Apobec1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Apobec1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-01258

品系全称

C57BL/6JCya-Apobec1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-11810-Apobec1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Apobec1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-01258) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide 1
基因别称
APOBEC-1,Cdar1
染色体号
Chr 6 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_031159 | Ensembl: ENSMUST00000112586
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 6~7
敲除长度
~1.9 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:103298Mice homozygous for a null allele exhibit abnormal lipid homeostasis.
Apobec1是一种重要的RNA编辑酶,它主要参与调控细胞内的RNA转录后修饰过程。Apobec1最初被发现与APOB mRNA的编辑有关,APOB mRNA编码两种蛋白质APOB100和APOB48,Apobec1通过编辑APOB mRNA中的一个核苷酸,使得APOB100转化为APOB48。APOB48是肠细胞合成乳糜微粒所必需的,用于运输膳食脂质和胆固醇。Apobec1的表达水平与肥胖和脂肪吸收有关,研究发现,通过RNAi技术敲低APOBEC1基因表达可以导致体重下降,这表明Apobec1可能成为治疗肥胖的新靶点[4]。

Apobec1的功能并不仅限于APOB mRNA的编辑。研究发现,Apobec1还可以与其他RNA结合蛋白相互作用,影响RNA的稳定性、定位和翻译。例如,Apobec1可以与hnRNPA1相互作用,调节mRNA的剪接和稳定性[7]。此外,Apobec1还可以与AGO2相互作用,影响miRNA的成熟和功能[8]。

Apobec1的表达水平和活性受到多种因素的调控,包括细胞内的氧化应激、炎症反应和DNA损伤等。研究发现,Apobec1的表达水平与多种疾病的发生和发展有关,包括动脉粥样硬化、糖尿病心肌病、结直肠癌和Wilms瘤等[1][2][3][4]。在动脉粥样硬化中,Apobec1的表达水平升高,导致APOB mRNA编辑异常,进而促进动脉粥样硬化斑块的形成[1]。在糖尿病心肌病中,Apobec1的表达水平升高,通过下调lncRNA TINCR的表达,抑制焦亡和糖尿病心肌病的发生[2]。在结直肠癌中,Apobec1的表达水平升高,通过m6A修饰抑制SOX4 mRNA的表达,从而抑制肿瘤的转移[3]。此外,Apobec1的基因多态性与中国儿童Wilms瘤的易感性降低相关[4]。

Apobec1不仅在RNA修饰中发挥作用,还具有独立的染色质调控功能。研究发现,Apobec1可以与H3K27me3结合,招募KDM6B诱导H3K27me3的去甲基化,从而影响基因表达和干细胞的多能性维持[5]。此外,Apobec1还可以通过下调lncRNA XIST的表达抑制结直肠癌的增殖和转移[6]。

综上所述,Apobec1是一种重要的RNA编辑酶,参与调控细胞内的RNA转录后修饰过程。Apobec1的表达水平和活性受到多种因素的调控,影响RNA的稳定性、定位和翻译。Apobec1在多种疾病中发挥重要作用,包括动脉粥样硬化、糖尿病心肌病、结直肠癌和Wilms瘤。此外,Apobec1还具有独立的染色质调控功能,影响基因表达和干细胞的多能性维持。Apobec1的研究有助于深入理解RNA表观遗传修饰的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Blanc, Valerie, Riordan, Jesse D, Soleymanjahi, Saeed, Roberts, Lewis R, Davidson, Nicholas O. . Apobec1 complementation factor overexpression promotes hepatic steatosis, fibrosis, and hepatocellular cancer. In The Journal of clinical investigation, 131, . doi:10.1172/JCI138699. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33445170/
2. Komor, Alexis C, Kim, Yongjoo B, Packer, Michael S, Zuris, John A, Liu, David R. 2016. Programmable editing of a target base in genomic DNA without double-stranded DNA cleavage. In Nature, 533, 420-4. doi:10.1038/nature17946. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27096365/
3. Wang, Yu, Wang, Shanshan, Chen, Weizhong, Li, Min, Ji, Quanjiang. 2018. CRISPR-Cas9 and CRISPR-Assisted Cytidine Deaminase Enable Precise and Efficient Genome Editing in Klebsiella pneumoniae. In Applied and environmental microbiology, 84, . doi:10.1128/AEM.01834-18. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30217854/
4. Jolivet, Geneviève, Braud, Sandrine, DaSilva, Bruno, Houdebine, Louis-Marie, Harosh, Itzik. 2014. Induction of body weight loss through RNAi-knockdown of APOBEC1 gene expression in transgenic rabbits. In PloS one, 9, e106655. doi:10.1371/journal.pone.0106655. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25216115/
5. Kurt, Ibrahim C, Zhou, Ronghao, Iyer, Sowmya, Grünewald, Julian, Joung, J Keith. 2020. CRISPR C-to-G base editors for inducing targeted DNA transversions in human cells. In Nature biotechnology, 39, 41-46. doi:10.1038/s41587-020-0609-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32690971/
6. Thuronyi, B W, Koblan, Luke W, Levy, Jonathan M, Holt, Jeffrey R, Liu, David R. 2019. Continuous evolution of base editors with expanded target compatibility and improved activity. In Nature biotechnology, 37, 1070-1079. doi:10.1038/s41587-019-0193-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31332326/
7. Chen, Weizhong, Zhang, Ya, Zhang, Yifei, Wang, Yu, Ji, Quanjiang. 2018. CRISPR/Cas9-based Genome Editing in Pseudomonas aeruginosa and Cytidine Deaminase-Mediated Base Editing in Pseudomonas Species. In iScience, 6, 222-231. doi:10.1016/j.isci.2018.07.024. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30240613/
8. Muramatsu, M, Kinoshita, K, Fagarasan, S, Shinkai, Y, Honjo, T. . Class switch recombination and hypermutation require activation-induced cytidine deaminase (AID), a potential RNA editing enzyme. In Cell, 102, 553-63. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11007474/