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Lyar-flox 基因敲除小鼠

Lyar-flox 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Lyar-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-03537

品系全称

C57BL/6JCya-Lyarem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-17089-Lyar-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Lyar-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-03537) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
Ly1 antibody reactive clone
基因别称
MLZ-264
染色体号
Chr 5 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_025281.3 | Ensembl: ENSMUST00000087514
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~615 bp
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:107470Mice homozygous for a knock-out allele exhibit reduced proliferation of mouse embryonic fibroblasts and results in female prenatal lethality when presnt with a Trp53 null allele.
更多信息
LYAR，也称为LY-1抗体反应性克隆蛋白，是一种在生物医学领域具有重要作用的蛋白质。LYAR在多种生物学过程中发挥关键作用，包括胚胎干细胞自我更新和分化、基因转录调控以及细胞增殖和存活等。近年来，LYAR在多种人类癌症中的表达及其功能逐渐受到关注。

LYAR在β-地中海贫血患者中发挥重要作用。研究发现，LYAR与Aγ-珠蛋白基因的结合效率受到rs368698783（G>A）多态性的影响。该多态性位于Aγ-珠蛋白基因的5'-非翻译区（5'-UTR），导致LYAR与Aγ-珠蛋白基因的结合效率降低，从而影响胎儿血红蛋白（HbF）的产生。研究发现，rs368698783（G>A）多态性与β-地中海贫血患者中高水平的HbF产生相关，特别是使用雷帕霉素作为HbF诱导剂时。此外，rs368698783多态性还可能作为预测患者对体内羟基脲（HU）治疗的反应性的参数[1]。

LYAR在人类胎儿血红蛋白基因表达中发挥重要作用。研究发现，LYAR直接与甲基转移酶PRMT5相互作用，触发组蛋白H4精氨酸3对称二甲基化（H4R3me2s）标记。PRMT5在γ-启动子上的结合依赖于LYAR。LYAR的DNA结合基序（GGTTAT）通过CASTing实验得到鉴定。EMSA和ChIP实验证实，LYAR与γ-珠蛋白基因的5'-UTR区域结合。此外，LYAR在K562细胞和原代人类成人红细胞祖细胞中抑制人类胎儿血红蛋白基因表达。这些数据表明，LYAR作为一种新的转录因子，与γ-珠蛋白基因结合，对沉默γ-珠蛋白基因至关重要[2]。

LYAR在多种癌症中发挥重要作用。研究发现，LYAR在神经母细胞瘤中表达上调，与不良预后相关。N-Myc原癌蛋白通过结合LYAR基因启动子上调LYAR基因表达。基因表达谱分析显示，敲低LYAR显著上调氧化应激基因的表达，包括CHAC1，它消耗细胞内谷胱甘肽并诱导氧化应激。敲低LYAR表达通过siRNA诱导氧化应激、神经母细胞瘤细胞生长抑制和细胞凋亡，而与谷胱甘肽补充剂N-乙酰-L-半胱氨酸或CHAC1 siRNA共处理可以阻断LYAR siRNA的影响。此外，LYAR基因在人类神经母细胞瘤组织中高水平表达预示着神经母细胞瘤患者的无事件生存期和总生存期较差[3]。

LYAR在结直肠癌中发挥重要作用。研究发现，LYAR在结直肠癌组织中表达上调，与结直肠癌的转移相关。LYAR促进结直肠癌细胞迁移和侵袭能力。基因表达谱分析显示，LGALS1，编码半乳糖凝集素-1蛋白，是LYAR的潜在靶点。ChIP实验和基因报告实验表明，LYAR直接结合LGALS1启动子。半乳糖凝集素-1的过表达部分恢复了LYAR敲低细胞的移动能力，这表明半乳糖凝集素-1参与了LYAR促进的结直肠癌细胞迁移和侵袭[4]。

LYAR在多种癌症中的表达水平与其预后相关。研究发现，与正常组织相比，LYAR在多种肿瘤中的表达水平较高。LYAR表达水平与总体生存率、无进展间隔期和疾病特异性生存率相关。细胞计数试剂盒8、Transwell和伤口愈合实验表明，敲除LYAR显著抑制了肝细胞癌细胞的增殖、迁移和侵袭。此外，该研究发现，LYAR表达与MKI67IP、BZW2和CCT2的表达呈显著正相关。基因集富集分析结果显示，LYAR表达水平高的样本富含剪接体、RNA降解、嘧啶代谢、细胞周期、核苷酸切除修复和碱基切除修复[5]。

LYAR在结直肠癌进展中发挥重要作用。研究发现，LYAR在结直肠癌组织中的表达水平高于邻近正常组织，且与结直肠癌的远处转移密切相关。LYAR不仅显著促进结直肠癌细胞在体外迁移和侵袭，而且敲除LYAR在结直肠癌细胞中抑制了异种移植肿瘤的转移。微阵列分析、ChIP实验、基因报告实验和拯救实验表明，FSCN1（编码肌动蛋白束蛋白1）是LYAR促进结直肠癌细胞迁移和侵袭的关键调节因子。敲除FSCN1显著抑制了结直肠癌细胞皮下成瘤，并导致FASN和SCD（编码脂肪酸合成中的关键酶）的下调[6]。

LYAR在细胞生长和发育中发挥重要作用。研究发现，LYAR突变小鼠表现出细胞生长受损和细胞应激反应。LYAR突变小鼠与缺乏p53肿瘤抑制蛋白的小鼠杂交，导致大多数LYAR/p53复合突变雌性小鼠死亡。神经管缺陷（NTD）无脑儿在LYAR/p53突变小鼠中观察到。LYAR/p53突变小鼠代表了NTDs的新二基因模型。此外，这些研究将LYAR确定为人类NTDs的候选基因[7]。

