Nbl1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Nbl1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-03896

品系全称

C57BL/6JCya-Nbl1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-17965-Nbl1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Nbl1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-03896) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型
TGF-β信号通路

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
NBL1, DAN family BMP antagonist
基因别称
D4H1S1733E,DAN,Dana,NO3
染色体号
Chr 4 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_008675 | Ensembl: ENSMUST00000042844
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~1.7 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:104591Mice homozygous for disruptions in this gene appear to have a normal nervous system, although one allele exhibits reduced sensitivity to pain during inflammation.
NBL1基因,也称为DAN(Differential screening-selected gene Aberrant in Neuroblastoma),是DAN基因家族的一员。DAN基因家族在生物体发育过程中表达,并在肢芽形成和指化、肾脏形成和形态发生以及左右轴指定中发挥着重要作用。在成年期,这些基因的表达与包括癌症在内的疾病相关。

在进化过程中,DAN基因家族成员的单系性得到证实,并被分为五个主要群体。除了众所周知的DAN基因外,系统发育结果还揭示了两个新的DAN基因谱系的存在;一个仅保留在头索动物中,而另一个(GREM3)仅在软骨鱼类、硬骨鱼类和肺鱼中发现。根据基因的谱系分布,有颌类祖先具有八个DAN基因,在类群辐射过程中,GREM1、GREM2、SOST、SOSTDC1和NBL1被所有主要群体保留,而GREM3、CER1和DAND5则发生了差异丢失[1]。

在食管癌中,miR-1301-3p和NBL1的表达水平被发现与患者的预后密切相关。miR-1301-3p的表达升高与食管癌患者的预后不良相关。过表达miR-1301-3p促进了食管癌细胞的侵袭、迁移和EMT过程,而miR-1301-3p的敲低则显示出相反的效果。NBL1是miR-1301-3p的预测靶基因,在食管癌细胞中低表达,并且在miR-1301-3p上调后显著降低。NBL1的低表达与食管癌患者的预后不良显著相关。因此,miR-1301-3p可能是预测食管癌患者预后的潜在生物标志物,它可能通过调节NBL1的表达来促进食管癌的侵袭、迁移和EMT进展[2]。

NBL1是一种分泌蛋白,其表达高度局限于前列腺,并与前列腺癌的进展相关。通过使用大肠杆菌氨苄青霉素分泌陷阱(CAST)从前列腺癌和正常前列腺中生成CAST库,研究人员发现了15个编码在前列腺癌和正常前列腺中存在的分泌蛋白的候选基因。定量RT-PCR分析显示,MSMB、NBL1和AZGP1在前列腺癌和正常前列腺中的表达特异性远高于其他14种正常组织。NBL1蛋白在DU145前列腺癌细胞系的细胞裂解物和培养介质中高度表达。免疫组化分析显示,NBL1的表达在正常前列腺和前列腺癌中高度检测到,但在前列腺癌中显著下调。NBL1的表达随着肿瘤阶段、Gleason等级和术前PSA值的升高而显著降低。NBL1可能是一种前列腺癌的候选肿瘤标志物,除了PSA之外[3]。

在神经母细胞瘤中,ALK受体酪氨酸激酶可以因激活点突变或基因组扩增而构成性激活。研究人员研究了HR-NBL1/SIOPEN试验中高风险(HR)患者中ALK基因改变的发生频率、与临床参数的相关性以及预后影响。在901例病例中,4.5%的病例检测到基因组ALK扩增(ALKa),其中除一例外,其余都与MYCN扩增相关。ALKa与显著较差的总生存期(OS)相关,特别是在有转移性疾病的患者中。ALK突变(ALKm)在10%的病例中检测到,其中10%为克隆水平(>20%突变等位基因分数),3.9%为亚克隆水平(突变等位基因分数0.1%-20%),ALKm的存在与MNA有强相关性。在已知ALKa和ALKm状态的571例病例中,ALKa或克隆ALKm与亚克隆ALKm或无ALK改变的病例在OS方面存在统计学上的显著差异。重要的是,在多变量模型中,超过一个转移部位的参与、ALKa和克隆ALKm是预后不良的独立预测因子。在HR-NB中,ALK(克隆突变和扩增)的遗传改变是预后不良的独立预测因子[4]。

