Pgd-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Pgd-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-00844

品系全称

C57BL/6JCya-Pgdem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-110208-Pgd-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Pgd-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-00844) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
phosphogluconate dehydrogenase
基因别称
0610042A05Rik
染色体号
Chr 4 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001081274 | Ensembl: ENSMUST00000084124
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 4~5
敲除长度
~1.6 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:97553T-cell specific knock-out results in more robust development of effector functions in stimulated nave CD8+ T cells. Mice homozygous for a conditional allele activated in T cells exhibit enlarged peripheral lymphoid organs, splenomegaly, lymphoproliferation of CD4/CD8 T-cells, and super high IFN, IL-17A, IL-4, and IL-5 levels in serum with reduced injected tumor cell growth.
PGD基因,全名为3-磷酸甘油脱氢酶(3-phosphoglycerate dehydrogenase),是一种在糖酵解过程中发挥关键作用的酶。它催化3-磷酸甘油酸转化为3-磷酸丙酮酸,是糖酵解途径中的第八步反应。PGD基因编码的酶不仅参与糖酵解,还在三羧酸循环中发挥作用,将3-磷酸丙酮酸转化为草酰乙酸,进而参与能量的产生。

PGD基因在多种生物学过程中发挥重要作用,包括细胞增殖、迁移和代谢。PGD基因的异常表达与多种疾病的发生发展密切相关,包括癌症、糖尿病和多囊卵巢综合征等。例如,PGD基因在结直肠癌细胞中的表达上调,通过激活磷酸戊糖途径促进肿瘤细胞的增殖和抗氧化应激[5]。PGD基因在多囊卵巢综合征和子宫内膜癌中的表达异常,影响糖代谢途径和细胞增殖[2]。此外,PGD基因的突变与遗传性出生缺陷有关,如Schaaf-Yang综合征[3]。

为了更好地研究PGD基因的功能,研究人员开发了一种基于机器学习的基因检测方法,称为PGD(Photosynthetic-related Gene Detection approach)。该方法利用RNA测序数据,结合多个光合作用突变体的信息,预测与光合作用相关的基因。通过蛋白定位预测和表达趋势分析,证实了该方法预测结果的可靠性和鲁棒性[1]。

此外,荧光PCR技术也被用于PGD的检测,特别是用于性别和单基因缺陷的检测。荧光PCR技术具有高敏感性、高可靠性和高准确性,能够同时检测多个基因,并且可以用于DNA指纹分析,以确定细胞的来源和是否发生污染[4]。

综上所述,PGD基因在糖酵解和三羧酸循环中发挥重要作用,参与调控细胞增殖、迁移和代谢。PGD基因的异常表达与多种疾病的发生发展密切相关,包括癌症、糖尿病和多囊卵巢综合征等。基于机器学习的基因检测方法PGD和荧光PCR技术为PGD基因的研究提供了新的工具和策略。未来,PGD基因的研究将有助于深入理解其在疾病发生发展中的作用机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Wang, Yunchuan, Dai, Xiuru, Fu, Daohong, Li, Pinghua, Du, Baijuan. 2022. PGD: a machine learning-based photosynthetic-related gene detection approach. In BMC bioinformatics, 23, 183. doi:10.1186/s12859-022-04722-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35581553/
2. Chen, Jia-Ming, Chen, Wei-Hong, Wang, Zhi-Yi, Lin, Shu, Shi, Qi-Yang. 2024. PGD: Shared gene linking polycystic ovary syndrome and endometrial cancer, influencing proliferation and migration through glycometabolism. In Cancer science, 115, 2908-2922. doi:10.1111/cas.16212. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38979884/
3. Guo, Wei, Nie, Yanli, Yan, Zhiqiang, Yan, Liying, Qiao, Jie. 2019. Genetic testing and PGD for unexplained recurrent fetal malformations with MAGEL2 gene mutation. In Science China. Life sciences, 62, 886-894. doi:10.1007/s11427-019-9541-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31152388/
4. Findlay, I, Quirke, P, Hall, J, Rutherford, A. . Fluorescent PCR: a new technique for PGD of sex and single-gene defects. In Journal of assisted reproduction and genetics, 13, 96-103. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8688597/
5. Zhang, Fan, Wu, Zhiwei, Yu, Bowen, Zhang, Yi, Lin, Changwei. . ATP13A2 activates the pentose phosphate pathway to promote colorectal cancer growth though TFEB-PGD axis. In Clinical and translational medicine, 13, e1272. doi:10.1002/ctm2.1272. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37243374/