Ddx19a-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Ddx19a-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-02175

品系全称

C57BL/6JCya-Ddx19aem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-13680-Ddx19a-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ddx19a-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-02175) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
DEAD box helicase 19a
基因别称
DBP5,Ddx19,Eif4a-rs1
染色体号
Chr 8 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_007916.2 | Ensembl: ENSMUST00000040416
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 4
敲除长度
~636 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:99526Homozygous knockout is embryonic lethal.
DDX19A,也称为DEAD-box helicase 19A,是一种重要的DEAD-box RNA解旋酶。DEAD-box RNA解旋酶是一类RNA结合蛋白,它们具有ATP依赖的解旋活性,能够解开RNA双链结构,参与RNA的多种生物学过程,包括转录、剪接、转运和降解。DDX19A在细胞中发挥多种功能,包括mRNA的核输出、R-loop的清除和基因表达的调控。

在mRNA的核输出过程中,mRNA转录本在细胞核内经过加工和修饰后,与一系列RNA结合蛋白(RBPs)结合,形成成熟的信使核糖核蛋白颗粒(mRNPs)。这些mRNPs需要通过核孔复合物(NPC)输出到细胞质中进行翻译。在这个过程中,DDX19A在mRNPs的胞质侧发挥作用,通过去除一部分RNA结合蛋白,终止mRNPs的输出。这一过程需要DDX19A的RNA依赖性ATP酶活性和与Gle1和Nup214的动态相互作用。研究表明,DDX19A在K26位点发生SUMO化修饰,增强了其与Gle1的相互作用,从而影响mRNA的核输出[3]。

R-loop是由DNA和RNA形成的杂合结构,在转录过程中产生。R-loop在细胞中发挥多种功能,包括调控基因表达和维持基因组稳定性。然而,过量的R-loop可能导致基因组不稳定和细胞功能障碍。DDX19A能够结合到H3K27me3上,并通过去除转录启动子区域的R-loop,促进基因沉默。DDX19A的缺失导致R-loop积累和LSD1介导的基因沉默减少[1]。此外,DDX19A还参与调节let-7b-5p的表达,抑制卵巢癌细胞的增殖和干细胞特性[2]。

DDX19A在多种癌症中发挥重要作用,包括卵巢癌、头颈癌和乳腺癌。在卵巢癌中,DDX19A的表达下调,而let-7b-5p的表达上调。let-7b-5p靶向DDX19A,抑制其表达,从而促进卵巢癌细胞的增殖和干细胞特性[2]。在头颈癌中,DDX19A的表达与细胞死亡相关,是预测患者预后的独立因素[4]。在乳腺癌中,DDX19A的表达与肿瘤分级相关,可以作为乳腺癌分类的潜在生物标志物[6]。

此外,DDX19A的基因复制事件发生在哺乳动物分化早期,表明其在进化过程中具有重要的生物学功能。研究表明,DDX19A与TERF2相互作用,参与调控端粒的完整性和基因组稳定性[5]。

综上所述,DDX19A是一种重要的DEAD-box RNA解旋酶,参与mRNA的核输出、R-loop的清除和基因表达的调控。DDX19A在多种癌症中发挥重要作用,可以作为癌症诊断和治疗的潜在靶点。此外,DDX19A的SUMO化修饰和基因复制事件表明其在进化过程中具有重要的生物学功能。

参考文献:
1. Pinter, Sabine, Knodel, Franziska, Choudalakis, Michel, Jeltsch, Albert, Rathert, Philipp. . A functional LSD1 coregulator screen reveals a novel transcriptional regulatory cascade connecting R-loop homeostasis with epigenetic regulation. In Nucleic acids research, 49, 4350-4370. doi:10.1093/nar/gkab180. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33823549/
2. Huang, Xiujuan, Dong, Hongxia, Liu, Yang, Chen, Zhen, Li, Jueying. . Silencing of let-7b-5p inhibits ovarian cancer cell proliferation and stemness characteristics by Asp-Glu-Ala-Asp-box helicase 19A. In Bioengineered, 12, 7666-7677. doi:10.1080/21655979.2021.1982276. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34612147/
3. Banerjee, Poulomi, Markande, Shubha, Kalarikkal, Misha, Joseph, Jomon. 2022. SUMOylation modulates the function of DDX19 in mRNA export. In Journal of cell science, 135, . doi:10.1242/jcs.259449. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35080244/
4. Pan, Yue, Fei, Lei, Wang, Shihua, Zhang, Qinggao, Chen, Yongwen. 2024. Integrated analysis of single-cell, spatial and bulk RNA-sequencing identifies a cell-death signature for predicting the outcomes of head and neck cancer. In Frontiers in immunology, 15, 1487966. doi:10.3389/fimmu.2024.1487966. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39575251/
5. Ma, Qiang, Xu, Wen, Guo, Xiaolan. 2025. Pan‑cancer analysis of the oncogenic role of telomeric repeat binding factor 2 (TERF2) in human tumors and in vitro validation in gastric cancer by TERF2 knockdown. In Discover oncology, 16, 234. doi:10.1007/s12672-025-01954-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39994081/
6. Cava, Claudia, Bertoli, Gloria, Ripamonti, Marilena, Gilardi, Maria Carla, Castiglioni, Isabella. 2014. Integration of mRNA expression profile, copy number alterations, and microRNA expression levels in breast cancer to improve grade definition. In PloS one, 9, e97681. doi:10.1371/journal.pone.0097681. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24866763/