智鼠故事 
C57BL/6JCya-Ppidem1/Cya 基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称：
Ppid-KO
产品编号：
S-KO-12423
品系背景：
C57BL/6JCya
* 使用本品系发表的文献需注明：Ppid-KO mice (Strain S-KO-12423) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
只
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Ppidem1/Cya
品系编号
KOCMP-67738-Ppid-B6J-VA
产品编号
S-KO-12423
基因名
Ppid
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
Ppidl；CYP-40；4930564J03Rik
NCBI号
修饰方式
全身性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
在研小鼠
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Ppid位于小鼠的3号染色体，采用基因编辑技术，通过应用高通量电转受精卵方式，获得Ppid基因敲除小鼠，性成熟后取精子冻存。
Ppid-KO小鼠模型是由赛业生物（Cyagen）采用基因编辑技术构建的全基因组敲除小鼠。该模型旨在研究Ppid基因在小鼠体内的功能。Ppid基因位于小鼠3号染色体上，由10个外显子组成，其中ATG起始密码子在1号外显子，TAA终止密码子在10号外显子。赛业生物（Cyagen）选择第1号至7号外显子作为目标区域进行敲除，覆盖了80.54%的编码区域，敲除区域的大小约为8927碱基对。构建Ppid-KO小鼠模型的生成过程包括将核糖核蛋白（RNP）和靶向载体共同注入受精卵。随后，对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。通过基因编辑技术，赛业生物（Cyagen）成功构建了Ppid-KO小鼠模型，为研究Ppid基因在小鼠体内的功能提供了重要的实验工具。
基因研究概述
Ppid基因编码的蛋白质为肽基脯氨酰异构酶D（Peptidylprolyl isomerase D），属于环孢菌素家族成员。Ppid基因在多种生物学过程中发挥重要作用，包括细胞应激反应、蛋白质折叠、细胞凋亡、细胞信号传导等。Ppid基因的表达受多种转录因子和信号通路的调控，包括热休克因子、Cpx双组分系统等。
Ppid基因在炎症性肠病（IBD）中发挥重要作用。研究表明，Ppid基因中的IBD风险变异体可以调节PpiD的表达，从而影响线粒体膜电位，进而影响巨噬细胞的炎症反应[1]。此外，Ppid基因的表达受Cpx双组分系统和热休克因子的调控，参与细胞应激反应和蛋白质折叠[2]。
Ppid基因在杏仁核介导的恐惧消退中也发挥重要作用。研究表明，Ppid基因可以调节杏仁核中兴奋性和抑制性神经元的表达，从而影响恐惧消退过程[3]。Ppid基因还可以与糖皮质激素受体（GR）共定位，并通过GR信号通路影响恐惧消退[3]。
Ppid基因还与 stuttering 相关。研究发现，Ppid基因中的突变可以导致 stuttering，并且Ppid基因的表达受应激和性激素的调控[6]。
Ppid基因在肺癌中也发挥重要作用。研究表明，Ppid基因的表达与肺癌患者的预后相关，并且Ppid基因可以通过影响线粒体钙离子通道的开放和关闭，调节肺癌细胞的存活和死亡[7]。
Ppid基因编码的蛋白质PpiD在细菌的蛋白质折叠过程中发挥重要作用。研究表明，PpiD可以催化外膜蛋白的折叠，并且PpiD基因的表达受Cpx双组分系统的调控[2]。此外，PpiD还可以与噬菌体T4的中央突起复合物相互作用，参与噬菌体T4感染宿主细胞的过程[5]。
Ppid基因编码的蛋白质PpiD在细胞凋亡中也发挥重要作用。研究表明，PpiD可以促进线粒体钙离子通道的开放，从而导致细胞凋亡[4]。此外，PpiD的表达受多种信号通路的调控，包括NF-κB信号通路、PI3K/AKT信号通路等[1,4]。
综上所述，Ppid基因编码的蛋白质PpiD在多种生物学过程中发挥重要作用，包括细胞应激反应、蛋白质折叠、细胞凋亡、细胞信号传导等。Ppid基因的表达受多种转录因子和信号通路的调控，并且Ppid基因的突变与多种疾病相关，包括炎症性肠病、恐惧症、stuttering 和肺癌等。Ppid基因的研究有助于深入理解蛋白质折叠、细胞凋亡、细胞信号传导等生物学过程的机制，并为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献：
1. Nasser, Joseph, Bergman, Drew T, Fulco, Charles P, Lander, Eric S, Engreitz, Jesse M. 2021. Genome-wide enhancer maps link risk variants to disease genes. In Nature, 593, 238-243. doi:10.1038/s41586-021-03446-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33828297/
2. Dartigalongue, C, Raina, S. . A new heat-shock gene, ppiD, encodes a peptidyl-prolyl isomerase required for folding of outer membrane proteins in Escherichia coli. In The EMBO journal, 17, 3968-80. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9670013/
3. Gunduz-Cinar, Ozge, Brockway, Emma, Lederle, Lauren, Chesler, Elissa J, Holmes, Andrew. 2018. Identification of a novel gene regulating amygdala-mediated fear extinction. In Molecular psychiatry, 24, 601-612. doi:10.1038/s41380-017-0003-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29311651/
4. Protasoni, Margherita, López-Polo, Vanessa, Stephan-Otto Attolini, Camille, Kovatcheva, Marta, Serrano, Manuel. 2024. Cyclophilin D plays a critical role in the survival of senescent cells. In The EMBO journal, 43, 5972-6000. doi:10.1038/s44318-024-00259-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39448884/
5. Wenzel, Sabrina, Shneider, Mikhail M, Leiman, Petr G, Kuhn, Andreas, Kiefer, Dorothee. 2020. The Central Spike Complex of Bacteriophage T4 Contacts PpiD in the Periplasm of Escherichia coli. In Viruses, 12, . doi:10.3390/v12101135. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33036312/
6. Morgan, Angela T, Scerri, Thomas S, Vogel, Adam P, Bahlo, Melanie, Hildebrand, Michael S. . Stuttering associated with a pathogenic variant in the chaperone protein cyclophilin 40. In Brain : a journal of neurology, 146, 5086-5097. doi:10.1093/brain/awad314. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37977818/
7. Wang, Guoyu, Liu, Xue, Liu, Huaman, Shao, Yumeng, Jia, Xinhua. 2023. A novel necroptosis related gene signature and regulatory network for overall survival prediction in lung adenocarcinoma. In Scientific reports, 13, 15345. doi:10.1038/s41598-023-41998-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37714937/
