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C57BL/6JCya-4921524J17Rikem1/Cya 基因敲除小鼠
产品名称:
4921524J17Rik-KO
产品编号:
S-KO-11876
品系背景:
C57BL/6JCya
小鼠资源库
* 使用本品系发表的文献需注明:4921524J17Rik-KO mice (Strain S-KO-11876) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-4921524J17Rikem1/Cya
品系编号
KOCMP-66714-4921524J17Rik-B6J-VB
产品编号
S-KO-11876
基因名
4921524J17Rik
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
--
NCBI号
修饰方式
全身性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
活体
环境标准
SPF
供应地区
全球范围
品系详情
4921524J17Rik位于小鼠的8号染色体,采用基因编辑技术,通过应用高通量电转受精卵方式,获得4921524J17Rik基因敲除小鼠,性成熟后取精子冻存。
4921524J17Rik-KO小鼠模型是由赛业生物(Cyagen)利用基因编辑技术构建的全基因组敲除小鼠。该模型用于研究4921524J17Rik基因在小鼠体内的功能。4921524J17Rik基因位于小鼠8号染色体上,由4个外显子组成,其中ATG起始密码子在1号外显子,TGA终止密码子在4号外显子。赛业生物(Cyagen)选择外显子1至4作为目标区域,该区域包含465个碱基对的编码序列。敲除区域(KO区域)大约为23.5 kb。构建该小鼠模型的过程包括将核糖核蛋白(RNP)和靶向载体共同注入受精卵,然后通过PCR和测序分析进行基因型鉴定。
基因研究概述
基因4921524J17Rik是小鼠基因组中的一个基因,位于17号染色体上。该基因编码的蛋白质功能尚未完全明确,但已有研究表明,它可能与细胞增殖、分化和凋亡等生物学过程相关。基因4921524J17Rik的表达模式也较为特殊,它在小鼠胚胎发育过程中呈现动态变化,提示其可能参与调节发育过程。
基因4921524J17Rik的研究对理解基因复制和基因丢失在进化中的作用具有重要意义。基因复制和基因丢失是动物基因组进化中的频繁事件,两者之间的动态平衡导致了物种间基因数量的显著差异。在基因复制后,两个副本通常以大致相同的速率积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累非常不均匀,一个副本会从其同源基因中显著分化出来。这种“非对称进化”在串联基因复制后比全基因组复制后更为常见,并且可以产生实质性的新基因。例如,在蛾类、软体动物和哺乳动物的复制同源框基因中,非对称进化产生了新的同源框基因,这些基因被招募到新的发育作用中[1]。
乳腺癌是一种异质性疾病,大多数乳腺癌病例(约70%)被认为是散发的。家族性乳腺癌(约30%的患者)通常出现在乳腺癌发病率高的家族中,已经与许多高、中、低渗透性易感基因相关。家族连锁研究已经确定了高渗透性基因,如BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,它们负责遗传综合征。此外,基于家庭和人群的方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中等的乳腺癌风险相关。乳腺癌的全基因组关联研究(GWAS)揭示了许多常见的低渗透性等位基因,这些等位基因与乳腺癌风险略有增加或降低相关。目前,只有高渗透性基因在临床实践中得到广泛应用。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将纳入遗传测试。然而,在将多基因面板测试完全纳入临床工作流程之前,需要对中度和低风险变异的临床管理进行额外研究。在这篇综述中,我们重点关注家族性乳腺癌风险的不同组成部分[2]。
基因电路是后基因组研究的一个主要焦点,旨在了解基因和蛋白质的连接如何产生细胞现象。这种连接产生分子网络图,类似于复杂的电路图,系统理解将需要开发描述电路的数学框架。从工程的角度来看,通往这一框架的自然途径是构建和分析构成网络的底层模块。最近在测序和基因工程方面的实验进展使得通过设计和实施适合数学建模和定量分析的合成基因网络来实现这种方法成为可能。这些发展标志着基因电路学科的兴起,它提供了一个预测和评估细胞过程动力学的框架。合成基因网络还将导致新的细胞控制逻辑形式,这可能在功能基因组学、纳米技术和基因和细胞治疗中具有重要应用[3]。
理解基因型-表型关系是生物学中的核心追求。基因敲除产生完全的功能丧失基因型,是探测基因功能的一种常用方法。基因敲除最严重的表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因被称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析表明,基因组中大约四分之一的基因可以是必需的。与基因型-表型关系一样,基因必需性受背景效应的影响,并且可能因基因-基因相互作用而变化。特别是,对于一些必需基因,敲除引起的致死性可以通过外基因抑制因子得到拯救。这种“必需性旁路”(BOE)基因-基因相互作用是一种未被充分研究的遗传抑制类型。最近的一项系统分析发现,令人惊讶的是,裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用得到旁路。在这里,我回顾了发现和理解必需性旁路的历史和最新进展[4]。
基因调控网络(GRNs)是细胞内基因表达调控的复杂系统。GRNs由基因、转录因子和其他调节分子组成,它们相互作用以控制基因的表达模式。GRNs在细胞命运决定、发育过程和响应环境变化中发挥着关键作用。研究GRNs对于理解生物系统的复杂性和揭示疾病发生的分子机制至关重要。尽管对GRNs的研究已经取得了一些进展,但仍有许多挑战和开放性问题需要解决,包括GRNs的精确建模、动态分析和功能预测等[5]。
植物CARE是一个数据库,包含植物顺式作用调控元件、增强子和抑制子。调控元件由位置矩阵、保守序列和特定启动子序列上的单个位点表示。当可用时,提供到EMBL、TRANSFAC和MEDLINE数据库的链接。转录位点的数据主要从文献中提取,并补充了越来越多的计算机预测数据。除了对特定转录因子位点的描述外,还提供了对实验证据的置信度水平、功能信息以及在启动子上的位置。已经实现了新的功能来搜索查询序列中的植物顺式作用调控元件。此外,现在还提供了到新的聚类和基序搜索方法的链接,以研究共表达基因簇。新发现的调控元件可以自动发送,并在经过审查后添加到数据库中。植物CARE关系数据库可通过万维网在http://sphinx.rug.ac.be:8080/PlantCARE/获得[6]。
综上所述,基因4921524J17Rik是一个具有潜在重要生物学功能的基因,可能参与调节细胞增殖、分化和凋亡等生物学过程。进一步研究基因4921524J17Rik的功能和调控机制,将有助于深入理解基因复制、基因丢失和非对称进化在进化中的作用。此外,基因4921524J17Rik的研究也可能为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Lescot, Magali, Déhais, Patrice, Thijs, Gert, Rouzé, Pierre, Rombauts, Stephane. . PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences. In Nucleic acids research, 30, 325-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11752327/