Oat-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Oat-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-04061

品系全称

C57BL/6JCya-Oatem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-18242-Oat-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Oat-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-04061) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
ornithine aminotransferase
基因别称
rhg
染色体号
Chr 7 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_016978 | Ensembl: ENSMUST00000084500
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3~5
敲除长度
~4.3 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:97394Null mutants show neonatal hypoornithinemia and increased mortality prevented by administering arginine. Homozygotes for a spontaneous G353A point mutation have neonatal hypoornithinemia, adult hyperornithinemia, growth retardation, retarded fur development, cataracts, and retinal degeneration.
基因Oat,即燕麦(Avena sativa L.),是一种重要的粮食作物,在世界上广泛种植。燕麦富含膳食纤维、蛋白质、维生素和矿物质,具有多种健康益处。然而,燕麦的生产受到多种病虫害的威胁,其中冠锈病是一种严重的病害,对燕麦产量和品质造成严重影响。

为了提高燕麦的抗病性,研究人员已经鉴定出多个抗冠锈病的基因。其中,Pc39是北美燕麦育种中广泛应用的种子苗冠锈病抗性基因。为了更好地预测育种材料中Pc39基因的存在,研究人员对Pc39基因进行了定位,并将其映射到燕麦遗传图谱的Mrg11连锁群上。此外,还开发了与Pc39基因紧密连锁的单核苷酸多态性(SNP)标记,这些标记可以用于辅助选择和基因定位[4]。

除了冠锈病抗性基因,燕麦中还存在着其他抗病基因。例如,Pm7基因负责燕麦对白粉病的抗性。通过三个独立的实验,Pm7基因被定位到燕麦基因组5D染色体的远端区域。这些研究结果表明,Pm7基因在燕麦抗白粉病育种中具有重要作用[1]。

此外,Pg13基因是北美燕麦栽培品种中广泛应用的茎锈病抗性基因。通过连锁分析和关联分析,Pg13基因被定位到燕麦遗传图谱的Mrg18连锁群上,并且与7C-17A易位断点和冠锈病抗性基因Pc91共分离。为了辅助选择和基因定位,研究人员开发了与Pg13基因紧密连锁的KASP标记[2]。

除了抗病基因,燕麦中还存在着其他重要的基因家族。例如,燕麦的过氧化氢酶(CAT)基因家族在植物发育和抗逆性中发挥着重要作用。通过对燕麦CAT基因家族进行全基因组分析,研究人员发现燕麦中存在着10个CAT基因,它们属于三个不同的亚组,并且在不同的细胞器中定位。此外,基因表达分析表明,一些CAT基因在非生物胁迫下表现出明显的表达变化,这表明它们在植物的抗逆性中发挥着重要作用[3]。

此外,燕麦中的有机阴离子转运蛋白(OAT)基因家族在调节植物中的必需营养素方面发挥着重要作用。通过对河牛和沼泽牛的OAT基因家族进行进化分析,研究人员发现了一些潜在的候选基因,这些基因可能在牛奶性能中发挥作用。例如,河牛中特有的SLCO3A1基因在乳腺组织中表现出较高的表达水平[5]。

此外,燕麦中的甘油醛酶基因家族在种子萌发和幼苗建立中发挥着重要作用。通过对燕麦甘油醛酶基因家族进行全基因组分析,研究人员发现了一些潜在的候选基因,这些基因可能在提高燕麦的抗逆性和种子活力方面发挥作用[6]。

综上所述,基因Oat在燕麦的抗病性、植物发育和抗逆性等方面发挥着重要作用。通过全基因组分析和关联分析,研究人员已经鉴定出多个抗病基因,并开发了与这些基因紧密连锁的标记,这些标记可以用于辅助选择和基因定位。此外,通过对燕麦中其他重要基因家族的研究,研究人员发现了更多的候选基因,这些基因可能在植物的生长发育和抗逆性中发挥作用。这些研究为进一步提高燕麦的抗病性和适应性提供了新的思路和策略。

参考文献:
1. Brodführer, Sophie, Mohler, Volker, Stadlmeier, Melanie, Hackauf, Bernd, Herrmann, Matthias Heinrich. 2023. Genetic mapping of the powdery mildew resistance gene Pm7 on oat chromosome 5D. In TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik, 136, 53. doi:10.1007/s00122-023-04288-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36913008/
2. Kebede, Aida Z, Admassu-Yimer, Belayneh, Bekele, Wubishet A, Esvelt Klos, Kathy, McCartney, Curt A. 2019. Mapping of the stem rust resistance gene Pg13 in cultivated oat. In TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik, 133, 259-270. doi:10.1007/s00122-019-03455-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31637459/
3. Ghorbel, Mouna, Zribi, Ikram, Chihaoui, Mejda, Mseddi, Khalil, Brini, Faiçal. 2023. Genome-Wide Investigation and Expression Analysis of the Catalase Gene Family in Oat Plants (Avena sativa L.). In Plants (Basel, Switzerland), 12, . doi:10.3390/plants12213694. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37960051/
4. Zhao, Jun, Kebede, Aida Z, Bekele, Wubishet A, Peng, Yuan-Ying, McCartney, Curt A. 2020. Mapping of the Oat Crown Rust Resistance Gene Pc39 Relative to Single Nucleotide Polymorphism Markers. In Plant disease, 104, 1507-1513. doi:10.1094/PDIS-09-19-2002-RE. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32150502/
5. Ma, Xiaoya, Liang, Shasha, Liang, Aixin, Rushdi, Hossam E, Deng, Tingxian. 2021. Evolutionary Analysis of OAT Gene Family in River and Swamp Buffalo: Potential Role of SLCO3A1 Gene in Milk Performance. In Genes, 12, . doi:10.3390/genes12091394. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34573376/
6. Sun, Ming, Sun, Shoujiang, Jia, Zhicheng, Li, Manli, Mao, Peisheng. 2023. Genome-wide analysis and expression profiling of glyoxalase gene families in oat (Avena sativa) indicate their responses to abiotic stress during seed germination. In Frontiers in plant science, 14, 1215084. doi:10.3389/fpls.2023.1215084. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37396634/