NBL1(DAN)是骨形态发生蛋白(BMP)拮抗剂DAN亚家族的创始成员。虽然NBL1在多种器官中广泛分布,但DAN转录水平受到促性腺激素的周期性调控。卵巢显微解剖表明,NBL1(DAN)mRNA主要在颗粒细胞中表达,其转录水平受到促性腺激素驱动的cAMP级联反应的上调。NBL1(DAN)mRNA在颗粒细胞中的表达受到卵母细胞衍生的生长分化因子9(GDF9)的上调,而DAN处理则显著逆转了BMP4对促性腺激素诱导的孕酮产生在培养颗粒细胞中的抑制作用。这些发现表明,由卵母细胞衍生的GDF9建立的DAN梯度可能作为一种拮抗屏障,在卵泡发生过程中空间和时间上调节由间质衍生的BMP4和颗粒细胞/间质衍生的BMP2的作用[5]。

神经嵴细胞既具有高度迁移性,又对脊椎动物器官形成具有重要意义。然而,调节神经嵴细胞迁移的信号仍然不清楚。在研究中,研究人员测试了DAN的功能,DAN是一种由鸡颅中胚层分析检测到的BMP拮抗剂。分析显示,在神经嵴细胞从后脑中迁移出来之前,DAN在中胚层中表达,然后沿着细胞迁移途径消失。颅神经嵴和转移性黑色素瘤细胞在体外避开DAN蛋白条纹。在体内和体外,添加DAN减少了迁移细胞的速度。DAN的体内功能丧失导致神经嵴细胞迁移增强,速度和方向性增加。计算机模型模拟支持DAN通过调节细胞速度来抑制细胞迁移的假设。总的来说,这些结果确定DAN是一种新的抑制未控制的神经嵴和转移性黑色素瘤侵袭并促进集体迁移的因子,这与抑制BMP信号一致[6]。

NBL1的结构揭示了DAN家族蛋白如何有效地抑制BMP配体。通过比较NBL1与DAN家族中更有效的BMP拮抗剂PRDC的结构,研究人员发现了一些差异。通过基于诱变的方法,研究人员能够将NBL1中的BMP结合表位与PRDC中的表位相关联,其中在NBL1中引入特定的PRDC氨基酸(A58F和S67Y)与对BMP2和BMP7的获得功能抑制相关,但对GDF5没有影响。尽管NBL1(S67Y)能够像PRDC一样有效地拮抗BMP7,但NBL1(S67Y)对BMP2的抑制作用仍然比PRDC弱32倍。这些数据表明,BMP结合表位的改变可以部分解释DAN家族内BMP抑制的效力差异[7]。

NBL1和ANLN基因在胰腺癌中过表达。研究人员分析了胰腺癌的基因表达谱,以获得这种恶性肿瘤的新型分子标记。通过主成分分析(PCA)对微阵列数据进行分析,发现正常样本的表达模式非常一致,而慢性胰腺炎的表达模式则不太一致。通过监督比较(校正p值0.001),观察到11094个探针组区分癌症和正常样本,而只有76个探针组对癌症和慢性胰腺炎的差异具有统计学意义。在两种比较中,只有S100钙结合蛋白P(S100P)基因在最佳10个基因中都有出现,先前基于微阵列的研究已经表明其作为胰腺癌标记物的效用。为了验证,研究人员选择了两个似乎是有价值的胰腺癌分子标记物候选基因:神经母细胞瘤,抑制肿瘤发生1(NBL1)和anillin(ANLN)。通过Q-PCR,研究人员证实了这些基因在统计学上的显著差异,在癌症/正常比较中,NBL1的表达差异为9.5倍,而在癌症和胰腺炎之间的差异相对较小。对于ANLN,甚至观察到更明显的差异(癌症/正常19.8倍,癌症/胰腺炎4.0倍)。NBL1和ANLN是胰腺癌分子诊断的有希望的标记物[8]。

