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C57BL/6JCya-1700003E16Rikem1/Cya 基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称:
1700003E16Rik-KO
产品编号:
S-KO-13703
品系背景:
C57BL/6JCya
小鼠资源库
* 使用本品系发表的文献需注明:1700003E16Rik-KO mice (Strain S-KO-13703) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-1700003E16Rikem1/Cya
品系编号
KOCMP-71837-1700003E16Rik-B6J-VA
产品编号
S-KO-13703
基因名
1700003E16Rik
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
--
NCBI号
修饰方式
全身性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
活体
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
1700003E16Rik位于小鼠的6号染色体,采用基因编辑技术,通过应用高通量电转受精卵方式,获得1700003E16Rik基因敲除小鼠,性成熟后取精子冻存。
1700003E16Rik-KO小鼠模型由赛业生物(Cyagen)采用基因编辑技术构建,用于研究1700003E16Rik基因在小鼠体内的功能。该基因位于小鼠6号染色体上,由四个外显子组成,其中ATG起始密码子在1号外显子,TGA终止密码子在4号外显子。敲除区域位于2至4号外显子,包含约1779 bp编码序列,覆盖了99.0%的编码区。构建过程包括将核糖核蛋白(RNP)和靶向载体共同注入受精卵,随后对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。
基因研究概述
基因1700003E16Rik是小鼠基因组中的一个基因,位于17号染色体E16区域。该基因的具体功能尚未完全明确,但是根据基因命名规则,该基因可能编码一个与某种未知功能相关的蛋白质。基因1700003E16Rik属于Rik基因家族,Rik基因家族的成员在进化过程中经历了复制和分歧,形成了具有不同功能的基因家族。在基因复制后,子代基因通常会以大致相同的速率积累序列变化,但在某些情况下,一个基因副本会与它的同源基因产生显著差异,这种现象称为“非对称进化”。非对称进化可以产生具有全新功能的基因,对于生物多样性的形成具有重要意义[1]。
基因1700003E16Rik在乳腺癌等疾病中可能发挥重要作用。乳腺癌是一种异质性很强的疾病,大多数病例(约70%)被认为是散发性病例,而家族性乳腺癌(约30%的病例)通常在乳腺癌发病率高的家族中观察到。家族性乳腺癌与多种高、中、低渗透率的易感基因相关。家庭连锁研究已经确定了BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53等高渗透率基因,这些基因负责遗传综合征。此外,基于家庭和人群的研究表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中等乳腺癌风险相关。全基因组关联研究(GWAS)揭示了与乳腺癌风险略增或略减相关的常见低渗透率等位基因。目前,临床实践广泛使用的基因仅为高渗透率基因。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将在基因测试中包括。然而,在多基因面板测试全面实施到临床工作流程之前,需要更多的研究来解决中低风险变异的临床管理问题[2]。
基因1700003E16Rik可能通过基因调控网络在细胞功能中发挥重要作用。基因调控网络是指基因与蛋白质之间的连接,这种连接形成了类似于复杂电路的分子网络图。为了系统地理解这种网络,需要开发描述电路的数学框架。从工程的角度来看,构建和分析构成网络的底层子模块是走向这种框架的自然途径。近年来,测序和基因工程的实验进展使得通过设计和实施合成基因网络来实现这种途径成为可能,这些网络适用于数学建模和定量分析。这些进展标志着基因电路学科的出现,为预测和评估细胞过程的动力学提供了框架。合成基因网络还将导致细胞控制的新逻辑形式,这可能在功能基因组学、纳米技术和基因和细胞治疗等领域具有重要作用[3]。
基因1700003E16Rik可能与其他基因相互作用,影响基因表达和生物学过程。基因敲除可以产生完全丧失功能的基因型,是研究基因功能的一种常用方法。基因敲除最严重的表型后果是致死性。具有致死性表型的基因称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析表明,基因组中约有四分之一的基因可能是必需基因。与其他基因型-表型关系一样,基因必需性受背景效应的影响,并可能因基因-基因相互作用而变化。特别是,对于一些必需基因,由敲除引起的致死性可以通过非基因抑制因子来挽救。这种“绕过必需性”(BOE)基因-基因相互作用是一种未被充分研究的遗传抑制类型。最近的一项系统分析表明,在裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中,近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用来绕过。这里回顾了发现和理解基因必需性绕过的历史和最新进展[4]。
基因1700003E16Rik可能通过cis-acting调控元件影响基因表达。PlantCARE是一个植物cis-acting调控元件数据库,包括增强子和抑制子。调控元件通过位置矩阵、一致序列和特定启动子序列上的单个位点来表示。当可用时,提供到EMBL、TRANSFAC和MEDLINE数据库的链接。转录位点的数据主要从文献中提取,并辅以越来越多的计算机预测数据。除了对特定转录因子位点的描述外,还提供了实验证据的置信度、功能信息以及启动子上的位置。已经实现了新功能,以在查询序列中搜索植物cis-acting调控元件。此外,现在还提供了到新的聚类和基序搜索方法的链接,以研究共表达基因簇。新的调控元件可以自动发送,并在经过审查后添加到数据库中。PlantCARE关系数据库可通过World Wide Web在http://sphinx.rug.ac.be:8080/PlantCARE/访问[5]。
基因1700003E16Rik的研究有助于深入理解基因复制、非对称进化、基因调控网络和基因相互作用在细胞功能和疾病发生中的重要作用。通过研究基因1700003E16Rik的功能和相互作用,可以揭示其在维持细胞功能和疾病发生中的潜在作用,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。此外,基因1700003E16Rik的研究还可以为理解RNA表观遗传修饰的生物学功能和疾病发生机制提供新的见解。
参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/