Rpusd3-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Rpusd3-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-00194

品系全称

C57BL/6JCya-Rpusd3em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-101122-Rpusd3-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Rpusd3-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-00194) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
RNA pseudouridylate synthase domain containing 3
基因别称
-
染色体号
Chr 6 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001033204.1 | Ensembl: ENSMUST00000113092
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 5~9
敲除长度
~2810 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
RPUSD3,也称为Pseudouridine synthase domain containing 3,是一种假尿苷合成酶。假尿苷化是一种普遍存在于RNA上的转录后修饰,通过将尿苷转化为假尿苷,参与调控RNA的稳定性和功能,影响基因表达和生物学过程。RPUSD3在多种生物学过程中发挥重要作用,包括细胞代谢、细胞周期、免疫调节和肿瘤发生等。

在氧化磷酸化(OXPHOS)途径中,RPUSD3与其他假尿苷合成酶(如NGRN、WBSCR16、RPUSD4、TRUB2和FASTKD2)共同构成了一个功能模块,调节线粒体16S rRNA和线粒体内翻译。氧化磷酸化是人类ATP生产的主要途径,其缺陷可能导致线粒体疾病。通过基因组-wide CRISPR死亡筛选,研究人员发现RPUSD3是OXPHOS途径中的关键基因之一[1]。

在肝细胞癌(HCC)中,RPUSD3的表达显著上调,并且是患者总生存期(OS)的独立风险因素。此外,RPUSD3的蛋白质表达也与不良预后相关,并且具有高度的HCC诊断价值。进一步的功能分析表明,RPUSD3主要参与遗传信息处理、物质代谢、细胞周期和免疫调节等途径[2]。

在前列腺癌(PCa)中,RPUSD3的表达水平与患者的预后和治疗效果密切相关。高水平的RPUSD3表达与不良预后和治疗效果不佳相关。此外,RPUSD3还可能通过影响代谢途径来促进PCa的进展[3]。

RCC1L(WBSCR16)是一种假定的GDP/GTP交换因子,与线粒体大核糖体亚基相互作用。RCC1L存在三种不同的异构体,RCC1LV1、RCC1LV2和RCC1LV3,它们共享相同的N-端,但具有不同的C-端。这些异构体都与线粒体内膜相互作用,并与同聚多聚物以不同的程度相关。RCC1LV1和RCC1LV3分别与线粒体大核糖体亚基和小核糖体亚基相关联,而RCC1LV2没有明显的相关性。RCC1LV1或RCC1LV3的过表达或沉默会导致线粒体核糖体生物合成缺陷,从而降低翻译效率。此外,RCC1LV1和RCC1LV3与GTP酶(如GTPBP10、ERAL1和C4orf14)和假尿苷化蛋白(如TRUB2、RPUSD3和RPUSD4)的相互作用也受到影响[4]。

通过近邻生物素化实验,研究人员发现了一个包含RPUSD3在内的蛋白质模块,该模块位于线粒体RNA颗粒中,是转录后RNA修饰和核糖体组装的平台。RPUSD3与TRUB2和RPUSD4共同参与线粒体mRNA的假尿苷化,而RPUSD4还参与线粒体16S rRNA的假尿苷化。这些假尿苷化修饰对线粒体蛋白合成、氧化磷酸化和细胞存活至关重要[5]。

综上所述,RPUSD3是一种重要的假尿苷合成酶,在多种生物学过程中发挥重要作用。RPUSD3在氧化磷酸化、肝细胞癌、前列腺癌和线粒体蛋白合成等方面都具有重要功能。RPUSD3的研究有助于深入理解假尿苷化修饰的生物学功能和疾病发生机制,为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[1,2,3,4,5]。

参考文献:
1. Arroyo, Jason D, Jourdain, Alexis A, Calvo, Sarah E, Root, David E, Mootha, Vamsi K. 2016. A Genome-wide CRISPR Death Screen Identifies Genes Essential for Oxidative Phosphorylation. In Cell metabolism, 24, 875-885. doi:10.1016/j.cmet.2016.08.017. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27667664/
2. Jin, Zhipeng, Song, Mengying, Wang, Jianping, Liu, Huayuan, Shi, Guangjun. 2022. Integrative multiomics evaluation reveals the importance of pseudouridine synthases in hepatocellular carcinoma. In Frontiers in genetics, 13, 944681. doi:10.3389/fgene.2022.944681. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36437949/
3. Cai, Zhouda, Jiang, Zhaojun, Li, Songbo, Zhong, Chuanfan, Lu, Jianming. 2024. RNA modification Regulators' Co-Expression Score (RMRCoeS) predicts biochemical recurrence and therapy response in prostate cancer: A multi-omics and experimental validation study. In International immunopharmacology, 139, 112723. doi:10.1016/j.intimp.2024.112723. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39053228/
4. Reyes, Aurelio, Favia, Paola, Vidoni, Sara, Petruzzella, Vittoria, Zeviani, Massimo. 2020. RCC1L (WBSCR16) isoforms coordinate mitochondrial ribosome assembly through their interaction with GTPases. In PLoS genetics, 16, e1008923. doi:10.1371/journal.pgen.1008923. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32735630/
5. Antonicka, Hana, Choquet, Karine, Lin, Zhen-Yuan, Kleinman, Claudia L, Shoubridge, Eric A. 2016. A pseudouridine synthase module is essential for mitochondrial protein synthesis and cell viability. In EMBO reports, 18, 28-38. doi:10.15252/embr.201643391. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27974379/