基因4930480E11Rik是一种位于小鼠基因组中的基因,属于基因家族中的一个成员。这个基因家族在动物基因组进化过程中经历了基因复制和基因丢失的动态变化,这些变化导致了不同物种之间基因数量的显著差异。在基因复制后,通常两个副本基因的序列变化速率大致相同。然而,在有些情况下,序列变化的积累是不均匀的,一个副本基因会与其副本基因产生显著差异。这种"不对称进化"现象在串联基因复制后比在基因组复制后更为常见,并且可以产生新的基因。例如,在鳞翅目昆虫、软体动物和哺乳动物的复制的同源盒基因中,就观察到了不对称进化的例子,这些新的同源盒基因被招募到新的发育功能中。这种不对称基因复制分化的普遍性往往被低估,部分原因是因为难以使用标准的系统发育方法解决高度分化的基因的起源问题[1]。
在乳腺癌中,除了BRCA1和BRCA2等高外显率的基因外,还有许多其他基因与家族性乳腺癌的风险相关。这些基因包括高外显率基因PTEN和TP53,以及DNA修复相关基因如CHEK2、ATM、BRIP1 (FANCJ)、PALB2 (FANCN)和RAD51C (FANCO)。目前,临床实践中主要使用高外显率基因进行广泛检测。随着下一代测序技术的发展,预期所有家族性乳腺癌基因都将纳入遗传检测中。然而,在将多基因面板检测完全整合到临床工作流程之前,还需要进行额外的临床管理研究,以解决中等和低风险变异的问题[2]。
在基因工程领域,构建和分析了合成基因网络,这些网络可以用于数学建模和定量分析,从而预测和评估细胞过程的动态变化。合成基因网络的发展为功能性基因组学、纳米技术和基因及细胞治疗等领域带来了新的逻辑形式,具有重要的应用前景[3]。
基因敲除技术被广泛用于研究基因功能,然而,基因敲除导致的致命表型使得一些基因被认为是必需基因。研究发现,在一些必需基因中,通过基因-基因相互作用可以挽救由敲除引起的致命性,这种现象被称为"必需性的绕过"。在裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中,近30%的必需基因的必需性可以通过"必需性的绕过"相互作用而被绕过[4]。
基因调控网络是一个复杂的系统,涉及基因和蛋白质之间的相互作用。近年来,随着测序技术和基因工程的进步,构建和分析了合成基因网络,为理解和预测细胞过程的动态变化提供了新的框架。此外,基因调控网络的研究还揭示了基因表达和干细胞多能性维持的机制[5]。
综上所述,基因4930480E11Rik是一个在基因组进化过程中经历了复制和丢失动态变化的基因。这个基因家族的成员在发育过程中发挥着重要的作用。此外,基因复制和丢失的动态变化,以及基因调控网络的研究,都为理解基因功能和生物学过程提供了新的视角和框架。未来,进一步研究基因4930480E11Rik和其他基因的功能和调控机制,将有助于深入理解基因表达和生物学过程的复杂性和多样性,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[1-5]。
参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/