Snx18-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Snx18-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-03462

品系全称

C57BL/6JCya-Snx18em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-170625-Snx18-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Snx18-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-03462) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
sorting nexin 18
基因别称
Snag1
染色体号
Chr 13 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_130796 | Ensembl: ENSMUST00000109241
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~3.1 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Snx18,也称为Sorting nexin 18,是一种包含SH3-PX-BAR结构域的蛋白质,属于sorting nexin家族。该家族的成员在细胞内起着重要的调节作用,参与调控内吞途径的膜转运过程。Snx18在细胞内的定位和功能具有动态性,且在多种生物学过程中发挥着重要作用。

在Salmonella Typhimurium(S. Typhimurium)入侵上皮细胞的过程中,Snx18被证明是一个关键因素。S. Typhimurium通过其III型分泌系统将毒性蛋白质传递到宿主细胞膜上,诱导巨胞饮作用以进入细胞。研究显示,S. Typhimurium在定植于细胞膜后,迅速招募细胞质中的Snx18到细菌诱导的膜褶皱和新生成的沙门氏菌内吞小泡。Snx18的招募需要沙门氏菌效应蛋白SopB的肌醇磷酸酶活性以及Snx18的PX结构域中的完整磷脂酰肌醇结合位点,但与Rho-GTPases Rac1和Cdc42的激活无关。Snx18通过其SH3结构域作为支架,招募Dynamin-2和N-WASP,从而促进SCV从质膜的形成。定量细菌摄取实验表明,Snx18的过表达增加了细菌的内化,而在过表达磷脂酰肌醇结合位点突变的R303Q、ΔSH3突变体以及Snx18内源水平敲低细胞中,细菌内化水平显著降低。这一研究揭示了Snx18是SopB的一个新靶点,并表明S. Typhimurium通过在入侵部位局部操纵磷脂酰肌醇组成来与宿主因子相互作用,从而协调内化过程[1]。

Snx18在神经系统中也发挥着重要作用。研究发现,Snx18在鸡和小鼠胚胎脊髓中正在分化的运动神经元中特异性表达。在胚胎脊髓运动神经元中,Snx18的表达是短暂的,随着神经元的成熟而下调。进一步的研究表明,EGFP-SNX18在生长锥中的定位是动态调节的,尤其是在与允许性底物接触的区域积累。这些发现表明,Snx18可能在轴突延长中发挥积极作用[2]。

在Notch信号传导过程中,Snx18也发挥着关键作用。Notch信号调节正常发育和组织稳态。配体内吞在Notch信号激活中起着关键作用。内吞蛋白如epsin和dynamin参与Notch配体活性,通过介导Notch配体内吞。泛素连接酶Mib1也通过Notch配体泛素化在Notch信号传导中发挥着重要作用。研究发现,Mib1参与dynamin 2的招募到Dll1,而Snx18与dynamin 2相互作用,适度调节Dll1的内吞。此外,Mib1的泛素连接酶活性被Notch配体-受体相互作用所诱导。Mib1以泛素连接酶活性依赖的方式促进dynamin 2与Snx18之间的相互作用。这些结果表明,Mib1通过调节Snx18和dynamin 2之间的相互作用来调节dynamin的招募,从而有助于确保Notch配体的高效信号传导活性[3]。

Snx18还与HIV-1辅助蛋白Nef相互作用。HIV-1的Nef蛋白与多种细胞蛋白相互作用,操纵宿主膜转运机制以逃避免疫监视。使用一种名为病毒双分子荧光互补(viral BiFC)的新型病毒BiFC技术,研究发现Nef与宿主膜转运蛋白PACS-1的相互作用,并将这种复合物定位到LAMP-1阳性内溶体小泡中。此外,viral BiFC还定位了Nef/MHC-I相互作用到一个AP-1阳性的内体隔室中。最后,viral BiFC观察到Nef与膜转运调节因子SNX18之间的相互作用,并定位到AP-1阳性小泡中。这项研究展示了viral BiFC作为一种独特的工具,用于分析Nef与宿主细胞蛋白之间的相互作用,并通过在病毒感染过程中映射这些相互作用的亚细胞定位[4]。

此外,Snx18还与ADAM9的细胞表面水平调节有关。ADAM9是跨膜ADAMs家族的活性成员,参与骨形成和视网膜新生血管化等过程。ADAM9的表达与人类癌症的疾病阶段和不良预后相关。研究发现,ADAM9经历构成型网格蛋白依赖性内吞作用,随后进行降解或循环回到质膜。Snx18与ADAM9的相互作用对ADAM9内吞或循环没有明显影响,但Snx9和Snx18的双重敲低显著降低了ADAM9的内吞。此外,Snx9敲低揭示了Snx9在ADAM9蛋白水平调节中的非冗余作用,导致细胞表面ADAM9水平升高,并伴随着Ephrin受体B4的脱落增加。这些发现表明,细胞内Snx9介导的转运构成了ADAM9调节的一个重要途径[5]。

