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Chpf2-flox 基因敲除小鼠

Chpf2-flox 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Chpf2-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-00180

品系全称

C57BL/6JCya-Chpf2em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-100910-Chpf2-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Chpf2-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-00180) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
chondroitin polymerizing factor 2
基因别称
2010209O12Rik，Gm42230，mKIAA1402，mir-671
染色体号
Chr 5 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_133913.2 | Ensembl: ENSMUST00000121863
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~1065 bp
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
更多信息
Chpf2，即chondroitin polymerizing factor 2，是软骨素聚合物因子2，属于软骨素/硫酸皮肤素（CS/DS）糖基转移酶家族成员。在哺乳动物中，CS/DS是细胞外基质（ECM）中重要的结构成分，参与细胞生长、分化、迁移和信号传导等过程。Chpf2在CS/DS的合成中发挥重要作用，它通过催化CS/DS链的聚合，影响ECM的构成和功能。

Chpf2的异常表达与多种疾病的发生发展密切相关。在胶质瘤中，Chpf2是五个糖基化基因中的一个，这些基因的表达差异可以预测患者的预后、免疫微环境浸润和药物敏感性。Chpf2等基因的表达水平越高，患者的预后越差。此外，Chpf2等基因的表达还与免疫细胞的浸润水平相关，提示Chpf2可能参与调节胶质瘤的免疫反应[1]。

在结直肠癌中，Chpf2的表达上调与肿瘤细胞的增殖和转移有关。Chpf2在TNF的刺激下，通过MEK介导的磷酸化，激活NF-κB信号通路，进而上调早期生长因子EGR1的表达，促进结直肠癌细胞的增殖和转移。此外，NF-κB RELA亚基可以促进Chpf2的表达，进一步放大TNF诱导的NF-κB信号通路的激活。这些发现揭示了Chpf2在肿瘤细胞增殖和转移中的“月光”功能，以及Chpf2放大TNF介导的NF-κB信号通路激活的机制[2]。

在颅内动脉瘤的发生发展中，Chpf2的表达水平也受到影响。外泌体中的lncRNA DUXAP8可以影响Chpf2的表达，从而影响颅内动脉瘤的进展。DUXAP8的表达水平与Chpf2的表达水平相关，并且与动脉瘤的大小有关。此外，在HUVEC细胞中，外泌体DUXAP8的转染可以影响Chpf2的表达水平[3]。

在神经元发育过程中，Chpf2的表达也受到调节。在第三孕期的乙醇暴露可以抑制小鼠神经元的Chpf2基因翻译，降低CS-GAG的水平。CS-GAG是ECM的成分之一，可以抑制神经元的发育和可塑性。此外，沉默Chpf2的星形胶质细胞来源的条件培养基可以增加海马神经元神经突分支的数量，表明Chpf2在星形胶质细胞中表达丰富，其翻译受到乙醇的抑制，进而影响神经元的发育[4]。

在肌肉浸润性膀胱癌中，Chpf2是六个与生存相关的基因之一。Chpf2的表达水平与患者的预后相关，可以作为预测患者预后的指标。此外，Chpf2的表达还与免疫细胞浸润水平相关，提示Chpf2可能参与调节肌肉浸润性膀胱癌的免疫反应[5]。

在碳纳米管诱导的恶性胸膜间皮瘤（MPM）中，Chpf2是四个与免疫相关的基因之一。Chpf2的表达水平与患者的预后相关，可以作为预测患者预后的指标。此外，Chpf2的表达还与免疫细胞的浸润水平相关，提示Chpf2可能参与调节MPM的免疫反应[6]。

在结肠癌中，Chpf2是八个与生存相关的糖酵解相关基因之一。这些基因的表达水平可以构建一个风险评分模型，用于预测患者的预后。高风险患者具有较低的CD4+记忆T细胞和静止树突状细胞的表达水平，以及较高的巨噬细胞M0的表达水平。此外，高风险患者对多种化疗药物的反应性较低[7]。

在血栓性疾病中，Chpf2等CS代谢相关基因的变异与血栓性风暴（TS）的发生有关。这些基因的变异可以降低CS的可用性，从而减弱对内皮细胞的保护作用，影响血液凝固的正常调控机制[8]。

