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C57BL/6JCya-1700019A02Rikem1/Cya 基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称:
1700019A02Rik-KO
产品编号:
S-KO-13056
品系背景:
C57BL/6JCya
小鼠资源库
* 使用本品系发表的文献需注明:1700019A02Rik-KO mice (Strain S-KO-13056) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-1700019A02Rikem1/Cya
品系编号
KOCMP-69397-1700019A02Rik-B6J-VA
产品编号
S-KO-13056
基因名
1700019A02Rik
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
--
NCBI号
修饰方式
全身性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
在研小鼠
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
1700019A02Rik位于小鼠的1号染色体,采用基因编辑技术,通过应用高通量电转受精卵方式,获得1700019A02Rik基因敲除小鼠,性成熟后取精子冻存。
1700019A02Rik-KO小鼠模型由赛业生物(Cyagen)采用基因编辑技术构建。该模型用于研究1700019A02Rik基因在小鼠体内的功能。1700019A02Rik基因位于小鼠1号染色体上,由10个外显子组成,其中ATG起始密码子在2号外显子,TAG终止密码子在10号外显子。赛业生物(Cyagen)选择3号外显子至5号外显子作为目标区域,该区域覆盖了基因编码区域的40.87%。有效敲除区域的大小约为3448个碱基对。构建过程包括将核糖核蛋白(RNP)和靶向载体共同注入受精卵,随后对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。
基因研究概述
基因1700019A02Rik是小鼠基因组中一个未充分研究的基因,其功能目前尚不明确。该基因属于Rik基因家族,这些基因通常具有未知的生物学功能,并且许多Rik基因在人类和小鼠中是保守的,表明它们可能具有重要的生物学作用。基因1700019A02Rik的编码产物可能参与了细胞内的某些生物学过程,但其具体功能、表达模式以及对生物体的影响仍需要进一步的研究来揭示。
基因复制和基因丢失是动物基因组进化中的频繁事件,两者之间的平衡对物种间基因数量的显著差异有所贡献。在基因复制之后,通常两个副本基因会以大致相同的速率积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累会非常不均匀,一个副本会与另一个副本产生显著的差异。这种“非对称进化”在串联基因复制后比全基因组复制后更为常见,并能够产生实质上全新的基因。例如,在蛾类、软体动物和哺乳动物中,复制后的同源框基因的非对称进化产生了新的同源框基因,这些基因被招募到新的发育作用中[1]。因此,非对称基因复制可能是基因1700019A02Rik产生和进化的一个可能途径。
乳腺癌是一种异质性很高的疾病,大部分乳腺癌病例(约70%)被认为是散发的。家族性乳腺癌(约占患者的30%),通常在乳腺癌发病率高的家族中观察到,与许多高、中、低外显率的易感基因相关。家族连锁研究已确定高外显率基因,如BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,它们负责遗传综合征。此外,结合家族和人群研究方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中等的乳腺癌风险相关[2]。基因1700019A02Rik是否与乳腺癌或其他疾病的易感性相关,目前尚不清楚。
基因调控网络是细胞现象如何从基因和蛋白质的连接中产生的一个重要研究领域。这种连接产生了类似于复杂电路的分子网络图,并且需要开发描述电路的数学框架。从工程学的角度来看,构建和分析构成网络的基础模块是通向这种框架的自然途径。测序和遗传工程的最新实验进展使这种方法成为可能,通过设计和实施易于数学建模和定量分析的合成基因网络。这些发展标志着基因电路学科的出现,该学科提供了一个预测和评估细胞过程动态的框架。合成基因网络还将导致细胞控制的新逻辑形式,这可能在功能基因组学、纳米技术和基因及细胞治疗中具有重要作用[3]。基因1700019A02Rik可能参与了基因调控网络的某些方面,但其具体作用尚需研究。
理解基因型-表型关系是生物学中的核心目标。基因敲除产生完全的基因失活基因型,是研究基因功能的一种常用方法。基因敲除的最严重表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因被称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析表明,基因组中大约四分之一的基因可以是必需的。与基因型-表型关系一样,基因必需性受背景影响,并且可能因基因-基因相互作用而变化。特别是,对于某些必需基因,由敲除引起的致死性可以通过非基因抑制因子来挽救。这种“必需性的绕过”(BOE)基因-基因相互作用是一种被低估的遗传抑制类型。最近的一项系统分析表明,令人惊讶的是,裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用来绕过[4]。这表明基因1700019A02Rik的必需性可能受到其他基因的调控。
植物CARE是一个植物顺式作用调控元件数据库,提供了对启动子序列进行计算机分析的工具。该数据库提供了转录位点的信息,包括实验证据的置信水平、功能信息和在启动子上的位置。新功能已实现,用于在查询序列中搜索植物顺式作用调控元件。此外,现在还提供了链接到新的聚类和基序搜索方法,以研究共表达基因的簇。新的调控元件可以自动发送,并在审查后添加到数据库中[5]。虽然植物CARE数据库主要针对植物基因,但其方法和技术对于研究包括基因1700019A02Rik在内的小鼠基因可能具有借鉴意义。
基因片段是基因序列的一部分,它们可能具有独立的生物学功能。基因片段在基因表达调控和遗传变异中起着重要作用[6]。基因1700019A02Rik的基因结构可能包含具有特定功能的基因片段,这些片段可能在基因表达调控中发挥作用。
植物中的抗性基因介导的防御反应对于植物抵抗病原体至关重要。抗性基因编码的蛋白质能够识别病原体相关分子模式(PAMPs)或效应蛋白,并触发植物免疫反应。这些反应包括活性氧的积累、钙离子的变化和抗微生物代谢物的产生,这些都有助于植物抵御病原体[7]。基因1700019A02Rik可能参与了小鼠或其他生物的防御反应,但其具体作用尚不清楚。
主要组织相容性复合体(MHC)基因表达调控是免疫学研究的一个重要领域。MHC基因编码的分子在免疫系统中起着关键作用,它们参与抗原的呈递和免疫应答的调节。研究MHC基因表达调控机制对于理解免疫系统的功能至关重要[8]。基因1700019A02Rik是否参与了MHC基因表达调控,目前尚不清楚。
基因的定义是一个复杂的问题,涉及到基因的功能、结构和表达等多个方面[9]。基因1700019A02Rik作为一种未充分研究的基因,其定义和功能仍需进一步的研究来明确。
综上所述,基因1700019A02Rik是一种未充分研究的小鼠基因,其功能、表达模式和对生物体的影响尚需进一步的研究来揭示。基因复制、基因调控网络、基因必需性的绕过、植物顺式作用调控元件数据库、基因片段、植物抗性基因介导的防御反应、MHC基因表达调控和基因的定义等概念和技术可能为研究基因1700019A02Rik提供新的思路和方法。未来的研究应该重点关注基因1700019A02Rik的功能、表达模式、与其他基因的相互作用以及其在疾病发生中的作用,以便更好地理解其生物学功能和在生物体中的重要性。
参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Mateles, R I. . Gene fragments. In Bio/technology (Nature Publishing Company), 10, 456. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1368495/
7. Hammond-Kosack, K E, Jones, J D. . Resistance gene-dependent plant defense responses. In The Plant cell, 8, 1773-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8914325/
8. Ting, J P, Baldwin, A S. . Regulation of MHC gene expression. In Current opinion in immunology, 5, 8-16. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8452678/
9. Epp, C D. . Definition of a gene. In Nature, 389, 537. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9335484/