Ccr4-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Ccr4-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-01772

品系全称

C57BL/6JCya-Ccr4em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-12773-Ccr4-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ccr4-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-01772) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
C-C motif chemokine receptor 4
基因别称
C-C CKR-4,CHEMR1,Cmkbr4,LESTR,Sdf1r
染色体号
Chr 9 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_009916 | Ensembl: ENSMUST00000054414
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~3.8 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:107824Homozygous mutation of this gene results in decreased mortality, decreased tumor necrosis factor production, and decreased IL-1beta production following LPS administration.
基因Ccr4是Ccr4-Not复合体的一部分,该复合体在真核生物基因表达调控中起着至关重要的作用。Ccr4-Not复合体参与基因表达的多个阶段,包括染色质模板的转录后修饰、转录、转录后修饰、mRNA的细胞质转运、mRNA的翻译、翻译后修饰和mRNA的降解。该复合体在核内影响染色质的转录后修饰,与转录因子和RNA聚合酶相互作用,并影响mRNA的细胞质转运。在细胞质中,Ccr4-Not复合体存在于多聚核糖体中,参与mRNA的翻译和翻译后修饰,并影响mRNA的降解[4]。

Ccr4-Not复合体通过多种机制加速mRNA的降解,并参与共翻译过程,如共翻译蛋白相互作用和将翻译的mRNA输送到细胞器。Ccr4-Not复合体的结构研究表明,其可以通过与正在翻译的核糖体的特定相互作用来监测密码子的优化程度。当核糖体缺乏A位点的tRNA时,Ccr4-Not复合体与核糖体的E位点相互作用,这表明密码子优化程度较低。这种相互作用对于mRNA降解机制感知密码子优化程度至关重要[3]。此外,Ccr4-Not复合体还可以与翻译模板中的因子相互作用,以抑制翻译或诱导mRNA去帽[4]。

Ccr4-Not复合体的功能还涉及到tRNA介导的mRNA降解。在翻译过程中,慢速解码会促进Ccr4-Not复合体与核糖体的结合,从而加速mRNA的降解。研究发现,特定精氨酸密码子是核糖体招募人类CNOT3(Ccr4-Not复合体的一个亚基)的强信号。冷冻电子断层扫描和tRNA突变分析表明,特定精氨酸tRNA的D臂与CNOT3相互作用,并促进其招募,而其他tRNA的D臂则与CNOT3发生空间碰撞[2]。

Ccr4-Not复合体在神经发育中也起着重要作用。研究发现,CNOT1(Ccr4-Not复合体的一个亚基)的杂合子de novo变异与神经发育迟缓有关。这些变异包括错义、剪接位点和无义变异,导致智力障碍、运动迟缓、言语迟缓、癫痫、低肌张力和行为问题等临床表现。为了研究CNOT1功能障碍与神经发育表型之间的关系,研究者构建了特定变异的果蝇模型,发现CNOT1敲低会导致学习和记忆缺陷。引入人类野生型CNOT1可以挽救这种表型,而突变体则不能或只能部分挽救,这支持了CNOT1损伤导致神经发育迟缓的假设。此外,CNOT1与自闭症谱系基因(如ASH1L、DYRK1A、MED13和SHANK3)的遗传相互作用在果蝇模型中也受到影响。分子特征分析表明,CNOT1变异对CNOT1的表达水平没有显著影响,突变型和野生型等位基因的表达水平相似。与Ccr4-Not复合体其他成员的蛋白-蛋白相互作用分析表明,Ccr4-Not复合体保持完整。整合患者来源的基因组学和转录组学数据表明,de novo CNOT1变异对内切核酸酶介导的无义mRNA降解成分的影响最小,这表明这些变异可能是半合子不足性低效等位基因或新等位基因,而不是显性负性等位基因[1]。

除了在神经发育中的作用外,Ccr4-Not复合体还与免疫基因表达相关。研究发现,多个常见变异与乳糜泻的易感性相关,这些变异影响免疫基因的表达。其中,CCR4基因的变异与乳糜泻的风险相关,表明Ccr4-Not复合体在免疫基因表达调控中发挥重要作用[5]。

综上所述,Ccr4-Not复合体在真核生物基因表达调控中起着核心作用,参与基因表达的多个阶段,并影响mRNA的稳定性和功能。Ccr4-Not复合体不仅在神经发育中发挥作用,还与免疫基因表达相关。对Ccr4-Not复合体的研究有助于深入理解基因表达调控的机制,为相关疾病的诊断和治疗提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Vissers, Lisenka E L M, Kalvakuri, Sreehari, de Boer, Elke, Bodmer, Rolf, de Brouwer, Arjan P M. 2020. De Novo Variants in CNOT1, a Central Component of the CCR4-NOT Complex Involved in Gene Expression and RNA and Protein Stability, Cause Neurodevelopmental Delay. In American journal of human genetics, 107, 164-172. doi:10.1016/j.ajhg.2020.05.017. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32553196/
2. Zhu, Xiaoqiang, Cruz, Victor Emmanuel, Zhang, He, Erzberger, Jan P, Mendell, Joshua T. 2024. Specific tRNAs promote mRNA decay by recruiting the CCR4-NOT complex to translating ribosomes. In Science (New York, N.Y.), 386, eadq8587. doi:10.1126/science.adq8587. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39571015/
3. Buschauer, Robert, Matsuo, Yoshitaka, Sugiyama, Takato, Inada, Toshifumi, Beckmann, Roland. . The Ccr4-Not complex monitors the translating ribosome for codon optimality. In Science (New York, N.Y.), 368, . doi:10.1126/science.aay6912. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32299921/
4. Collart, Martine A. 2016. The Ccr4-Not complex is a key regulator of eukaryotic gene expression. In Wiley interdisciplinary reviews. RNA, 7, 438-54. doi:10.1002/wrna.1332. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26821858/
5. Dubois, Patrick C A, Trynka, Gosia, Franke, Lude, Wijmenga, Cisca, van Heel, David A. 2010. Multiple common variants for celiac disease influencing immune gene expression. In Nature genetics, 42, 295-302. doi:10.1038/ng.543. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20190752/