilherme, Moraes, Milton Ozório. 2021. Putative pathogen-selected polymorphisms in the PKLR gene are associated with mycobacterial susceptibility in Brazilian and African populations. In PLoS neglected tropical diseases, 15, e0009434. doi:10.1371/journal.pntd.0009434. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34449765/
6. Hoda, Anila, Bixheku, Xhiliola, Lika Çekani, Mirela. 2023. Computational analysis of non-synonymous single nucleotide polymorphism in the bovine PKLR geneComputational analysis of bovine PKLR gene. In Journal of biomolecular structure & dynamics, 42, 4155-4168. doi:10.1080/07391102.2023.2219315. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37278385/
7. Chen, Wei-Yu, Thuy Dung, Phan Vu, Yeh, Hsiu-Lien, Wen, Yu-Ching, Liu, Yen-Nien. 2023. Targeting PKLR/MYCN/ROMO1 signaling suppresses neuroendocrine differentiation of castration-resistant prostate cancer. In Redox biology, 62, 102686. doi:10.1016/j.redox.2023.102686. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36963289/
8. Wang, Yang, Liu, Jiaqi, Liu, Tao, Wang, Cuilan, Yu, Jie. 2024. Pyruvate kinase deficiency and PKLR gene mutations: Insights from molecular dynamics simulation analysis. In Heliyon, 10, e26368. doi:10.1016/j.heliyon.2024.e26368. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38434380/