Gdap1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Gdap1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-02596

品系全称

C57BL/6JCya-Gdap1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-14545-Gdap1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Gdap1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-02596) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
ganglioside-induced differentiation-associated-protein 1
基因别称
-
染色体号
Chr 1 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_010267 | Ensembl: ENSMUST00000026879
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~1.2 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1338002Mice homozygous for a null allele develop motor deficits and a peripheral neuropathy with loss of motor neurons and abnormal neuromuscular junctions. Cultured motor neurons show large and abnormal mitochondria, reduced axon length, changes in the ER cisternae, and altered calcium ion homeostasis.
GDAP1基因,也称为ganglioside-induced differentiation-associated protein 1,编码一个与多种细胞过程相关的蛋白质。该蛋白质主要在神经元细胞中表达,但在所有细胞中均存在的线粒体中也存在。GDAP1在细胞中的功能包括线粒体分裂、钙稳态和细胞代谢,其在神经元细胞中的表达与神经退行性疾病有关,尤其是在Charcot-Marie-Tooth(CMT)疾病中。CMT是一种遗传性神经退行性疾病,其特征是进行性肌肉萎缩和无力,尤其是在远端肢体。GDAP1基因的突变已被证明与CMT的发生发展密切相关[1]。

GDAP1蛋白是一种非典型的谷胱甘肽S-转移酶(GST),但其GST活性非常有限。尽管GDAP1影响线粒体功能,从而对细胞功能至关重要,但GDAP1相关的CMT疾病主要表现为轴突变性。GDAP1基因的突变可能以隐性或显性方式遗传。GDAP1的功能和其在CMT疾病中的作用机制仍不清楚,需要进一步研究[1]。

GDAP1基因的表达受到表观遗传调控,例如DNA甲基化。研究表明,GDAP1基因启动子区的CpG岛甲基化会抑制其活性。使用甲基转移酶和组蛋白脱乙酰酶(HDAC)抑制剂处理细胞可以诱导GDAP1基因的表达和蛋白水平的升高。这种诱导与启动子去甲基化和组蛋白H3乙酰化水平的升高相关。这表明表观遗传机制可能参与GDAP1基因的表达调控[2]。

为了研究GDAP1基因突变在CMT疾病中的致病作用,研究人员开发了一种基于酵母的模型。在该模型中,野生型和突变型的GDAP1基因在酵母中表达,并研究了其生长速度、线粒体形态和功能。结果表明,GDAP1蛋白在酵母细胞中稳定表达且具有功能,能够影响线粒体的形态和功能,并改变突变型酵母菌株的生长。此外,不同的GDAP1突变体在测试中表现出特定的效应。这表明该模型可以用于验证已知GDAP1突变的致病作用,并可能用于测试CMT患者中发现的未知序列变异体[3]。

GDAP1基因的突变也与子宫内膜异位症有关,这是一种常见的与盆腔疼痛和不孕相关的疾病。基因组关联研究结果表明,GDAP1基因与子宫内膜异位症存在显著关联,其表达或甲基化受到调节,可能与疼痛感知和维持相关。此外,GDAP1基因的突变还与多种疼痛和炎症性疾病相关,包括偏头痛、背痛和多部位慢性疼痛等[4]。

GDAP1基因的突变还可能受到其他基因的修饰。研究发现,JPH1基因是GDAP1相关CMT疾病的修饰基因。JPH1和GDAP1基因形成一个保守的基因簇,并且在脊椎动物中保守。JPH1和GDAP1蛋白在钙稳态中发挥作用,JPH1可以恢复GDAP1沉默细胞中的钙库操作钙进入(SOCE)活性。在GDAP1基因突变的患者中,JPH1基因的突变可以导致更严重的临床表型,并且JPH1和GDAP1共享一个共同的途径,相互依赖[5]。

