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Pam-flox 基因敲除小鼠

Pam-flox 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Pam-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-04162

品系全称

C57BL/6JCya-Pamem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-18484-Pam-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Pam-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-04162) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase
基因别称
PHM
染色体号
Chr 1 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_013626 | Ensembl: ENSMUST00000097625
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~0.9 kb
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:97475Homozygous mutation of this gene results in embryonic lethality during fetal growth and development, edema, abnormal yolk sac vasculature, thin arterial walls, and abnormal bronchial epithelial morphology.
更多信息
PAM，即原间隔区相邻基序（Protospacer Adjacent Motif），是CRISPR-Cas系统中Cas蛋白识别并结合目标DNA序列的关键元件。PAM序列位于Cas蛋白识别的间隔区序列（Protospacer）的3'端，对于Cas蛋白识别和切割DNA至关重要。不同的Cas蛋白识别不同的PAM序列，例如SpCas9识别NGG序列，而SaCas9识别NNGRRT序列。PAM的存在和识别是Cas蛋白发挥功能的前提，也是限制其应用范围的重要因素。

近年来，科学家们通过蛋白质工程和定向进化等方法，对Cas蛋白的PAM识别特性进行了深入研究，成功开发出多种PAM灵活的Cas蛋白变体，扩大了CRISPR-Cas系统的应用范围。例如，研究人员通过逐步的结构指导突变，在SpdCas9的基础上创建了PAM灵活的变体SpdNG-LWQT，该变体能够识别5'-NRN-3' PAMs，从而实现了对几乎任何基因的ATG起始密码子的结合和基因抑制[1]。此外，通过替换SpCas9的PAM结合基序，研究人员成功创建了SedCas9-NQ变体，该变体能够识别NNG和NAA PAMs，并用于细菌中的基因表达调控[2]。

除了SpCas9，其他Cas蛋白如SaCas9、Cpf1等也已被开发出PAM灵活的变体。例如，SaCas9变体SaCas9-HF1能够识别NNGRRT和NNGRT PAMs，Cpf1变体Cpf1-2xN能够识别NNS PAMs。这些PAM灵活的Cas蛋白变体的开发，为CRISPR-Cas系统在基因编辑、基因治疗和合成生物学等领域的应用提供了更多的可能性。

在CRISPR-Cas系统中，PAM序列的识别和结合是Cas蛋白发挥功能的第一步。PAM序列的长度、位置和序列组成都对Cas蛋白的识别和结合至关重要。此外，PAM序列的变异也会影响Cas蛋白的识别和结合，从而影响CRISPR-Cas系统的效率和特异性。因此，PAM序列的识别和结合是CRISPR-Cas系统研究和应用的关键问题。

通过蛋白质工程和定向进化等方法，研究人员已经成功开发出多种PAM灵活的Cas蛋白变体，扩大了CRISPR-Cas系统的应用范围。这些PAM灵活的Cas蛋白变体在基因编辑、基因治疗和合成生物学等领域具有广泛的应用前景，为解决PAM序列的限制提供了新的思路和方法。

参考文献：
1. Wang, Jian, Teng, Yuxi, Zhang, Ruihua, Xie, Zhong-Ru, Yan, Yajun. 2021. Engineering a PAM-flexible SpdCas9 variant as a universal gene repressor. In Nature communications, 12, 6916. doi:10.1038/s41467-021-27290-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34824292/
2. Wang, Jian, Teng, Yuxi, Gong, Xinyu, Xie, Zhong-Ru, Yan, Yajun. 2022. Exploring and engineering PAM-diverse Streptococci Cas9 for PAM-directed bifunctional and titratable gene control in bacteria. In Metabolic engineering, 75, 68-77. doi:10.1016/j.ymben.2022.10.005. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36404524/

资料下载

S-CKO-04162_6J_18484_Pam_Exon 3_strategy.pdf
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