NBL1和ANLN基因在胰腺癌中过表达。研究人员分析了胰腺癌的基因表达谱,以获得这种恶性肿瘤的新型分子标记。通过主成分分析(PCA)对微阵列数据进行分析,发现正常样本的表达模式非常一致,而慢性胰腺炎的表达模式则不太一致。通过监督比较(校正p值0.001),观察到11094个探针组区分癌症和正常样本,而只有76个探针组对癌症和慢性胰腺炎的差异具有统计学意义。在两种比较中,只有S100钙结合蛋白P(S100P)基因在最佳10个基因中都有出现,先前基于微阵列的研究已经表明其作为胰腺癌标记物的效用。为了验证,研究人员选择了两个似乎是有价值的胰腺癌分子标记物候选基因:神经母细胞瘤,抑制肿瘤发生1(NBL1)和anillin(ANLN)。通过Q-PCR,研究人员证实了这些基因在统计学上的显著差异,在癌症/正常比较中,NBL1的表达差异为9.5倍,而在癌症和胰腺炎之间的差异相对较小。对于ANLN,甚至观察到更明显的差异(癌症/正常19.8倍,癌症/胰腺炎4.0倍)。NBL1和ANLN是胰腺癌分子诊断的有希望的标记物[8]。

综上所述,NBL1基因在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括胚胎发育、器官形成、癌症发生和进展等。NBL1基因的表达受到多种因素的调控,包括miRNA、促性腺激素等。NBL1基因的功能与其结构密切相关,包括与BMP结合表位等。NBL1基因的异常表达与多种癌症的发生和进展相关,包括食管癌、前列腺癌、神经母细胞瘤和胰腺癌等。NBL1基因的研究有助于深入理解其生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Opazo, Juan C, Hoffmann, Federico G, Zavala, Kattina, Edwards, Scott V. 2021. Evolution of the DAN gene family in vertebrates. In Developmental biology, 482, 34-43. doi:10.1016/j.ydbio.2021.12.002. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34902310/
2. Du, Jianting, Zhang, Shuliang, Zhang, Xiaodan, Zheng, Bin, Chen, Chun. 2023. miR-1301-3p promotes invasion and migration and EMT progression in esophageal cancer by downregulating NBL1 expression. In Thoracic cancer, 14, 3032-3041. doi:10.1111/1759-7714.15093. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37680006/
3. Hayashi, Tetsutaro, Sentani, Kazuhiro, Oue, Naohide, Matsubara, Akio, Yasui, Wataru. 2012. The search for secreted proteins in prostate cancer by the Escherichia coli ampicillin secretion trap: expression of NBL1 is highly restricted to the prostate and is related to cancer progression. In Pathobiology : journal of immunopathology, molecular and cellular biology, 80, 60-9. doi:10.1159/000341396. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22948749/
4. Bellini, Angela, Pötschger, Ulrike, Bernard, Virginie, Ladenstein, Ruth, Schleiermacher, Gudrun. 2021. Frequency and Prognostic Impact of ALK Amplifications and Mutations in the European Neuroblastoma Study Group (SIOPEN) High-Risk Neuroblastoma Trial (HR-NBL1). In Journal of clinical oncology : official journal of the American Society of Clinical Oncology, 39, 3377-3390. doi:10.1200/JCO.21.00086. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34115544/
5. Hung, Wei-Ting, Wu, Fang-Ju, Wang, Chun-Jen, Luo, Ching-Wei. 2012. DAN (NBL1) specifically antagonizes BMP2 and BMP4 and modulates the actions of GDF9, BMP2, and BMP4 in the rat ovary. In Biology of reproduction, 86, 158, 1-9. doi:10.1095/biolreprod.111.096172. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22357543/
6. McLennan, Rebecca, Bailey, Caleb M, Schumacher, Linus J, Maini, Philip K, Kulesa, Paul M. 2017. DAN (NBL1) promotes collective neural crest migration by restraining uncontrolled invasion. In The Journal of cell biology, 216, 3339-3354. doi:10.1083/jcb.201612169. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28811280/
7. Nolan, Kristof, Kattamuri, Chandramohan, Luedeke, David M, Zorn, Aaron M, Thompson, Thomas B. 2015. Structure of neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1 (NBL1): insights for the functional variability across bone morphogenetic protein (BMP) antagonists. In The Journal of biological chemistry, 290, 4759-4771. doi:10.1074/jbc.M114.628412. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25561725/
8. Olakowski, Marek, Tyszkiewicz, Tomasz, Jarzab, Michał, Lampe, Paweł, Jarzab, Barbara. . NBL1 and anillin (ANLN) genes over-expression in pancreatic carcinoma. In Folia histochemica et cytobiologica, 47, 249-55. doi:10.2478/v10042-009-0031-1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19995712/