Snx18在细胞形态发生中也发挥着重要作用。在果蝇中,Snx9家族由一个基因sh3px1编码,该家族包括三个旁系同源物:Snx9、Snx18和Snx33。Snx9含有N-末端的Sh3结构域,并通过该结构域与Dynamin和肌动蛋白核化因子相互作用。除了Sh3结构域外,Snx9还包含C-末端的BAR结构域。BAR结构域已知可以感知和/或诱导膜曲率。除了内吞作用外,最近的研究还表明,Snx9家族参与自噬、巨胞饮作用、吞噬作用和有丝分裂等多样过程。研究发现,从果蝇Schneider 2(S2)细胞中耗尽Sh3px1导致缺陷的片状伪足形成。此外,过表达Sh3px1在S2细胞中导致管状结构和长突起的形成。这些结构的形成需要Sh3px1的C端BAR结构域以及相邻的Phox同源(PX)结构域。此外,Sh3px1有效地形成突起需要肌动蛋白核化因子Wasp。在S2细胞中过表达哺乳动物同源物Snx18和Snx33也生成了管状结构和突起。相比之下,过表达Snx9主要诱导长管状结构[6]。

此外,Snx18还与Botrylloides leachi(被囊类动物)的冬眠状态相关。研究发现,冬眠的Botrylloides leachi在形态、细胞和分子水平上发生了变化。冬眠的Botrylloides leachi的基因表达谱与活跃的Botrylloides leachi存在显著差异。在冬眠的Botrylloides leachi中,观察到233个上调基因,包括NR4A2、EGR1、MUC5AC、HMCN2和SNX18。此外,27个转录因子在冬眠的Botrylloides leachi中上调,包括ELK1、HDAC3、RBMX、MAZ、STAT1、STAT4和STAT6。有趣的是,在冬眠的Botrylloides leachi中也观察到发育过程中涉及基因的上调,如SPIRE1、RHOA、SOX11、WNT5A和SNX18。进一步的研究通过qPCR验证了22个基因在冬眠过程中的失调。免疫组化发现,这些基因在循环细胞中表达较高。WNT激动剂处理导致80%的冬眠Botrylloides leachi早期苏醒,而在活跃的Botrylloides leachi中,WNT激动剂触发了冬眠状态[7]。

在系统性红斑狼疮(lupus)患者中,Snx18的DNA甲基化水平与疾病活动度相关。研究发现,DNA甲基化水平在2个CpG位点与lupus疾病活动度的变化显著相关。在非洲裔美国患者中,随着疾病活动度的增加,观察到SNX18的进行性脱甲基。此外,位于GALNT18内的一个CpG位点的脱甲基与活动性lupus肾炎的发生相关。非洲裔美国人和欧洲裔美国lupus患者之间差异甲基化的基因包括I型干扰素反应基因,如IRF7和IFI44,以及与NF-κB通路相关的基因。TREML4在TLR信号传导中发挥重要作用,在非洲裔美国患者中低甲基化,并在研究中鉴定的8855个顺式-甲基化数量性状位点(cis-meQTL)关联中表现出强烈的顺式-meQTL效应[8]。

在抑郁症患者中,Snx18与睡眠障碍相关。睡眠障碍影响约75%的抑郁症患者,并与患者预后较差相关。研究发现,在标准GWAS芯片数据中,SNX18附近的一个间基因标记与睡眠变化相关(p = 1.06 × 10-6)。此外,在假设驱动的分析中,Neuronal PAS结构域蛋白2的rs13019460与睡眠变化相关(p = 0.0009)。尽管在适度样本中没有检测到显著的关联,但仍然发现了一些有趣的初步关联,值得进一步探索[9]。

