在一项研究中,研究人员使用生物信息学分析方法,对151例AML患者的RNA测序数据进行了分析。他们使用了edgeR软件包来识别差异表达基因(DEGs),并使用ClusterONE软件对蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络进行了模块化分析。此外,他们还进行了KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集分析,以探索差异表达基因所涉及的生物学通路。结果表明,在RUNX1突变的AML患者中,Cfap99基因的表达水平发生了显著变化,并且Cfap99基因被确定为PPI网络中的中心基因之一。此外,Cfap99基因还参与了与癌症相关的通路,如细胞外基质(ECM)受体相互作用通路和环腺苷酸(cAMP)信号通路。这些结果表明,Cfap99基因可能在RUNX1突变的AML患者的发病机制和疾病进展中发挥作用[1]。
1. Zhu, Fangxiao, Huang, Rui, Li, Jing, Huang, Yumei, Lai, Yongrong. 2018. Identification of Key Genes and Pathways Associated with RUNX1 Mutations in Acute Myeloid Leukemia Using Bioinformatics Analysis. In Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research, 24, 7100-7108. doi:10.12659/MSM.910916. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30289875/