Ubn1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Ubn1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-03468

品系全称

C57BL/6JCya-Ubn1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-170644-Ubn1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ubn1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-03468) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
ubinuclein 1
基因别称
1110029L11Rik,2610108L02Rik
染色体号
Chr 16 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_026666.4 | Ensembl: ENSMUST00000052449
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 9
敲除长度
~571 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Ubn1,也称为Ubinuclein 1,是一种在哺乳动物中高度保守的蛋白质,属于HIRA/UBN1/ASF1a(HUCA)组蛋白H3.3伴侣复合物的成员之一。该复合物在将组蛋白变体H3.3沉积到染色质中起着关键作用,这一过程独立于DNA复制,并且与基因激活、抑制以及染色质组装等多种染色质调控事件相关[5]。H3.3是一种古老的、保守的H3变体,在转录调控中发挥着重要作用。HIRA复合物由HIRA、UBN1或UBN2和CABIN1组成,是一种H3.3特异性伴侣复合物[2]。UBN1在H3.3的特异识别和直接结合中起着主要作用,而HIRA亚基可以增强UBN1对H3.3的亲和力,CABIN1亚基则不能[2]。UBN1和UBN2具有与酵母Hpc2p相似的Hpc2相关结构域,这个结构域直接与HIRA/Hir的N端WD重复结构域相互作用,并参与异染色质化过程[4]。

在B细胞中,UBN1与激活诱导的胞嘧啶脱氨酶(AID)相互作用。AID是抗体多样化的关键介质,通过体细胞超突变(SHM)和类别转换重组(CSR)过程介导B细胞中的抗体多样化。研究表明,UBN1与AID的相互作用对于SHM和CSR过程至关重要[1]。此外,UBN1还与SRSF1-3相互作用,SRSF1-3是SRSF1的一个剪接异构体,对于AID依赖的SHM的IgV基因至关重要。SRSF1-3通过上调转录因子SATB2和染色质调节因子UBN1,以及促进组蛋白变体H3.3在IgL启动子区域的富集,来控制IgV基因的转录[3]。

UBN1在细胞衰老过程中也发挥着重要作用。衰老细胞中,UBN1与组蛋白甲基转移酶相互作用,甲基化组蛋白H3的赖氨酸9位,形成衰老相关的异染色质焦点(SAHF),从而抑制促进增殖的基因的表达[4]。UBN1与HIRA复合物一起,在神经分化过程中调节H3.3在发育基因启动子的沉积,这对于基因的激活至关重要[2]。

此外,UBN1还参与抑制胚胎干细胞中逆转座子的表达。逆转座子是一类具有转座能力的DNA序列,它们的异常表达可能导致基因组的重排和疾病的发生。UBN1和HIRA复合物成员在调节逆转座子的表达中发挥着重要作用,通过调节H3.3的沉积和组蛋白修饰来抑制逆转座子的表达[6]。

综上所述,UBN1是一种在多种生物学过程中发挥重要作用的蛋白质。它参与调节H3.3的沉积,影响基因表达和染色质结构。UBN1在B细胞中的抗体多样化、细胞衰老、神经分化和胚胎干细胞发育等多个过程中发挥着重要作用。UBN1的研究有助于我们深入理解染色质调控的机制和生物学功能,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Jaiswal, Ankit, Roy, Rajarshi, Tamrakar, Anubhav, Kar, Parimal, Kodgire, Prashant. 2023. Activation-induced cytidine deaminase an antibody diversification enzyme interacts with chromatin modifier UBN1 in B-cells. In Scientific reports, 13, 19615. doi:10.1038/s41598-023-46448-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37949972/
2. Xiong, Chaoyang, Wen, Zengqi, Yu, Juan, Xu, Rui-Ming, Li, Guohong. 2018. UBN1/2 of HIRA complex is responsible for recognition and deposition of H3.3 at cis-regulatory elements of genes in mouse ES cells. In BMC biology, 16, 110. doi:10.1186/s12915-018-0573-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30285846/
3. Singh, Amit Kumar, Tamrakar, Anubhav, Jaiswal, Ankit, Kanayama, Naoki, Kodgire, Prashant. 2020. SRSF1-3, a splicing and somatic hypermutation regulator, controls transcription of IgV genes via chromatin regulators SATB2, UBN1 and histone variant H3.3. In Molecular immunology, 119, 69-82. doi:10.1016/j.molimm.2020.01.005. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31986311/
4. Banumathy, Gowrishankar, Somaiah, Neeta, Zhang, Rugang, Marmorstein, Ronen, Adams, Peter D. 2008. Human UBN1 is an ortholog of yeast Hpc2p and has an essential role in the HIRA/ASF1a chromatin-remodeling pathway in senescent cells. In Molecular and cellular biology, 29, 758-70. doi:10.1128/MCB.01047-08. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19029251/
5. Rai, Taranjit Singh, Puri, Aastha, McBryan, Tony, Schultz, David C, Adams, Peter D. 2011. Human CABIN1 is a functional member of the human HIRA/UBN1/ASF1a histone H3.3 chaperone complex. In Molecular and cellular biology, 31, 4107-18. doi:10.1128/MCB.05546-11. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21807893/
6. Zhang, Miao, Zhao, Xin, Feng, Xiao, Lu, Wange, Lu, Xinyi. 2022. Histone chaperone HIRA complex regulates retrotransposons in embryonic stem cells. In Stem cell research & therapy, 13, 137. doi:10.1186/s13287-022-02814-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35365225/