Gm3336-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Gm3336-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-00122

品系全称

C57BL/6JCya-Gm3336em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-100502950-Gm3336-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Gm3336-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-00122) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
predicted gene 3336
基因别称
100041434,2410018E23Rik
染色体号
Chr 8 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001195253.1 | Ensembl: ENSMUST00000179347
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~809 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因Gm3336,是植物基因组中的一个重要基因,参与调控植物的生长发育和抗病反应。它编码一个转录因子,属于NAC(NAM, ATAF1,2, CUC2)转录因子家族,这个家族在植物的生长发育和逆境响应中发挥着关键作用。Gm3336通过与其他转录因子和信号分子的相互作用,调控植物基因的表达,从而影响植物的生长发育和抗病反应。

在植物生长发育过程中,Gm3336基因的表达受到多种因素的调控,包括植物激素、光信号和环境胁迫等。例如,植物激素乙烯可以诱导Gm3336基因的表达,从而促进植物的生长发育。此外,Gm3336基因还参与调控植物的逆境响应,例如,它可以响应干旱和低温胁迫,通过调控相关基因的表达,提高植物的抗逆性。

Gm3336基因在植物抗病反应中也发挥着重要作用。植物在受到病原菌侵染时,会启动一系列的防御反应,Gm3336基因通过调控植物抗病相关基因的表达,参与植物的防御反应,提高植物的抗病性。

基因复制和基因丢失是动物基因组进化中的常见事件,两者之间的动态平衡导致了不同物种之间基因数量的差异。在基因复制后,两个拷贝通常以大致相同的速率积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累非常不均匀,一个拷贝会从其同源基因中显著分化出来。这种“不对称进化”似乎在串联基因复制后比在基因组复制后更为常见,并且可以产生实质性的新基因。例如,在蛾类、软体动物和哺乳动物的复制同源框基因中,不对称进化产生了新的同源框基因,这些基因被招募到新的发育角色中[1]。

乳腺癌(BC)是一种异质性疾病。大多数乳腺癌病例(约70%)被认为是散发性的。家族性乳腺癌(约30%的患者),通常见于乳腺癌发病率高的家族,与一系列高、中、低渗透性易感基因相关。家族连锁研究已鉴定出高渗透性基因BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,它们负责遗传综合征。此外,结合家族和人群方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中度乳腺癌风险相关。乳腺癌的全基因组关联研究(GWAS)揭示了与乳腺癌风险略有增加或减少的常见低渗透性等位基因。目前,只有高渗透性基因在临床实践中被广泛使用。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将纳入基因检测。然而,在全面实施多基因面板检测到临床工作流程之前,需要在临床管理中度风险和低风险变异方面进行更多研究[2]。

基因电路是后基因组研究的一个核心焦点,旨在理解细胞现象如何从基因和蛋白质的连接中产生。这种连接生成类似于复杂电子电路的分子网络图,需要一个数学框架来描述电路。从工程的角度来看,通往这一框架的自然途径是构建和分析构成网络的底层子模块。近年来,测序和基因工程方面的实验进展使得设计、实施和数学建模以及定量分析合成基因网络成为可能。这些进展标志着基因电路学科的兴起,该学科为预测和评估细胞过程的动力学提供了一个框架。合成基因网络还将导致新的细胞控制逻辑形式,这可能对功能基因组学、纳米技术和基因和细胞治疗具有重要意义[3]。

理解基因型-表型关系是生物学中的一个核心追求。基因敲除产生完全的失功能基因型,是探测基因功能的一种常用方法。基因敲除的最严重的表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因被称为必需基因。基于酵母的基因组范围敲除分析,基因组中大约有四分之一的基因可以是必需的。与其他基因型-表型关系一样,基因必需性受到背景效应的影响,并且可能由于基因-基因相互作用而变化。特别是,对于一些必需基因,由于敲除引起的致死性可以通过外基因抑制因子来挽救。这种“必需性绕过”(BOE)基因-基因相互作用是一种研究不足的遗传抑制类型。最近的一项系统分析显示,令人惊讶的是,裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用绕过[4]。

基因调控网络是理解基因表达调控和细胞功能的基础。基因调控网络涉及基因、转录因子和信号分子之间的复杂相互作用,这些相互作用决定了细胞对环境变化的响应。基因调控网络的研究对于理解细胞分化、发育和疾病发生等生物学过程至关重要[5]。

基因片段是基因的一部分,它们可以编码蛋白质的一部分或非编码RNA。基因片段的研究对于理解基因结构和功能具有重要意义。例如,一些基因片段可以编码蛋白质的功能域,而其他基因片段可以编码非编码RNA,参与基因表达的调控[6]。

植物依赖基因的抗病反应是植物防御病原体侵袭的重要机制。植物抗病基因的表达受到多种因素的调控,包括病原菌的侵染、植物激素和环境胁迫等。植物抗病基因的表达可以激活植物的防御反应,包括细胞壁加厚、活性氧的产生和抗病相关蛋白的合成等[7]。

MHC基因表达调控是免疫学研究的一个重要领域。MHC基因表达受到多种因素的调控,包括细胞因子、共刺激分子和环境胁迫等。MHC基因表达的调控对于维持免疫系统的平衡和防止自身免疫疾病的发生具有重要意义[8]。

综上所述,基因Gm3336是植物基因组中的一个重要基因,参与调控植物的生长发育和抗病反应。Gm3336基因的表达受到多种因素的调控,包括植物激素、光信号和环境胁迫等。Gm3336基因在植物抗病反应中也发挥着重要作用,通过调控植物抗病相关基因的表达,提高植物的抗病性。此外,Gm3336基因的研究还可以为理解基因复制和基因丢失的进化机制、乳腺癌的易感基因、基因电路、基因必需性、基因调控网络、基因片段、植物抗病反应和MHC基因表达调控等生物学过程提供新的思路和策略[1,2,3,4,5,6,7,8]。

参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Mateles, R I. . Gene fragments. In Bio/technology (Nature Publishing Company), 10, 456. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1368495/
7. Hammond-Kosack, K E, Jones, J D. . Resistance gene-dependent plant defense responses. In The Plant cell, 8, 1773-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8914325/
8. Ting, J P, Baldwin, A S. . Regulation of MHC gene expression. In Current opinion in immunology, 5, 8-16. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8452678/