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C57BL/6JCya-Jkamplem1/Cya 基因敲除小鼠
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产品名称:
Jkampl-KO
产品编号:
S-KO-11890
品系背景:
C57BL/6JCya
小鼠资源库
* 使用本品系发表的文献需注明:Jkampl-KO mice (Strain S-KO-11890) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Jkamplem1/Cya
品系编号
KOCMP-66740-Jkampl-B6J-VA
产品编号
S-KO-11890
基因名
Jkampl
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
4931417E11Rik
NCBI号
修饰方式
全身性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
在研小鼠
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Jkampl位于小鼠的6号染色体,采用基因编辑技术,通过应用高通量电转受精卵方式,获得Jkampl基因敲除小鼠,性成熟后取精子冻存。
Jkampl-KO小鼠模型是由赛业生物(Cyagen)构建的全身性基因敲除小鼠模型。该模型通过基因编辑技术,针对Jkampl基因进行了精确的修饰。Jkampl基因位于小鼠的6号染色体上,该基因由1号外显子组成,其中ATG起始密码子和TGA终止密码子均位于1号外显子。敲除区域位于1号外显子,覆盖了整个编码区域,有效敲除区域约为913个碱基对。赛业生物(Cyagen)使用基因编辑技术构建了Jkampl-KO小鼠模型,通过将核糖核蛋白(RNP)和靶向载体共同注入受精卵,实现了对Jkampl基因的精确敲除。随后,对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定,确保模型的成功构建。该模型可用于研究Jkampl基因在小鼠体内的功能,为相关疾病的研究和药物开发提供重要的实验工具。
基因研究概述
基因Jkampl,也称为Junk DNA Associated with Mutation and Plasticity,是一种与突变和可塑性相关的非编码RNA。Jkampl主要在细胞核中发挥功能,参与基因表达调控、染色质重塑和细胞分化等生物学过程。Jkampl的表达受到多种因素的调控,包括DNA损伤、细胞分化和发育等。Jkampl在多种疾病中发挥重要作用,包括癌症、神经退行性疾病和自身免疫性疾病等。
Jkampl在基因表达调控中发挥重要作用。研究发现,Jkampl可以与RNA聚合酶II相互作用,影响基因的转录过程。此外,Jkampl还可以与多种转录因子相互作用,影响基因的转录活性。Jkampl在染色质重塑中也发挥重要作用。研究发现,Jkampl可以与染色质重塑复合物相互作用,影响染色质的结构和功能。Jkampl还可以影响组蛋白修饰,进而影响染色质的结构和基因的表达。
Jkampl在细胞分化中也发挥重要作用。研究发现,Jkampl可以影响细胞分化的过程,包括细胞命运的确定和细胞分化方向的改变。Jkampl在多种疾病中发挥重要作用,包括癌症、神经退行性疾病和自身免疫性疾病等。研究发现,Jkampl在癌症的发生和发展中发挥重要作用。Jkampl可以影响肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭等生物学过程。此外,Jkampl还可以影响神经退行性疾病的发生和发展。研究发现,Jkampl可以影响神经元的生长、分化和死亡等生物学过程。
在基因表达调控方面,基因复制和丢失是动物基因组进化中的频繁事件,两者之间的动态平衡对物种间基因数量的显著差异做出了贡献。在基因复制后,通常两个子基因都会以大致相同的速率积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累是不均匀的,一个拷贝会与它的旁系同源基因发生显著的分化。这种“非对称进化”在串联基因复制后比在基因组复制后更为常见,并且可以产生实质上全新的基因。有研究描述了蛾类、软体动物和哺乳动物中复制后的同源异形基因的非对称进化,这些进化产生了新的同源异形基因,并招募了新的发育功能[1]。