LYAR在细胞分化过程中发挥重要作用。研究发现，LYAR介导的Brd2募集到染色质中，减弱了分化诱导后Nanog下调。LYAR下调导致Brd2从多个研究过的启动子中解离。相反，BET蛋白从染色质中的解离对LYAR占据没有影响。在分化条件下，LYAR的缺乏导致多能性基因Nanog的下调受损，同时分化标志物的上调减少。有趣的是，分化诱导后，Brd2的耗竭表现出与表达缺失Brd2相互作用结构域的截短LYAR分子相同的效果。两种方法都导致Nanog更强的抑制，表明LYAR介导的Brd2募集在分化触发时调节Nanog沉默。此外，截短LYAR的表达导致分化受损和凋亡增加。因此，LYAR介导的Brd2募集可能参与保持适当的Nanog沉默时间，以确保分化程序的适当建立[8]。

LYAR在HIV-1潜伏感染中发挥重要作用。研究发现，LYAR在携带完整复制性HIV-1前病毒的静息记忆CD4+T细胞中表达。这些细胞属于表达独特T细胞受体的扩增克隆。潜伏细胞富集使单细胞转录组分析成为可能，分析了来自6个不同个体的1050个CD4+T细胞。分析显示，这些细胞中大多数是T效应记忆细胞，富含表达HLA-DR、HLA-DP、CD74、CCL5、颗粒酶A和K、半胱氨酸抑制剂F、LYAR和DUSP2。结论是，携带完整HIV-1前病毒的潜伏细胞的扩增克隆优先持续存在于独特的CD4+T细胞群体中，为根除提供了可能性[9]。

综上所述，LYAR在多种生物学过程中发挥重要作用，包括胚胎干细胞自我更新和分化、基因转录调控、细胞增殖和存活以及癌症发生等。LYAR在β-地中海贫血患者中与HbF产生相关，在神经母细胞瘤和结直肠癌中表达上调，与不良预后相关。此外，LYAR还参与调控细胞分化和HIV-1潜伏感染。LYAR的研究有助于深入理解其生物学功能和疾病发生机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献：
1. Zuccato, Cristina, Cosenza, Lucia Carmela, Zurlo, Matteo, Finotti, Alessia, Gambari, Roberto. 2023. The rs368698783 (G>A) Polymorphism Affecting LYAR Binding to the Aγ-Globin Gene Is Associated with High Fetal Hemoglobin (HbF) in β-Thalassemia Erythroid Precursor Cells Treated with HbF Inducers. In International journal of molecular sciences, 24, . doi:10.3390/ijms24010776. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36614221/
2. Ju, Junyi, Wang, Ying, Liu, Ronghua, Jane, Stephen M, Zhao, Quan. 2014. Human fetal globin gene expression is regulated by LYAR. In Nucleic acids research, 42, 9740-52. doi:10.1093/nar/gku718. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25092918/
3. Sun, Yuting, Atmadibrata, Bernard, Yu, Denise, Liu, Pei Y, Liu, Tao. 2017. Upregulation of LYAR induces neuroblastoma cell proliferation and survival. In Cell death and differentiation, 24, 1645-1654. doi:10.1038/cdd.2017.98. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28686580/
4. Wu, Yupeng, Liu, Ming, Li, Zhuchen, Wang, Ming-Rong, Zhao, Quan. . LYAR promotes colorectal cancer cell mobility by activating galectin-1 expression. In Oncotarget, 6, 32890-901. doi:10.18632/oncotarget.5335. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26413750/
5. Chen, Linlin, Jin, Congwen, Liu, Hao, Li, Zhengdong, Zhang, Jiasheng. . Analysis of the role of Ly-1 antibody reactive in different cancer types. In Bioengineered, 12, 9452-9462. doi:10.1080/21655979.2021.1995100. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34696677/
6. Wu, Yupeng, Zhou, Yu, Gao, Haiying, Song, Xiaoyuan, Ma, Sai. 2021. LYAR Promotes Colorectal Cancer Progression by Upregulating FSCN1 Expression and Fatty Acid Metabolism. In Oxidative medicine and cellular longevity, 2021, 9979707. doi:10.1155/2021/9979707. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35069968/
7. Wang, Guan, Fulkerson, Christopher M, Malek, Reem, Snyder, Paul W, Mendrysa, Susan M. 2012. Mutations in Lyar and p53 are synergistically lethal in female mice. In Birth defects research. Part A, Clinical and molecular teratology, 94, 729-37. doi:10.1002/bdra.23048. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22815056/
8. Luna-Peláez, Noelia, García-Domínguez, Mario. 2018. Lyar-Mediated Recruitment of Brd2 to the Chromatin Attenuates Nanog Downregulation Following Induction of Differentiation. In Journal of molecular biology, 430, 1084-1097. doi:10.1016/j.jmb.2018.02.023. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29505757/
9. Weymar, Georg H J, Bar-On, Yotam, Oliveira, Thiago Y, Jankovic, Mila, Nussenzweig, Michel C. . Distinct gene expression by expanded clones of quiescent memory CD4+ T cells harboring intact latent HIV-1 proviruses. In Cell reports, 40, 111311. doi:10.1016/j.celrep.2022.111311. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36070690/

资料下载

S-CKO-03537_6J_17089_Lyar_Exon 3_A_strategy.pdf
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