Helb-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Helb-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-01220

品系全称

C57BL/6JCya-Helbem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-117599-Helb-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Helb-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-01220) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
helicase (DNA) B
基因别称
D10Ertd664e
染色体号
Chr 10 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_080446.2 | Ensembl: ENSMUST00000020449
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~670 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2152895Homozygous knockout MEFs display increased DNA end resection, resulting in increased level of single-strand DNA formation at double-strand DNA breaks.
HELB,也称为DNA Helicase B,是一种保守的螺旋酶,在高等真核生物中发挥着重要的作用。HELB在DNA复制、DNA损伤修复和复制应激反应中扮演着关键角色。HELB主要定位于细胞核中,在G1期参与DNA复制的起始,通过与DNA拓扑异构酶2结合蛋白1(TOPBP1)、细胞分裂控制蛋白45(CDC45)和DNA聚合酶α-引物酶的相互作用实现这一过程。HELB还可以通过减少长距离末端切除来抑制同源重组。在G1到S期的过渡过程中,HELB被细胞周期依赖性激酶2(CDK2)磷酸化后,主要定位于细胞质中。然而,在S期,HELB也有报道定位到染色质上,尤其是在复制应激下。HELB在S期可以定位到常见的脆性位点16D(FRA16D)和3B(FRA3B)以及罕见的脆性位点XA(FRAXA)。此外,HELB在电离辐射后发生磷酸化,并已在多种类型的DNA损伤响应中定位到染色质,这表明HELB在DNA损伤响应中发挥重要作用[2]。

HELB基因的突变与多种生物学过程和疾病相关。例如,HELB基因中的罕见单核苷酸多态性(SNP)rs75770066导致D506G替换,影响RPA的相互作用和HELB的细胞功能。这个替换导致HELB与RPA的相互作用受损,减少了HELB在DNA损伤位点的募集,从而影响了DNA损伤修复过程[3]。此外,HELB基因的罕见功能丧失变异与卵巢癌的易感性相关,尤其是与非粘液性、非高级别浆液性上皮性卵巢癌。研究表明,HELB基因中的功能丧失变异与自然绝经年龄相关,而自然绝经年龄与子宫内膜样卵巢癌的遗传预测相关[1]。这些发现表明,HELB在DNA损伤修复和卵巢癌的发生发展中具有重要作用。

除了在人类中的研究,HELB基因也在其他物种中被研究。例如,在热带牛的基因组中,HELB基因经历了选择性清除,表明HELB在热带牛的适应和繁殖性状中发挥着重要作用。研究表明,HELB基因在热带牛中携带特定的突变,这些突变在印度牛和印度牛中固定,但在欧洲牛中不存在[4]。

HELB基因的转录调控也得到了研究。研究发现,HELB基因的启动子区域包含GC-box/Sp1和重复的GGAA-motif,这些序列与STAT-x和c-ETS结合位点相邻。此外,HELB基因的表达可以被天然化合物白藜芦醇(Rsv)上调,而Rsv是一种已被发现可以延长多种生物寿命的化合物[5]。进一步的研究发现,Rsv通过GC-boxes和重复的GGAA-motif在121-bp区域中的协同作用来调节HELB启动子活性[5]。

综上所述,HELB基因是一种重要的DNA螺旋酶,参与DNA复制、DNA损伤修复和复制应激反应。HELB基因的突变与多种生物学过程和疾病相关,包括DNA损伤修复、卵巢癌和自然绝经年龄。HELB基因的转录调控也得到了研究,发现GC-boxes和重复的GGAA-motif在121-bp区域中的协同作用可以调节HELB基因的表达。这些发现对于理解HELB基因的功能和其在疾病发生发展中的作用具有重要意义。

参考文献:
1. Dicks, Ed M, Tyrer, Jonthan P, Ezquina, Suzana, Gayther, Simon A, Pharoah, Paul D P. 2024. Exome sequencing identifies HELB as a novel susceptibility gene for non-mucinous, non-high-grade-serous epithelial ovarian cancer. In medRxiv : the preprint server for health sciences, , . doi:10.1101/2024.04.02.24304968. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38633804/
2. Hazeslip, Lindsey, Zafar, Maroof Khan, Chauhan, Muhammad Zain, Byrd, Alicia K. 2020. Genome Maintenance by DNA Helicase B. In Genes, 11, . doi:10.3390/genes11050578. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32455610/
3. Osei, Bertha, May, Benjamin H, Stiefel, Clara M, Enemark, Eric J, Byrd, Alicia K. 2024. Rare SNP in the HELB gene interferes with RPA interaction and cellular function of HELB. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2024.02.27.582415. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38464108/
4. Naval-Sánchez, Marina, Porto-Neto, Laercio R, Cardoso, Diercles F, Kijas, James, Reverter, Antonio. 2020. Selection signatures in tropical cattle are enriched for promoter and coding regions and reveal missense mutations in the damage response gene HELB. In Genetics, selection, evolution : GSE, 52, 27. doi:10.1186/s12711-020-00546-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32460767/
5. Uchiumi, Fumiaki, Arakawa, Jun, Iwakoshi, Keiko, Ishibashi, Sayaka, Tanuma, Sei-ichi. 2016. Characterization of the 5'-flanking region of the human DNA helicase B (HELB) gene and its response to trans-Resveratrol. In Scientific reports, 6, 24510. doi:10.1038/srep24510. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27079536/