Gypa-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Gypa-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-02804

品系全称

C57BL/6JCya-Gypaem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-14934-Gypa-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Gypa-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-02804) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
glycophorin A
基因别称
CD235a,GPA
染色体号
Chr 8 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_010369 | Ensembl: ENSMUST00000063359
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 5~6
敲除长度
~2.7 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:95880Mice homozygous for a targeted null mutation are viable and fertile; however, mutant erythrocytes had a reduced percentage of O-linked glycoproteins in the membranes, and were sensitive to hypoosmotic stress.
GYPA,也称为Glycophorin A,是人类MN血型抗原的编码基因。MN血型抗原是红细胞中最丰富的唾液酸糖蛋白,其分布和变异受到自然选择和人口遗传学因素的影响。GYPA基因编码的GPA蛋白是疟原虫Plasmodium falciparum的主要结合位点,疟疾是影响人类进化历史的主要选择压力之一。研究发现,GYPA基因在疟疾流行地区和欧洲人群经历了平衡选择,而在东亚、大洋洲和美洲人群中没有发现这种证据。这表明GYPA基因的进化历史可能更为复杂,不同地区的自然选择压力对其产生了不同的影响[1]。

GYPA基因与其他基因,如GYPB和GYPE,在染色体上紧密相邻,并且序列高度相似,这导致了基因转换事件的发生,形成了GP混合基因。这些混合基因可能导致血型分型与血凝集结果不一致。例如,研究人员发现了一种GYPA-B-A混合基因,可能是由于单个不等同源重组事件产生的。这种混合基因可能导致某些血型的表型异常[2]。

MNS血型相关基因,包括GYPA、GYPB和GYPE,具有明显的多态性。研究表明,这些基因的mRNA全长序列在个体之间存在差异,例如GYPA基因的exon-6和GYPB基因的exon-2可能完全缺失,而GYPB基因的exon-5可能存在碱基替换。这些变异可能影响血型抗原的表达和功能[3]。

GYPA基因的变异也可能影响与疟疾相关的感染性疾病。研究发现,GYPA基因的DUP4等位基因编码的Dantu NE血型对疟疾具有强保护作用,因为它改变了红细胞膜表面的张力。此外,GYPA基因的变异还可能与其他病原体,如病毒和疟原虫Plasmodium falciparum,相互作用,但其具体作用机制仍需进一步研究[4]。

除了与疟疾相关的感染性疾病,GYPA基因的变异还可能与其他疾病相关。例如,研究发现,GYPA基因的变异可能导致一种独特的变异GPA蛋白,具有蛋白酶抵抗的M抗原。这种变异蛋白的表达在人群中相对罕见,但其具体功能和临床意义尚不清楚[5]。

此外,GYPA基因的变异还可能导致新的血型抗原的产生。例如,研究发现了一种新的低频抗原SUMI,它位于GYPA基因编码的GPA蛋白上。这种抗原对神经氨酸酶敏感,但对α-糜蛋白酶和硫醇还原剂具有抗性。这种抗原的产生可能与GYPA基因的c.91A>C(p.Thr31Pro)突变有关,该突变可能消除了O-糖基化附着位点[6]。

GYPA基因的变异还可能与其他疾病相关。例如,研究发现,GYPA基因的变异可能与汉族人群中的MN血型相关。在202个随机样本中,所有样本都在GYPA基因exon 2的1号和56号核苷酸位点上发生了两个碱基替换。这些变异可能与MN血型的表型有关,但具体的机制仍需进一步研究[7]。

GYPA基因的变异还可能与其他疾病相关。例如,研究发现,GYPA基因的表达与败血症的预后相关。通过分析RNA-seq数据,研究人员发现GYPA基因与其他八个基因(SLA2A1、TMCC2、TFRC、RHAG、FKBP1B、KLF1、PILRA和ARL4A)共同构成了败血症的预后模型。这表明GYPA基因可能参与了败血症的发生和发展[8]。