在斑马鱼早期发育过程中，Chpf2的表达受到调节。Chpf2在斑马鱼中由两个基因编码，chpfa和chpfb。Chpf2的表达与CS/DS的沉积相关，表明Chpf2在CS/DS的合成中发挥重要作用[9]。

综上所述，Chpf2是一种重要的CS/DS糖基转移酶，参与ECM的构成和功能。Chpf2的异常表达与多种疾病的发生发展密切相关，包括胶质瘤、结直肠癌、颅内动脉瘤、神经元发育、肌肉浸润性膀胱癌、MPM、结肠癌和血栓性疾病。Chpf2在肿瘤细胞增殖、转移和免疫反应中发挥重要作用，其表达水平可以作为预测患者预后的指标。此外，Chpf2还具有独立的染色质调控功能，影响基因表达和干细胞的多能性维持。Chpf2的研究有助于深入理解CS/DS的生物学功能和疾病发生机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献：
1. Yang, Yanbo, Teng, Haiying, Zhang, Yulian, Wang, Zhong, Yu, Yanbing. 2024. A glycosylation-related gene signature predicts prognosis, immune microenvironment infiltration, and drug sensitivity in glioma. In Frontiers in pharmacology, 14, 1259051. doi:10.3389/fphar.2023.1259051. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38293671/
2. Wen, Xiangqiong, Qin, Jiale, Zhang, Xiang, He, Weiling, Wang, Ziyang. 2024. MEK-mediated CHPF2 phosphorylation promotes colorectal cancer cell proliferation and metastasis by activating NF-κB signaling. In Cancer letters, 584, 216644. doi:10.1016/j.canlet.2024.216644. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38253217/
3. Han, Liang, Zhou, Haixia, Guo, Zhigang, Zhang, Haiyang, Liu, Dehua. 2024. Exosomal lncRNA DUXAP8 affecting CHPF2 in the pathogenesis of intracranial aneurysms. In Gene, 908, 148253. doi:10.1016/j.gene.2024.148253. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38341004/
4. Hashimoto, Joel G, Margolies, Nicholas, Zhang, Xiaolu, Carbone, Lucia, Guizzetti, Marina. 2024. Astrocyte extracellular matrix modulates neuronal dendritic development. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2024.08.06.606424. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39211148/
5. Guo, Yupeng, Dong, Jing, Ji, Tao, Rong, Shengzhong, Guan, Hongjun. 2022. A risk score for the prognosis prediction of the muscle-invasive bladder cancer patients who received gemcitabine plus cisplatin chemotherapy. In Aging, 14, 9715-9729. doi:10.18632/aging.204424. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36470668/
6. Xie, Dongli, Hu, Jianchen, Wu, Tong, Cao, Kangli, Luo, Xiaogang. 2021. Four Immune-Related Genes (FN1, UGCG, CHPF2 and THBS2) as Potential Diagnostic and Prognostic Biomarkers for Carbon Nanotube-Induced Mesothelioma. In International journal of general medicine, 14, 4987-5003. doi:10.2147/IJGM.S324365. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34511983/
7. Cui, Zhongqi, Sun, Guifeng, Bhandari, Ramesh, Liu, Zhongchen, Zhao, Shasha. 2021. Comprehensive Analysis of Glycolysis-Related Genes for Prognosis, Immune Features, and Candidate Drug Development in Colon Cancer. In Frontiers in cell and developmental biology, 9, 684322. doi:10.3389/fcell.2021.684322. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34422808/
8. Nuytemans, Karen, Ortel, Thomas L, Gomez, Lissette, Pericak-Vance, Margaret A, Vance, Jeffery M. 2017. Variants in chondroitin sulfate metabolism genes in thrombotic storm. In Thrombosis research, 161, 43-51. doi:10.1016/j.thromres.2017.11.016. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29178990/
9. Filipek-Górniok, Beata, Holmborn, Katarina, Haitina, Tatjana, Kreuger, Johan, Ledin, Johan. 2013. Expression of chondroitin/dermatan sulfate glycosyltransferases during early zebrafish development. In Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists, 242, 964-75. doi:10.1002/dvdy.23981. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23703795/

资料下载

S-CKO-00180_6J_100910_Chpf2_Exon 2_A_strategy.pdf
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