Spty2d1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Spty2d1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-00230

品系全称

C57BL/6JCya-Spty2d1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-101685-Spty2d1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Spty2d1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-00230) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
SPT2 chromatin protein domain containing 1
基因别称
5830435K17Rik,P16H6
染色体号
Chr 7 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_175318.4 | Ensembl: ENSMUST00000061639
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~2914 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
SPTY2D1,也称为Suppressor of Ty, domain containing 1,是一种重要的染色质蛋白,参与基因表达调控。SPTY2D1包含一个保守的C端结构域,可以与组蛋白H3/H4四聚体结合,影响其交换和沉积。SPTY2D1的功能涉及染色质重塑、基因转录和细胞代谢等过程。

SPTY2D1基因的多态性与其表达水平和功能密切相关。研究表明,SPTY2D1基因中的rs17579600 SNP和rs7934205 SNP与血清脂质水平相关。在中国汉族和么佬族人群中,SPTY2D1 rs17579600 SNP的基因型和等位基因频率存在种族和性别差异,且与血清载脂蛋白A1(ApoA1)和甘油三酯(TG)水平相关[1]。此外,SPTY2D1 rs7934205 SNP与汉族和么佬族人群中血清脂质水平存在性别差异[2]。这些发现表明,SPTY2D1基因的多态性与血清脂质水平之间存在种族和性别特异性关联。

除了在脂质代谢中的作用外,SPTY2D1还与多种疾病相关。在甲状腺癌中,SPTY2D1的反义长非编码RNA(lncRNA)SPTY2D1-AS1被下调,并与miR-221相互作用,抑制miR-221的成熟,从而发挥肿瘤抑制功能[3]。在胃癌中,ZNF860基因与SPTY2D1基因共表达,且ZNF860基因的扩增和甲基化与SPTY2D1的表达相关,提示ZNF860可能通过调控SPTY2D1基因的表达影响胃癌的发生和预后[5]。

此外,SPTY2D1在组织特异性表达方面也表现出明显的差异。研究表明,在牛的18种组织中,SPTY2D1基因的等位基因特异性表达(ASE)现象普遍存在,且在不同组织中表现出不同的表达模式和方向[4]。

综上所述,SPTY2D1基因是一种重要的染色质蛋白,参与基因表达调控和多种生物学过程。SPTY2D1基因的多态性与血清脂质水平相关,且在不同种族和性别中表现出特异性。此外,SPTY2D1基因还与甲状腺癌和胃癌等多种疾病相关,其表达水平受到多种因素的调控。深入研究SPTY2D1基因的功能和调控机制,有助于揭示其在疾病发生和发展中的作用,为相关疾病的诊断、治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Guo, Tao, Yin, Rui-Xing, Bin, Yuan, Chen, Xia, Pan, Shang-Ling. 2015. Association of the SPT2 chromatin protein domain containing 1 gene rs17579600 polymorphism and serum lipid traits. In International journal of clinical and experimental pathology, 8, 12995-3010. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26722495/
2. Guo, Tao, Yin, Rui-Xing, Chen, Xia, Nie, Rong-Jun, Li, Hui. 2015. Sex-specific association of the SPTY2D1 rs7934205 polymorphism and serum lipid levels. In International journal of clinical and experimental pathology, 8, 665-81. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25755761/
3. Ramírez-Moya, Julia, Wert-Lamas, León, Acuña-Ruíz, Adrián, Santisteban, Pilar, Riesco-Eizaguirre, Garcilaso. 2022. Identification of an interactome network between lncRNAs and miRNAs in thyroid cancer reveals SPTY2D1-AS1 as a new tumor suppressor. In Scientific reports, 12, 7706. doi:10.1038/s41598-022-11725-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35562181/
4. Chamberlain, Amanda J, Vander Jagt, Christy J, Hayes, Benjamin J, Nguyen, Thuy T T, Goddard, Michael E. 2015. Extensive variation between tissues in allele specific expression in an outbred mammal. In BMC genomics, 16, 993. doi:10.1186/s12864-015-2174-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26596891/
5. Pan, H-X, Bai, H-S, Guo, Y, Cheng, Z-Y. . Bioinformatic analysis of the prognostic value of ZNF860 in recurrence-free survival and its potential regulative network in gastric cancer. In European review for medical and pharmacological sciences, 23, 162-170. doi:10.26355/eurrev_201901_16760. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30767193/