Pdgfra-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Pdgfra-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-04218

品系全称

C57BL/6JCya-Pdgfraem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-18595-Pdgfra-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Pdgfra-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-04218) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型
JAK-STAT信号通路
MAPK信号通路
PI3K-Akt信号通路

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
platelet derived growth factor receptor, alpha polypeptide
基因别称
CD140a,Pdgfr-2
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001083316 | Ensembl: ENSMUST00000168162
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 4~5
敲除长度
~2.2 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:97530Homozygotes for targeted null mutations exhibit incomplete cephalic closure, increased apoptosis of neural crest cells, impaired myotome and testis formation, abnormal mucosal linings, thoracic skeletal defects, and midgestational lethality.
PDGFRA,即血小板衍生生长因子受体α,是一种跨膜受体酪氨酸激酶,属于受体酪氨酸激酶家族。PDGFRA的主要功能是结合血小板衍生生长因子(PDGF)家族的配体,如PDGF-AA、PDGF-AB和PDGF-BB,进而激活下游信号通路,如Ras-MAPK和PI3K-AKT,从而调节细胞的增殖、分化和迁移。PDGFRA在多种生理和病理过程中发挥重要作用,包括血管生成、组织修复和肿瘤发生。

PDGFRA基因的突变和扩增与多种肿瘤的发生和发展密切相关。例如,在胶质母细胞瘤(GBM)中,PDGFRA基因的扩增和重排是常见的遗传事件。PDGFRA基因扩增与GBM患者的预后不良相关,而PDGFRA基因重排则与肿瘤的病理特征和免疫微环境有关。此外,PDGFRA基因的突变也与胃肠道间质瘤(GIST)的发生和发展有关,其中最常见的突变是第18外显子的D842V突变,该突变与原发性伊马替尼耐药和肿瘤的惰性相关。

近年来,PDGFRA基因的研究取得了一些重要的进展。研究表明,PDGFRA基因的突变和扩增与GBM的异质性密切相关,PDGFRA基因的扩增和重排与肿瘤的病理特征和免疫微环境有关。例如,PDGFRA基因扩增与GBM患者的预后不良相关,而PDGFRA基因重排则与肿瘤的病理特征和免疫微环境有关。此外,PDGFRA基因的突变也与胃肠道间质瘤(GIST)的发生和发展有关,其中最常见的突变是第18外显子的D842V突变,该突变与原发性伊马替尼耐药和肿瘤的惰性相关。

在GBM中,PDGFRA基因的扩增和重排是常见的遗传事件。一项研究调查了PDGFRA、KIT和KDR基因在4q12区扩增与临床参数的相关性。研究发现,16例GBM病例中,所有三种基因(PDGFRA、KIT和KDR)均呈均匀扩增(45.5%),PDGFRA和KDR呈均匀扩增(22.7%),仅PDGFRA呈均匀扩增(4.6%);6例GBM病例呈不均匀扩增模式,包括所有三种基因的扩增(13.6%),PDGFRA和KDR的扩增(13.6%),仅PDGFRA的扩增(9.1%)或KIT的扩增(4.6%)。在6个肿瘤(27.3%)中,扩增在局灶性肿瘤区域观察到,而在其余16个肿瘤(72.7%)中,扩增则在整个病理标本中呈弥漫性分布。扩增普遍表达为双分钟染色体和均匀染色区域。所有三种基因PDGFRA、KIT和KDR的共扩增、年龄≥60岁和总肿瘤切除与不良预后相关。荧光原位杂交(FISH)被证明对详细解释分子异质性有效。该研究揭示了涉及4q12致癌基因的GBM扩增模式比以前描述的更加多样,从而突出了在制定更有效的治疗策略时需要考虑的肿瘤异质性的复杂性[1]。

在G34R/V突变的GBM中,PDGFRA基因的激活对肿瘤的发生发展起着关键作用。研究发现,50%的G34R/V肿瘤(n=95)存在PDGFRA的激活突变,并在复发时表现出强烈的选择压力。尽管被认为是胶质瘤,但G34R/V肿瘤实际上起源于GSX2/DLX表达的中间神经元祖细胞,其中G34R/V突变会损害神经元分化。起源谱系可能通过连接PDGFRA和GSX2调节元件的染色质环促进PDGFRA的共选择,从而促进PDGFRA的过度表达和突变。在单个细胞水平上,G34R/V肿瘤具有双神经元/星形胶质细胞表型,缺乏由GSX2/DLX介导的细胞命运特化所积极抑制的少突胶质细胞程序。G34R/V可能对肿瘤维持变得不再必要,而突变型PDGFRA则具有强大的致癌性。综上所述,这些结果为致命肿瘤的研究开辟了新的途径。G34R/V胶质瘤是神经元恶性肿瘤,其中中间神经元祖细胞因G34R/V突变而停滞在分化过程中,而恶性胶质瘤发生则由PDGFRA信号通路的共选择所促进[2]。

PDGFRA基因的表观遗传修饰也是GBM发生发展的重要机制。研究发现,在异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变的GBM中,PDGFRA基因附近的CTCF绝缘子因DNA高甲基化而受损。小鼠少突胶质细胞祖细胞(OPC)中CTCF绝缘子的损伤使得一个OPC特异性增强子与PDGFRA基因接触并诱导PDGFRA表达,从而增加增殖。研究还发现,第二个损伤,即CTCF绝缘子缺失和Cdkn2a肿瘤抑制因子沉默,在OPC中协同驱动GBM的发生。尽管位点存在同源,但绝缘子在人类中富含CpG,而在小鼠中则缺乏,这一特征可能赋予人类GBM风险,但同时也使小鼠模型变得复杂。这项研究证明了反复出现的表观遗传损伤驱动OPC增殖和GBM发生的能力[3]。

综上所述,PDGFRA基因在多种肿瘤的发生和发展中发挥着重要作用。PDGFRA基因的突变、扩增和表观遗传修饰与肿瘤的异质性、病理特征、免疫微环境和预后密切相关。深入研究PDGFRA基因的功能和调控机制,有助于揭示肿瘤发生发展的分子机制,为肿瘤的精准治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Carlotto, Bianca Soares, Trevisan, Patricia, Provenzi, Valentina Oliveira, Varella-Garcia, Marileila, Zen, Paulo Ricardo Gazzola. 2023. PDGFRA, KIT, and KDR Gene Amplification in Glioblastoma: Heterogeneity and Clinical Significance. In Neuromolecular medicine, 25, 441-450. doi:10.1007/s12017-023-08749-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37610648/
2. Chen, Carol C L, Deshmukh, Shriya, Jessa, Selin, Kleinman, Claudia L, Jabado, Nada. 2020. Histone H3.3G34-Mutant Interneuron Progenitors Co-opt PDGFRA for Gliomagenesis. In Cell, 183, 1617-1633.e22. doi:10.1016/j.cell.2020.11.012. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33259802/
3. Rahme, Gilbert J, Javed, Nauman M, Puorro, Kaitlyn L, Johnstone, Sarah E, Bernstein, Bradley E. 2023. Modeling epigenetic lesions that cause gliomas. In Cell, 186, 3674-3685.e14. doi:10.1016/j.cell.2023.06.022. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37494934/