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Lig1-flox 基因敲除小鼠

Lig1-flox 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Lig1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-03397

品系全称

C57BL/6JCya-Lig1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-16881-Lig1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Lig1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-03397) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
ligase I, DNA, ATP-dependent
基因别称
LigI
染色体号
Chr 7 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_001199310.2 | Ensembl: ENSMUST00000177588
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 4
敲除长度
~636 bp
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:101789Mice homozygous for a null allele exhibit impaired fetal hematopoiesis, develop anemia, and die by E16.5.
更多信息
Lig1，即DNA连接酶I，是一种在哺乳动物细胞中发现的四种DNA连接酶之一。它位于19号染色体上的19q13.2-13.3区域，并参与了DNA损伤修复过程，这对于维持基因组稳定性和细胞生存至关重要。Lig1主要参与非同源末端连接（NHEJ）途径，这是一种修复DNA双链断裂的主要机制。它还参与了其他DNA修复途径，如碱基切除修复（BER）、错配修复（MMR）和核苷酸切除修复（NER）。Lig1的功能是通过连接DNA链的断裂末端来修复DNA损伤，这对于维持基因组完整性和细胞生存至关重要。Lig1的表达和活性受到多种因素的调控，包括DNA损伤、细胞周期和转录因子等。Lig1的异常表达和突变与多种癌症的发生和发展有关，因此它被认为是癌症治疗的重要靶点。

在胰腺导管腺癌（PDAC）中，hsa_circ_0007919是一种高度表达的环状RNA，其高表达与PDAC患者的总体生存期和疾病无进展生存期较差相关。hsa_circ_0007919通过Lig1依赖性方式抑制GEM引起的DNA损伤、DNA断裂积累和细胞凋亡，以维持细胞存活。hsa_circ_0007919通过与FOXA1和TET1结合，降低Lig1启动子的甲基化水平，增加其转录，从而促进BER、MMR和NER。此外，GEM增强了QKI与hsa_circ_0007919前mRNA内含子的结合，促进其剪接和环化，从而生成hsa_circ_0007919。hsa_circ_0007919通过增强Lig1依赖性DNA损伤修复来促进GEM耐药性，以维持细胞存活。因此，针对hsa_circ_0007919和DNA损伤修复途径可能成为PDAC的治疗策略[1]。

在 triple-negative乳腺癌（TNBC）中，Lig1基因的缺失或低mRNA表达水平与缺乏病理完全反应、更高的染色体不稳定性指数（CIN）和较差的预后相关。Lig1基因缺失与TNBC的卡铂选择性耐药相关。在TNBC肿瘤中，19q13.31-33的体细胞缺失与缺乏病理反应、卡铂选择性耐药和泛癌研究中较差的预后和CIN相关。因此，Lig1基因的缺失或低表达与TNBC对化疗的耐药性和较差的预后相关[2]。

在膀胱癌中，Lig1的表达上调与不良的总体生存期相关。Lig1的升高与DNA复制、细胞衰老、细胞周期和p53信号通路等关键功能相关。Lig1的突变景观在Lig1高表达和低表达组之间显著不同。免疫浸润分析表明，Lig1在膀胱癌微环境中免疫细胞募集和免疫调节中起着关键作用，从而影响预后。功能实验进一步证实了Lig1在膀胱癌发生发展中的重要性。因此，Lig1可能是膀胱癌进展的风险生物标志物[3]。

在肺癌中，Lig1基因多态性rs156641与肺癌风险增加相关。Lig1基因的缺失或低mRNA表达水平与缺乏病理完全反应、更高的CIN和较差的预后相关。SRSF1通过增加Lig1 mRNA的稳定性和增强其翻译来调节Lig1的表达。Lig1的表达是NSCLC的独立预后因素。Lig1缺失的细胞对PARPi更敏感。因此，Lig1在肺癌的发生、发展和化疗耐药性中发挥重要作用[4][5][6][7]。

在印度人群中，Lig1基因的多态性与Lig1 mRNA的表达相关，可能影响其功能。Lig1基因的多态性在印度人群中具有独特的特征，与其他主要世界人群相比存在显著差异。因此，在研究Lig1基因的遗传关联时，应考虑印度人群的独特性[8]。

