Snrpd2-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Snrpd2-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-00593

品系全称

C57BL/6JCya-Snrpd2em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-107686-Snrpd2-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Snrpd2-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-00593) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
small nuclear ribonucleoprotein D2
基因别称
1810009A06Rik,SMD2
染色体号
Chr 7 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_026943.1 | Ensembl: ENSMUST00000049294
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~3.2 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Snrpd2(也称为SmD2)是剪接体中的Sm蛋白家族成员之一。Sm蛋白是剪接体的重要组成部分,它们在介导剪接反应中发挥关键作用。剪接体是一种动态的分子过程,它响应环境刺激并严格地受剪接体调控。Sm蛋白在剪接过程中负责识别并结合前体mRNA的剪接位点,确保正确地去除内含子和连接外显子,从而产生成熟的mRNA分子。Snrpd2在多种细胞过程中发挥着重要作用,包括细胞周期、DNA损伤应答和细胞分化等。

研究表明,Snrpd2在多种癌症中表达上调,并参与癌症的发生和发展。例如,在肝细胞癌(HCC)中,Snrpd2是上调最明显的Sm蛋白之一,并且作为致癌基因发挥作用。Snrpd2与HNRNPL协同作用,调节DDX39A内含子的保留,从而维持DDX39A短变体(39A_S)的表达。39A_S能够介导MYC mRNA的核输出,维持MYC蛋白的高表达水平,而MYC反过来又会增强PD2的转录。此外,研究发现,洋地黄毒苷可以直接与PD2相互作用,并具有显著的抑制HCC的作用。这些结果表明,Snrpd2通过促进DDX39A内含子的保留和维持MYC蛋白的高表达,在HCC中形成一个正反馈循环,并可以被洋地黄毒苷靶向抑制[1]。

在结直肠癌中,Snrpd2的表达上调与细胞增殖和迁移的增加有关。研究发现,结直肠癌组织中PABPN1的液-液相分离(LLPS)被降低,尽管PABPN1的表达水平升高。LLPS的降低导致CTNNBIP1的3'非翻译区(3' UTR)缩短,从而促进细胞增殖和迁移。Snrpd2在结直肠癌中上调,并能够与PABPN1的谷氨酸-脯氨酸(EP)结构域相互作用,从而破坏PABPN1的LLPS。这减弱了PABPN1对近端多聚腺苷酸化(APA)位点的抑制作用。这些结果表明,Snrpd2通过破坏PABPN1的LLPS来调节APA,为癌症治疗提供了新的思路[2]。

除了在癌症中的重要作用外,Snrpd2还参与其他生物学过程。例如,研究发现,在哺乳动物胚胎中,从母系到胚胎转录控制的过渡过程中,Snrpd2的表达水平在ZGA阶段较低,随后急剧增加。在ZGA阶段,剪接失败导致DNA损伤反应的减弱。Snrpd2和另一个核心剪接体成分Snrpb调节这种剪接失败的模式。这些结果表明,Snrpd2在哺乳动物胚胎发育过程中发挥着重要作用,并且可能参与DNA损伤反应的调控[4]。

此外,Snrpd2还与骨折愈合过程中的RNA剪接和细胞周期相关。研究发现,在骨折早期阶段,Snrpd2的表达水平升高,并参与RNA剪接和细胞周期的调控。这些结果表明,Snrpd2在骨折愈合过程中发挥着重要作用,并可能为骨折治疗提供新的靶点[3]。

综上所述,Snrpd2是一种重要的剪接体蛋白,参与调控RNA的剪接过程和多种生物学过程。Snrpd2在癌症中表达上调,并参与癌症的发生和发展。此外,Snrpd2还与骨折愈合过程和哺乳动物胚胎发育相关。对Snrpd2的研究有助于深入理解RNA剪接的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Chang, Cunjie, Li, Lina, Su, Ling, Chabot, Benoit, Chen, Jianxiang. 2024. Intron Retention of DDX39A Driven by SNRPD2 is a Crucial Splicing Axis for Oncogenic MYC/Spliceosome Program in Hepatocellular Carcinoma. In Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany), 11, e2403387. doi:10.1002/advs.202403387. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39018261/
2. Hu, Zhijie, Li, Mengxia, Chen, Yufeng, Fu, Yonggui, Xu, Anlong. 2024. Disruption of PABPN1 phase separation by SNRPD2 drives colorectal cancer cell proliferation and migration through promoting alternative polyadenylation of CTNNBIP1. In Science China. Life sciences, 67, 1212-1225. doi:10.1007/s11427-023-2495-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38811444/
3. Wang, Chengxue, Qi, Baochang, Tan, Lei, Cheng, Jieping. 2016. Gene markers of fracture healing in early stage and the regulatory mechanism during the process using microarray analysis. In Acta orthopaedica et traumatologica turcica, 50, 681-685. doi:10.1016/j.aott.2016.02.003. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27956081/
4. Wyatt, Christopher D R, Pernaute, Barbara, Gohr, André, Bonnal, Sophie, Irimia, Manuel. 2022. A developmentally programmed splicing failure contributes to DNA damage response attenuation during mammalian zygotic genome activation. In Science advances, 8, eabn4935. doi:10.1126/sciadv.abn4935. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35417229/