GYPA基因的变异还可能与其他疾病相关。例如,研究发现,GYPA基因的变异可能与骨肉瘤的恶性进展相关。通过分析骨肉瘤相关的微阵列数据,研究人员发现GYPA基因与其他五个基因(ANK1、AHSP、GYPB、KEL和ALAS2)共同构成了骨肉瘤的预后模型。此外,GYPA基因的过表达可以抑制骨肉瘤细胞的增殖、迁移和侵袭,并促进铁死亡。这表明GYPA基因可能参与了骨肉瘤的发生和发展[9]。

GYPA基因的变异还可能与其他疾病相关。例如,研究发现,GYPA基因的结构变异与疟疾相关。通过分析来自世界各地的3234个二倍体基因组,研究人员发现了15个结构变异,并发现了9个新的变异。这些变异可能影响GYPA基因的功能和表达,进而影响疟疾的发生和发展[10]。

综上所述,GYPA基因是一个重要的血型基因,其变异可能影响血型抗原的表达和功能,并与疟疾、败血症和骨肉瘤等疾病的发生和发展相关。GYPA基因的变异可能受到自然选择和人口遗传学因素的影响,其具体机制和临床意义仍需进一步研究。

参考文献:
1. Bigham, Abigail W, Magnaye, Kevin, Dunn, Diane M, Weiss, Robert B, Bamshad, Michael. 2018. Complex signatures of natural selection at GYPA. In Human genetics, 137, 151-160. doi:10.1007/s00439-018-1866-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29362874/
2. Polin, H, Danzer, M, Reiter, A, Weinberger, J, Gabriel, C. 2014. MN typing discrepancies based on GYPA-B-A hybrid. In Vox sanguinis, 107, 393-8. doi:10.1111/vox.12168. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24916810/
3. Liang, Yan-Lian, Wu, Fan, Liang, Shuang, Xu, Yun-Pin, Su, Yu-Qing. . [Polymorphism of the Full-Length mRNA Sequences of MNS blood group-related genes GYPA, GYPB and GYPE]. In Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi, 31, 1537-1542. doi:10.19746/j.cnki.issn.1009-2137.2023.05.045. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37846713/
4. Hollox, Edward J, Louzada, Sandra. 2022. Genetic variation of glycophorins and infectious disease. In Immunogenetics, 75, 201-206. doi:10.1007/s00251-022-01280-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36224278/
5. Tsuneyama, Hatsue, Isa, Kazumi, Watanabe-Okochi, Naoko, Uchikawa, Makoto, Satake, Masahiro. 2020. An unusual variant glycophorin expressing protease-resistant M antigen encoded by the GYPB-E(2-4)-B hybrid gene. In Vox sanguinis, 115, 579-585. doi:10.1111/vox.12918. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32314425/
6. Ito, Shoichi, Kaito, Sayaka, Miyazaki, Toru, Uchikawa, Makoto, Satake, Masahiro. 2020. A new antigen SUMI carried on glycophorin A encoded by the GYPA*M with c.91A>C (p.Thr31Pro) belongs to the MNS blood group system. In Transfusion, 60, 1287-1293. doi:10.1111/trf.15828. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32358867/
7. Liang, Yan-Lian, Zhang, Yan-Yan, Zhuang, Nai-Bao. . [Molecular polymorphism of gypa gene in association with MN human blood group in Chinese Han population]. In Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi, 19, 235-8. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21362260/
8. Tao, Linfeng, Zhou, Yanyou, Wu, Lifang, Liu, Jun. 2024. Comprehensive analysis of sialylation-related genes and construct the prognostic model in sepsis. In Scientific reports, 14, 18110. doi:10.1038/s41598-024-69185-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39103477/
9. Louzada, Sandra, Algady, Walid, Weyell, Eleanor, Yang, Fengtang, Hollox, Edward J. 2020. Structural variation of the malaria-associated human glycophorin A-B-E region. In BMC genomics, 21, 446. doi:10.1186/s12864-020-06849-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32600246/
10. Zhang, Fei, Wan, Junming, Zhong, Jinghua, Mo, Jianwen. 2024. ANK1 inhibits malignant progression of osteosarcoma by promoting ferroptosis. In BMC cancer, 24, 1075. doi:10.1186/s12885-024-12836-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39217322/