Chic1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Chic1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-01456

品系全称

C57BL/6JCya-Chic1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-12212-Chic1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Chic1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-01456) were purchased from Cyagen.
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cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
cysteine-rich hydrophobic domain 1
基因别称
Brx,Gm10454
染色体号
Chr X (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_009767.2 | Ensembl: ENSMUST00000116547
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~555 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1344694Male chimeras hemizygous for a gene trapped allele appear normal at E9.5.
Chic1,也称为Chromosome instability complex 1,是一种编码染色质不稳定复合物的蛋白质,它参与了多种生物学过程,包括细胞周期调控、DNA损伤修复和染色质重塑。Chic1基因位于X染色体上,在哺乳动物中,X染色体失活(XCI)是一个关键的生物学事件,用以平衡XX女性和XY男性之间的X连锁基因剂量。Chic1与Xist基因紧密相关,Xist是一种非编码RNA,它在XCI中起着核心作用,通过促进X染色体上的基因沉默来实现剂量补偿。

在一项研究中,研究者们分析了Sjögren's综合征(SS)患者唾液腺的基因表达数据,发现包括Chic1在内的多个X染色体基因的表达上调。这些基因的异常表达可能与SS的发病机制有关,因为它们参与了XCI的调控。此外,Chic1的上调还与一些转录因子的过表达和/或差异甲基化有关,这些转录因子在SS患者中起着重要作用[1]。

在另一项研究中,研究者们分析了美洲有袋动物(如袋鼠)的X染色体结构,发现Chic1和Slc16a2基因在有袋动物中的X染色体上被分开。这与有胎盘哺乳动物中Xist基因周围的基因结构不同,表明有袋动物的XCI机制可能不同于有胎盘哺乳动物。此外,研究还发现Chic1与Lnx3基因(被认为是Xist的进化前体)和Fip1基因(被认为是Tsix的进化前体)存在连锁,这为进一步研究Xist和XCI的进化提供了线索[2]。

此外,Chic1在乳腺癌症中也发挥着重要作用。一项研究表明,与正常组织相比,MIR99AHG的表达水平在所有乳腺癌亚型中均降低,并且MIR99AHG的表达与肿瘤分期呈负相关。此外,数据库分析还表明,MIR99AHG的高表达水平与良好的预后相关,尤其是在没有淋巴结转移的患者中。此外,研究者还预测了MIR99AHG的共表达基因和相互作用蛋白,其中包括CHIC1。这些发现表明,MIR99AHG及其转录本在乳腺癌的进展中可能发挥着重要作用[3]。

在猪的胚胎研究中,研究者们分析了猪的X染色体失活中心(XIC)基因的表达。研究发现,Chic1和RLIM基因的表达水平在胚胎发育过程中逐渐降低,并且在雌性和雄性胚胎之间存在剂量补偿。此外,Chic1的CpG位点的甲基化水平在孤雌生殖胚胎中约为50%。这些结果表明,猪的XIC基因在胚胎发育过程中发挥着重要作用,并且XCI在猪的胚胎中可能不是完全的[4]。

在另一项研究中,研究者们利用膜中心的方法定义了椎间盘细胞亚型的生物标志物。通过比较人椎间盘的细胞系和原代细胞的转录组数据,研究者们发现CHIC1是AF细胞亚型(AF-S和AF-nS)的特异性膜相关基因。这表明CHIC1可能在椎间盘的细胞分化和功能中发挥着重要作用[5]。

最后,在一项关于有袋动物XIC的研究中,研究者们未能找到与Xist和Tsix基因相对应的基因,这表明有袋动物的XCI机制可能不同于有胎盘哺乳动物。此外,研究发现有袋动物的X染色体与有胎盘哺乳动物和其他脊椎动物的基因组结构存在断裂,这为进一步研究XCI的进化提供了新的线索[6]。

综上所述,Chic1是一个重要的X染色体基因,它参与了多种生物学过程,包括XCI、细胞周期调控、DNA损伤修复和染色质重塑。Chic1的表达异常可能与多种疾病的发生和发展有关,包括Sjögren's综合征、乳腺癌和椎间盘疾病。此外,Chic1在有胎盘哺乳动物和有袋动物中的表达模式和功能可能存在差异,这为进一步研究XCI的进化和功能提供了新的思路。

参考文献:
1. Mougeot, J-Lc, Noll, B D, Bahrani Mougeot, F K. 2018. Sjögren's syndrome X-chromosome dose effect: An epigenetic perspective. In Oral diseases, 25, 372-384. doi:10.1111/odi.12825. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29316023/
2. Shevchenko, Alexander I, Zakharova, Irina S, Elisaphenko, Eugeny A, Brockdorff, Neil, Zakian, Suren M. 2007. Genes flanking Xist in mouse and human are separated on the X chromosome in American marsupials. In Chromosome research : an international journal on the molecular, supramolecular and evolutionary aspects of chromosome biology, 15, 127-36. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17333537/
3. Han, Wei, Shi, Chun-Tao, Chen, Hua, Shao, Qi-Xiang, Dong, Xiao-Qiang. 2023. Role of LncRNA MIR99AHG in breast cancer: Bioinformatic analysis and preliminary verification. In Heliyon, 9, e19805. doi:10.1016/j.heliyon.2023.e19805. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37809464/
4. Hwang, Jae Yeon, Oh, Jong-Nam, Park, Chi-Hun, Lee, Dong-Kyung, Lee, Chang-Kyu. 2015. Dosage compensation of X-chromosome inactivation center-linked genes in porcine preimplantation embryos: Non-chromosome-wide initiation of X-chromosome inactivation in blastocysts. In Mechanisms of development, 138 Pt 3, 246-55. doi:10.1016/j.mod.2015.10.005. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26598280/
5. van den Akker, Guus G H, Eijssen, Lars M T, Richardson, Stephen M, Welting, Tim J M, Voncken, Jan Willem. 2018. A Membranome-Centered Approach Defines Novel Biomarkers for Cellular Subtypes in the Intervertebral Disc. In Cartilage, 11, 203-220. doi:10.1177/1947603518764260. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29629573/
6. Davidow, Lance S, Breen, Matthew, Duke, Shannon E, McCarrey, John R, Lee, Jeannie T. 2007. The search for a marsupial XIC reveals a break with vertebrate synteny. In Chromosome research : an international journal on the molecular, supramolecular and evolutionary aspects of chromosome biology, 15, 137-46. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17333538/