基因1700066M21Rik,也称为Rik, gene symbol: 1700066M21Rik,是小鼠基因组中的一种基因。它位于染色体17上,属于假基因家族。该基因在正常小鼠发育过程中不表达,但在某些病理状态下可能会表达,例如某些类型的癌症。基因1700066M21Rik的功能和生物学作用尚不完全清楚,需要进一步的研究来阐明。
在进化过程中,基因复制和基因丢失是常见事件,它们共同决定了物种间基因数量的差异。在基因复制后,通常两个副本基因会以大致相同的速率积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累是不均匀的,一个副本基因会与其同源基因发生显著的差异。这种非对称进化在串联基因复制后比在全基因组复制后更常见,并且可以产生全新的基因。例如,在蛾类、软体动物和哺乳动物中,非对称进化导致了新的同源异型基因的形成,这些基因被招募到新的发育角色中[1]。
乳腺癌是一种异质性很高的疾病,大多数病例(约70%)被认为是散发的。家族性乳腺癌(约30%的患者)通常出现在乳腺癌高发家族中,已发现与许多高、中、低渗透性易感基因有关。家族连锁研究已经确定了BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53等高渗透性基因,这些基因负责遗传性综合征。此外,基于家族和人群的方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中度乳腺癌风险相关。全基因组关联研究(GWAS)在乳腺癌中揭示了许多与乳腺癌风险略微增加或降低相关的常见低渗透性等位基因。目前,只有高渗透性基因被广泛应用于临床实践。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将被纳入基因检测。然而,在将多基因面板检测完全整合到临床工作流程之前,需要进一步研究中等和低风险变异体的临床管理[2]。
基因调控网络在基因表达调控中起着重要作用。基因调控网络是指基因和蛋白质之间的相互作用,这些相互作用构成了复杂的分子网络。理解基因调控网络的连通性对于揭示细胞现象的起源至关重要。近年来,测序和遗传工程技术的进步使得设计和实施合成的基因网络成为可能,这些基因网络可以进行数学建模和定量分析。这些进展标志着基因电路学科的兴起,该学科为预测和评估细胞过程的动力学提供了一个框架。合成的基因网络还将导致新的逻辑形式的细胞控制,这在功能基因组学、纳米技术和基因与细胞治疗中可能具有重要应用[3]。
基因敲除是研究基因功能的一种常用方法,它通过破坏基因的功能来研究基因的作用。基因敲除可以导致基因型-表型关系的改变,其中最严重的表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因被称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析表明,基因组中高达约四分之一的基因可能是必需的。与基因敲除的其他基因型-表型关系一样,基因必需性受背景效应的影响,并可能因基因-基因相互作用而变化。特别是,对于某些必需基因,由敲除引起的致死性可以通过外基因抑制因子来挽救。这种“必需性绕过”(BOE)基因-基因相互作用是一种未被充分研究的遗传抑制类型。最近的一项系统分析表明,令人惊讶的是,裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用绕过[4]。
基因表达调控涉及基因调控网络和基因敲除等机制。基因调控网络是指基因和蛋白质之间的相互作用,这些相互作用构成了复杂的分子网络。理解基因调控网络的连通性对于揭示细胞现象的起源至关重要。基因敲除是一种常用的研究基因功能的方法,它通过破坏基因的功能来研究基因的作用。基因敲除可以导致基因型-表型关系的改变,其中最严重的表型后果是致死性[5]。
基因片段是基因序列的一部分,它们可以存在于不同的染色体位置或不同的基因组中。基因片段可以包含基因的部分或全部编码序列,以及基因的调控区域。基因片段的研究对于理解基因的功能和进化具有重要意义。基因片段可以参与基因表达调控,影响基因的活性和功能[6]。
植物抗病反应是一种复杂的生物学过程,它涉及多种基因和蛋白质的相互作用。抗病基因在植物抗病反应中起着重要作用,它们可以识别病原体并激活植物的抗病机制。抗病基因依赖的植物抗病反应包括细胞壁的加固、细胞膜的脂质过氧化、活性氧的产生、植物激素的合成和信号传导等。这些反应共同作用,保护植物免受病原体的侵害[7]。
主要组织相容性复合体(MHC)是一组基因,它们编码的分子在免疫系统中发挥着重要作用。MHC分子在细胞表面展示抗原肽,从而激活T细胞并启动免疫反应。MHC基因的表达受到多种因素的调控,包括转录因子、DNA甲基化和组蛋白修饰等。近年来,对MHC基因表达的调控研究取得了重要进展,这些研究有助于深入理解MHC分子在免疫系统中的作用机制[8]。
基因1700066M21Rik是一种假基因,其功能和生物学作用尚不完全清楚。然而,基因复制和基因丢失是进化过程中常见事件,它们共同决定了物种间基因数量的差异。基因调控网络和基因敲除等机制在基因表达调控中起着重要作用。基因片段和抗病基因依赖的植物抗病反应是生物学中的重要过程。MHC基因表达的调控研究对于理解MHC分子在免疫系统中的作用机制具有重要意义。未来需要进一步研究基因1700066M21Rik的功能和生物学作用,以及它在疾病发生和发展中的作用。
参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Mateles, R I. . Gene fragments. In Bio/technology (Nature Publishing Company), 10, 456. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1368495/
7. Hammond-Kosack, K E, Jones, J D. . Resistance gene-dependent plant defense responses. In The Plant cell, 8, 1773-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8914325/
8. Ting, J P, Baldwin, A S. . Regulation of MHC gene expression. In Current opinion in immunology, 5, 8-16. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8452678/