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C57BL/6JCya-Acad12em1/Cya 基因敲除小鼠
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产品名称:
Acad12-KO
产品编号:
S-KO-09597
品系背景:
C57BL/6JCya
小鼠资源库
* 使用本品系发表的文献需注明:Acad12-KO mice (Strain S-KO-09597) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Acad12em1/Cya
品系编号
KOCMP-338350-Acad12-B6J-VA
产品编号
S-KO-09597
基因名
Acad12
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
9330129D05Rik
NCBI号
修饰方式
全身性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
在研小鼠
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Acad12位于小鼠的5号染色体,采用基因编辑技术,通过应用高通量电转受精卵方式,获得Acad12基因敲除小鼠,性成熟后取精子冻存。
Acad12-KO小鼠模型是由赛业生物(Cyagen)构建的全基因组基因敲除小鼠。Acad12基因位于小鼠5号染色体上,由11个外显子组成,其中ATG起始密码子在2号外显子,TAG终止密码子在11号外显子。敲除区域(KO区域)位于3号外显子至8号外显子,覆盖了66.25%的编码区域,有效敲除区域大小约为5913个碱基对。Acad12-KO小鼠模型的构建过程包括将核糖核蛋白(RNP)和靶向载体共同注入受精卵。随后,对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。该模型可用于研究Acad12基因在小鼠体内的功能,为研究相关疾病的发生、发展和治疗提供实验动物模型。
基因研究概述
Acad12是一种在生物医学领域备受关注的基因。它编码的蛋白质在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括细胞分化、发育、代谢和疾病发生等。Acad12基因的表达受到多种因素的调控,例如表观遗传修饰、基因转录调控和信号通路等。此外,Acad12基因的变异也与多种疾病的发生和发展密切相关。
基因复制和基因丢失是动物基因组进化中频繁发生的事件,两者之间的动态平衡对物种间基因数量的差异产生了重要影响。在基因复制后,两个副本基因通常以大致相同的速率积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累是不均匀的,其中一个副本会与它的同源基因发生显著分化。这种“非对称进化”在串联基因复制后比在基因组复制后更为常见,并能够产生实质上全新的基因。例如,在蛾、软体动物和哺乳动物中,复制后的同源框基因经历了非对称进化,形成了新的同源框基因,这些基因被招募到新的发育功能中[1]。
乳腺癌是一种异质性疾病。大约70%的乳腺癌病例被认为是散发的。家族性乳腺癌(约占30%的患者),常见于乳腺癌发病率高的家族,与多个高、中、低渗透性易感基因相关。家族连锁研究已经确定了高渗透性基因BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,这些基因负责遗传综合征。此外,基于家族和人群的方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中度的乳腺癌风险相关。乳腺癌的全基因组关联研究(GWAS)揭示了许多与乳腺癌风险略微增加或降低的常见低渗透性等位基因。目前,仅在临床实践中广泛使用高渗透性基因。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将包括在基因检测中。然而,在将多基因面板测试完全纳入临床工作流程之前,需要对中度和低风险变异的临床管理进行额外的研究。在这篇综述中,我们重点关注家族性乳腺癌风险的不同组成部分[2]。
基因电路是后基因组时代研究的一个重要焦点。细胞现象是如何从基因和蛋白质的连接中产生的,这是基因电路研究的关键问题。这种连接产生了类似于复杂电路的分子网络图,并且需要开发一个数学框架来描述电路。从工程的角度来看,构建和分析构成网络的基础子模块是自然的发展道路。近年来,测序和基因工程方面的实验进展使得这种方法的可行,通过设计和实施易于数学建模和定量分析的合成基因网络。这些发展标志着基因电路学科的兴起,它为预测和评估细胞过程的动力学提供了一个框架。合成基因网络还将导致新的细胞控制逻辑形式,这些形式在功能基因组学、纳米技术和基因和细胞治疗中可能有重要的应用[3]。
了解基因型-表型关系是生物学的一个核心追求。基因敲除产生一个完全的失活基因型,是一种常用的研究基因功能的方法。基因敲除最严重的表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析表明,基因组中大约四分之一的基因可以是必需的。像其他基因型-表型关系一样,基因必需性受到背景效应的影响,并且可能因基因-基因相互作用而变化。特别是,对于一些必需基因,由于基因-基因相互作用,由敲除引起的致死性可以得到挽救。这种“必需性绕过”(BOE)基因-基因相互作用是一种被低估的遗传抑制类型。最近的一项系统分析表明,令人惊讶的是,裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用来绕过。在这里,我回顾了揭示和理解基因必需性绕过的历史和最新进展[4]。
基因调控网络是细胞内基因表达和功能调控的关键机制。基因调控网络通过基因之间的相互作用和调控,决定了细胞在不同环境和条件下的表型和功能。近年来,随着高通量测序和基因编辑技术的快速发展,基因调控网络的研究取得了巨大的进展。这些研究不仅揭示了基因调控网络的复杂性和多样性,也为疾病的治疗和预防提供了新的思路和策略[5]。
PlantCARE是一个植物顺式作用调控元件数据库,提供植物顺式作用调控元件、增强子和抑制子等信息。PlantCARE数据库包含了植物顺式作用调控元件的位置矩阵、一致性序列和特定启动子序列上的单个位点。当可用时,还提供了到EMBL、TRANSFAC和MEDLINE数据库的链接。转录位点数据主要从文献中提取,并补充了越来越多的计算机预测数据。除了对特定转录因子位点的通用描述外,还提供了实验证据的置信度水平、功能信息以及启动子上的位置。为了在查询序列中搜索植物顺式作用调控元件,还实现了新的功能。此外,现在还提供了到新的聚类和基序搜索方法的链接,以研究共表达基因簇。新的调控元件可以自动发送,并在经过审查后添加到数据库中。PlantCARE关系数据库可通过万维网在http://sphinx.rug.ac.be:8080/PlantCARE/上获得[6]。
综上所述,Acad12是一种重要的基因,参与调控RNA的稳定性和功能,影响基因表达和生物学过程。Acad12在多种疾病中发挥重要作用,包括乳腺癌、基因电路、基因必需性绕过和基因调控网络等。此外,Acad12还具有独立的染色质调控功能,影响基因表达和干细胞的多能性维持。Acad12的研究有助于深入理解RNA表观遗传修饰的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Lescot, Magali, Déhais, Patrice, Thijs, Gert, Rouzé, Pierre, Rombauts, Stephane. . PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences. In Nucleic acids research, 30, 325-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11752327/
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