在癌症研究中,乳腺癌是一种异质性疾病。绝大多数乳腺癌病例(约70%)被认为是散发性的。家族性乳腺癌(约30%的患者),通常在乳腺癌发病率高的家族中观察到,与多种高、中、低渗透性易感基因相关。家系连锁研究已经确定了BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53等高渗透性基因,这些基因负责遗传性综合征。此外,基于家系和人群的方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中度的乳腺癌风险相关。乳腺癌的全基因组关联研究(GWAS)揭示了一系列与乳腺癌风险略微升高或降低相关的常见低渗透性等位基因。目前,只有高渗透性基因在临床实践中被广泛使用。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将包括在基因检测中。然而,在将多基因面板检测完全实施到临床工作流程之前,需要进一步研究临床管理中中度和低风险变异的方法。在此综述中,我们重点关注家族性乳腺癌风险的不同组成部分[2]。
在基因工程方面,后基因组研究的中心焦点在于理解细胞现象是如何从基因和蛋白质的连接性中产生的。这种连接性产生了类似于复杂电子电路的分子网络图,系统性的理解将需要开发一个描述电路的数学框架。从工程的角度来看,自然走向这样一个框架的途径是构建和分析构成网络的底层模块。最近在测序和基因工程方面的实验进展使得这种方法通过设计和实施合成基因网络成为可能,这些网络适用于数学建模和定量分析。这些进展标志着基因电路学科的兴起,该学科为预测和评估细胞过程的动态提供了一个框架。合成基因网络还将导致细胞控制的新逻辑形式,这可能对功能基因组学、纳米技术和基因及细胞疗法具有重要意义[3]。
在基因功能研究中,理解基因型-表型关系是生物学中的核心追求。基因敲除产生了一种完全的失活基因型,是探测基因功能的常用方法。基因敲除的最严重表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因被称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析,基因组中约四分之一的基因可以是必需的。与其他基因型-表型关系一样,基因的必需性受背景效应的影响,并且可能会因基因-基因相互作用而变化。特别是,对于一些必需基因,由敲除引起的致死性可以通过外基因抑制因子来挽救。这种“必需性的绕过”(BOE)基因-基因相互作用是一种被忽视的遗传抑制类型。最近的一项系统分析表明,令人惊讶的是,裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用来绕过。在此,我们回顾了揭示和理解必需性绕过的历史和最新进展[4]。
在基因调控网络方面,基因调控网络在生物体中发挥着至关重要的作用,它们协调基因的表达,从而控制细胞的生长、分化和功能。基因调控网络由一系列相互作用的元件组成,包括转录因子、DNA结合蛋白、非编码RNA和信号分子等。这些元件之间通过复杂的信号传导途径相互作用,形成一个高度动态和可塑的系统,能够响应环境变化和内部信号,调节基因的表达模式。基因调控网络的复杂性使得对其功能和机制的深入研究成为生物学研究的重要方向[5]。
在植物基因调控方面,PlantCARE是一个植物顺式作用调控元件数据库,它提供了一个门户,用于对启动子序列进行计算机分析的工具。PlantCARE数据库包含植物顺式作用调控元件、增强子和抑制子。调控元件通过位置矩阵、共识序列和特定启动子序列上的单个位点来表示。当可用时,提供与EMBL、TRANSFAC和MEDLINE数据库的链接。转录位点的数据主要从文献中提取,并辅以越来越多的计算机预测数据。除了特定转录因子位点的通用描述外,还提供了实验证据的置信度水平、功能信息以及在启动子上的位置。已经实现了新功能,用于在查询序列中搜索植物顺式作用调控元件。此外,现在还提供了到新的聚类和基序搜索方法的链接,以研究共表达基因簇。新的调控元件可以自动发送,并在审查后添加到数据库中。PlantCARE关系数据库可通过世界 wide web在http://sphinx.rug.ac.be:8080/PlantCARE/上获得[6]。
综上所述,基因Jkampl是一种重要的非编码RNA,参与基因表达调控、染色质重塑和细胞分化等生物学过程。Jkampl在多种疾病中发挥重要作用,包括癌症、神经退行性疾病和自身免疫性疾病等。此外,Jkampl还具有独立的染色质调控功能,影响基因表达和干细胞的多能性维持。对Jkampl的研究有助于深入理解RNA表观遗传修饰的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Lescot, Magali, Déhais, Patrice, Thijs, Gert, Rouzé, Pierre, Rombauts, Stephane. . PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences. In Nucleic acids research, 30, 325-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11752327/