最后,Snx18与微绒毛包涵体病(MVID)的发生相关。研究发现,MYO5B的失活突变导致严重的先天性腹泻。在CaCo2-BBE细胞中稳定敲低MYO5B导致微绒毛丢失、连接蛋白的改变以及顶膜和基底外侧转运的破坏,但没有观察到微绒毛包涵体。过表达野生型MYO5B恢复了MYO5B敲低细胞的微绒毛,而过表达MVID相关突变体MYO5B-P660L没有挽救MYO5B敲低表型,反而诱导了微绒毛包涵体的形成。微绒毛的形成需要RAB8A和MYO5B之间的相互作用,而RAB11A和MYO5B之间的相互作用丧失导致微绒毛包涵体的形成。使用表面生物素化和双免疫荧光染色在MYO5B敲低细胞中发现,早期微绒毛包涵体对分选标记SNX18呈阳性,并来源于顶膜内吞。在MVID患者中,MYO5B-P660L导致绒毛尖端的极性发生全局变化,这可能导致MVID的临床表型,即新生儿分泌性腹泻[10]。

综上所述,Snx18是一种重要的sorting nexin家族成员,在多种生物学过程中发挥着重要作用。Snx18参与调节内吞途径的膜转运,与细菌入侵、神经发育、Notch信号传导、细胞形态发生、冬眠状态、系统性红斑狼疮、睡眠障碍和微绒毛包涵体病的发生密切相关。Snx18的研究有助于深入理解细胞内膜转运的机制和功能,以及其在多种疾病发生中的作用,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Liebl, David, Qi, Xiaying, Zhe, Yang, Barnett, Timothy C, Teasdale, Rohan D. 2017. SopB-Mediated Recruitment of SNX18 Facilitates Salmonella Typhimurium Internalization by the Host Cell. In Frontiers in cellular and infection microbiology, 7, 257. doi:10.3389/fcimb.2017.00257. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28664153/
2. Nakazawa, Shiori, Gotoh, Naoya, Matsumoto, Hirotaka, Suzuki, Toshiharu, Yamamoto, Tohru. . Expression of sorting nexin 18 (SNX18) is dynamically regulated in developing spinal motor neurons. In The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society, 59, 202-13. doi:10.1369/0022155410392231. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21339182/
3. Okano, Makoto, Matsuo, Hiromi, Nishimura, Yuya, Tonoki, Ayako, Itoh, Motoyuki. 2016. Mib1 modulates dynamin 2 recruitment via Snx18 to promote Dll1 endocytosis for efficient Notch signaling. In Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms, 21, 425-41. doi:10.1111/gtc.12350. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26923255/
4. Dirk, Brennan S, Jacob, Rajesh Abraham, Johnson, Aaron L, Haeryfar, S M Mansour, Dikeakos, Jimmy D. 2015. Viral bimolecular fluorescence complementation: a novel tool to study intracellular vesicular trafficking pathways. In PloS one, 10, e0125619. doi:10.1371/journal.pone.0125619. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25915798/
5. Mygind, Kasper J, Störiko, Theresa, Freiberg, Marie L, Andersen, Olav M, Kveiborg, Marie. 2018. Sorting nexin 9 (SNX9) regulates levels of the transmembrane ADAM9 at the cell surface. In The Journal of biological chemistry, 293, 8077-8088. doi:10.1074/jbc.RA117.001077. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29622675/
6. Hicks, Lawrence, Liu, Guojun, Ukken, Fiona P, O'Connor-Giles, Kate, Gonsalvez, Graydon B. 2015. Depletion or over-expression of Sh3px1 results in dramatic changes in cell morphology. In Biology open, 4, 1448-61. doi:10.1242/bio.013755. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26459243/
7. Hyams, Yosef, Panov, Julia, Rosner, Amalia, Rinkevich, Yuval, Rinkevich, Baruch. 2022. Transcriptome landscapes that signify Botrylloides leachi (Ascidiacea) torpor states. In Developmental biology, 490, 22-36. doi:10.1016/j.ydbio.2022.06.005. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35809632/
8. Coit, Patrick, Ortiz-Fernandez, Lourdes, Lewis, Emily E, Maksimowicz-McKinnon, Kathleen, Sawalha, Amr H. 2020. A longitudinal and transancestral analysis of DNA methylation patterns and disease activity in lupus patients. In JCI insight, 5, . doi:10.1172/jci.insight.143654. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33108347/
9. Melhuish Beaupre, Lindsay M, Gonçalves, Vanessa F, Zai, Clement C, Müller, Daniel J, Kennedy, James L. 2020. Genome-Wide Association Study of Sleep Disturbances in Depressive Disorders. In Molecular neuropsychiatry, 5, 34-43. doi:10.1159/000505804. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32399468/
10. Knowles, Byron C, Roland, Joseph T, Krishnan, Moorthy, Goldenring, James R, Shub, Mitchell D. 2014. Myosin Vb uncoupling from RAB8A and RAB11A elicits microvillus inclusion disease. In The Journal of clinical investigation, 124, 2947-62. doi:10.1172/JCI71651. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24892806/