Aga-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Aga-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-01093

品系全称

C57BL/6JCya-Agaem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-11593-Aga-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Aga-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-01093) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
aspartylglucosaminidase
基因别称
-
染色体号
Chr 8 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001005847.2 | Ensembl: ENSMUST00000033920
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 5
敲除长度
~615 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:104873Mice homozygous for targeted mutations that inactivate this gene die prematurely and share most of the clinical, biochemical and histopathological characteristics of human aspartylglycosaminuria.
基因Aga,也称为AGA,是编码精氨酸的密码子之一。在许多生物体中,包括人类,AGA和AGG是编码精氨酸的六种密码子中较少使用的。尽管AGA和AGG的使用频率较低,但它们在基因表达中发挥着重要作用。AGA和AGG的使用频率受到多种因素的影响,包括基因的生物学功能、细胞环境以及物种的进化历史等。

AGA和AGG的使用频率在基因的不同位置也有所不同。在Escherichia coli中,AGA和AGG密码子通常在基因的起始位置附近使用较少,而在基因的内部位置使用较多。这种现象可能是由于AGA和AGG密码子附近的早期开放阅读框(ORF)序列对翻译效率的影响所导致的[4]。此外,AGA和AGG密码子附近的使用频率还受到tRNA丰度的影响。在E. coli中,AGA和AGG密码子附近的tRNA丰度较低,这可能导致翻译过程中出现瓶颈,进而影响基因表达[4]。

AGA和AGG密码子的使用频率在不同物种之间也有所差异。例如,在人类的TP73基因家族中,AGA和AGG密码子的使用频率较低,这与该基因在进化过程中所受到的自然选择有关。此外,AGA和AGG密码子的使用频率还与蛋白质的生化性质有关。研究发现,AGA和AGG密码子的使用频率与蛋白质的疏水性程度和长度呈正相关[5]。

在人类的基因表达中,AGA和AGG密码子的使用频率还受到表观遗传修饰的影响。例如,在Drosophila yakuba的线粒体基因组中,AGA密码子被指定为编码丝氨酸而不是精氨酸,这与标准的遗传密码不同[6]。这种现象可能是由于Drosophila yakuba线粒体基因组中缺少特定的tRNA所导致的。

除了AGA和AGG密码子的使用频率,AGA和AGG密码子附近的基因表达也受到其他因素的影响。例如,在E. coli中,含有AGA/AGG密码子的基因通常与各种细胞功能相关。此外,AGA和AGG密码子附近的基因表达还受到tRNA丰度和细胞环境的影响[4]。

综上所述,基因Aga,也称为AGA,是编码精氨酸的密码子之一。AGA和AGG的使用频率在基因的不同位置、不同物种以及不同细胞环境中有所不同。AGA和AGG密码子的使用频率受到多种因素的影响,包括基因的生物学功能、细胞环境、物种的进化历史以及表观遗传修饰等。AGA和AGG密码子附近的基因表达还受到tRNA丰度和细胞环境的影响。深入研究AGA和AGG密码子的使用频率和基因表达,有助于我们更好地理解基因表达的调控机制,并为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[1,2,3,4,5,6,7]。

参考文献:
1. Sun, Kathie Y, Bai, Xiaodong, Chen, Siying, Salerno, William, Balasubramanian, Suganthi. 2024. A deep catalogue of protein-coding variation in 983,578 individuals. In Nature, 631, 583-592. doi:10.1038/s41586-024-07556-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38768635/
2. Zamora-Romo, Efraín, Cruz-Vera, Luis Rogelio, Vivanco-Domínguez, Serafín, Magos-Castro, Marco Antonio, Guarneros, Gabriel. 2007. Efficient expression of gene variants that harbour AGA codons next to the initiation codon. In Nucleic acids research, 35, 5966-74. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17726048/
3. el-Samahy, May H, Shaheen, Maha A, Saddik, Dina E B, Mahran, Manal Z, Shehab, Abeer A A. . Evaluation of androgen receptor gene as a candidate gene in female androgenetic alopecia. In International journal of dermatology, 48, 584-7. doi:10.1111/j.1365-4632.2009.03991.x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19538365/
4. Chen, G T, Inouye, M. . Role of the AGA/AGG codons, the rarest codons in global gene expression in Escherichia coli. In Genes & development, 8, 2641-52. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/7958922/
5. Barbhuiya, Parvin A, Uddin, Arif, Chakraborty, Supriyo. 2018. Compositional properties and codon usage of TP73 gene family. In Gene, 683, 159-168. doi:10.1016/j.gene.2018.10.030. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30316927/
6. Clary, D O, Wolstenholme, D R. . The Drosophila mitochondrial genome. In Oxford surveys on eukaryotic genes, 1, 1-35. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/6400770/
7. Majid, Hafsa, Khan, Aysha Habib, Hashmi, Syed Bilal, Moatter, Tariq, Nasir, Asghar. . Spectrum of Cystic Fibrosis Conductance Regulator Gene Mutations Reported in Pakistani Descent Cystic Fibrosis Patients. In Journal of the College of Physicians and Surgeons--Pakistan : JCPSP, 32, 1042-1046. doi:10.29271/jcpsp.2022.08.1042. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35932130/