GDAP1基因的突变还导致线粒体-溶酶体膜接触位点(MCSs)的缺陷。GDAP1是线粒体外膜的一种非典型的GST,参与线粒体与内质网(MAMs)的膜接触。GDAP1的缺失影响基础自噬和LC3和PI3P在自噬体生物合成和膜转运中的生物学。GDAP1还通过与其互作的PYKfyve激酶参与溶酶体的成熟。GDAP1的缺失导致巨大溶酶体、自噬溶酶体重塑延迟和TFEB激活。此外,GDAP1与LAMP-1相互作用,支持GDAP1-LAMP-1是线粒体和溶酶体膜接触的新连接蛋白。GDAP1的缺失减少这些细胞器之间的MCSs,导致线粒体网络异常和细胞谷胱甘肽(GSH)水平降低。补充GSH-MEE足以挽救溶酶体膜和线粒体网络的缺陷,但不能挽救细胞器之间的MCSs和早期自噬事件。这表明GDAP1在维持线粒体MCSs的适当功能中发挥作用,这可能解释GDAP1相关CMT疾病中的原发性损伤[6]。

GDAP1蛋白的保守内分子网络与CMT相关突变和蛋白质稳定性密切相关。GDAP1基因的突变主要影响α螺旋α3、α7和α8,这些区域在GDAP1蛋白的结构中起着重要作用。除了影响Arg310以外的突变外,所有突变都会降低GDAP1蛋白的热稳定性。生物信息学分析表明,许多已知的CMT突变位点涉及保守残基或与它们相互作用。GDAP1蛋白中的α6-α7环在保守的相互作用网络中起着核心作用,对GDAP1蛋白的稳定性至关重要。这表明GDAP1蛋白中保守的相互作用网络的改变可能导致GDAP1的稳定性和功能受损,最终导致线粒体功能障碍、蛋白质-蛋白质相互作用受损和神经元变性[7]。

综上所述,GDAP1基因编码一个在多种细胞过程中发挥重要作用的蛋白质。GDAP1基因的突变与CMT疾病的发生发展密切相关,其致病机制涉及线粒体功能障碍、钙稳态改变和细胞代谢异常。此外,GDAP1基因的表达受到表观遗传调控,并且可能受到其他基因的修饰。GDAP1基因的研究有助于深入理解CMT疾病的发病机制,并为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Rzepnikowska, Weronika, Kochański, Andrzej. . A role for the GDAP1 gene in the molecular pathogenesis of Charcot‑Marie‑Tooth disease. In Acta neurobiologiae experimentalis, 78, 1-13. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29694336/
2. Karaś, Kaja, Pastwińska, Joanna, Sałkowska, Anna, Karwaciak, Iwona, Ratajewski, Marcin. 2024. Epigenetic regulation of the human GDAP1 gene. In Biochemistry and biophysics reports, 40, 101827. doi:10.1016/j.bbrep.2024.101827. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39328838/
3. Rzepnikowska, Weronika, Kaminska, Joanna, Kabzińska, Dagmara, Kochański, Andrzej. 2020. Pathogenic Effect of GDAP1 Gene Mutations in a Yeast Model. In Genes, 11, . doi:10.3390/genes11030310. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32183277/
4. Rahmioglu, Nilufer, Mortlock, Sally, Ghiasi, Marzieh, Morris, Andrew P, Zondervan, Krina T. 2023. The genetic basis of endometriosis and comorbidity with other pain and inflammatory conditions. In Nature genetics, 55, 423-436. doi:10.1038/s41588-023-01323-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36914876/
5. Pla-Martín, David, Calpena, Eduardo, Lupo, Vincenzo, Palau, Francesc, Espinós, Carmen. 2014. Junctophilin-1 is a modifier gene of GDAP1-related Charcot-Marie-Tooth disease. In Human molecular genetics, 24, 213-29. doi:10.1093/hmg/ddu440. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25168384/
6. Cantarero, Lara, Juárez-Escoto, Elena, Civera-Tregón, Azahara, Hoenicka, Janet, Palau, Francesc. . Mitochondria-lysosome membrane contacts are defective in GDAP1-related Charcot-Marie-Tooth disease. In Human molecular genetics, 29, 3589-3605. doi:10.1093/hmg/ddaa243. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33372681/
7. Sutinen, Aleksi, Paffenholz, Dirk, Nguyen, Giang Thi Tuyet, Torda, Andrew E, Kursula, Petri. 2023. Conserved intramolecular networks in GDAP1 are closely connected to CMT-linked mutations and protein stability. In PloS one, 18, e0284532. doi:10.1371/journal.pone.0284532. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37058526/