在亨廷顿病（HD）中，降低MMR基因（包括Lig1）的表达可以有效地减缓HTT CAG重复的扩展。这表明Lig1在HD的发生和发展中发挥重要作用，并可能成为HD治疗的潜在靶点[9]。

综上所述，Lig1在DNA损伤修复和多种癌症的发生、发展和化疗耐药性中发挥重要作用。Lig1的表达和活性受到多种因素的调控，包括DNA损伤、细胞周期和转录因子等。Lig1的异常表达和突变与多种癌症的发生和发展有关，因此它被认为是癌症治疗的重要靶点。针对Lig1和DNA损伤修复途径的治疗策略可能为多种癌症的治疗提供新的思路和策略。

参考文献：
1. Xu, Lei, Ma, Xiao, Zhang, Xiuzhong, Ren, Zeqiang, Zhang, Pengbo. 2023. hsa_circ_0007919 induces LIG1 transcription by binding to FOXA1/TET1 to enhance the DNA damage response and promote gemcitabine resistance in pancreatic ductal adenocarcinoma. In Molecular cancer, 22, 195. doi:10.1186/s12943-023-01887-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38044421/
2. Anurag, Meenakshi, Jaehnig, Eric J, Krug, Karsten, Satpathy, Shankha, Ellis, Matthew J. . Proteogenomic Markers of Chemotherapy Resistance and Response in Triple-Negative Breast Cancer. In Cancer discovery, 12, 2586-2605. doi:10.1158/2159-8290.CD-22-0200. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36001024/
3. Song, Ding-Ming, Shen, Tong, Feng, Kun, Tong, Ming, Jin, Yanyang. 2024. LIG1 is a novel marker for bladder cancer prognosis: evidence based on experimental studies, machine learning and single-cell sequencing. In Frontiers in immunology, 15, 1419126. doi:10.3389/fimmu.2024.1419126. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39234248/
4. Li, Dan, Li, Ruoran, Zhang, Jinghao, Li, Ke, Wu, Yanmin. . Association Between the LIG1 Polymorphisms and Lung Cancer Risk: A Meta-analysis of Case-Control Studies. In Cell biochemistry and biophysics, 73, 381-387. doi:10.1007/s12013-015-0619-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27352326/
5. Martínez-Terroba, Elena, Ezponda, Teresa, Bértolo, Cristina, Montuenga, Luis M, Pajares, María J. 2018. The oncogenic RNA-binding protein SRSF1 regulates LIG1 in non-small cell lung cancer. In Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology, 98, 1562-1574. doi:10.1038/s41374-018-0128-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30181552/
6. Fracassi, Giulia, Lorenzin, Francesca, Orlando, Francesco, Mateo, Joaquin, Demichelis, Francesca. 2024. CRISPR/Cas9 screens identify LIG1 as a sensitizer of PARP inhibitors in castration-resistant prostate cancer. In The Journal of clinical investigation, 135, . doi:10.1172/JCI179393. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39718835/
7. Saini, Divyalakshmi, Sudheer, K R, Kumar, P R Vivek, Jaikrishan, G, Das, Birajalaxmi. 2020. Evaluation of the influence of chronic low-dose radiation on DNA repair gene polymorphisms [XRCC1, XRCC3, PRKDC (XRCC7), LIG1, NEIL1] in individuals from normal and high level natural radiation areas of Kerala Coast. In International journal of radiation biology, 96, 734-739. doi:10.1080/09553002.2020.1739771. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32149571/
8. Kroneder, R, Cashmore, A R, Marwan, W. . Phytochrome-induced expression of lig1, a homologue of the fission yeast cell-cycle checkpoint gene hus1, is associated with the developmental switch in Physarum polycephalum plasmodia. In Current genetics, 36, 86-93. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/10447599/
9. Ferguson, Ross, Goold, Robert, Coupland, Lucy, Flower, Michael, Tabrizi, Sarah J. 2024. Therapeutic validation of MMR-associated genetic modifiers in a human ex vivo model of Huntington disease. In American journal of human genetics, 111, 1165-1183. doi:10.1016/j.ajhg.2024.04.015. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38749429/

资料下载

S-CKO-03397_6J_16881_Lig1_Exon 4_A_strategy.pdf
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