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C57BL/6JCya-A430033K04Rikem1/Cya 基因敲除小鼠
产品名称:
A430033K04Rik-KO
产品编号:
S-KO-07431
品系背景:
C57BL/6JCya
小鼠资源库
* 使用本品系发表的文献需注明:A430033K04Rik-KO mice (Strain S-KO-07431) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-A430033K04Rikem1/Cya
品系编号
KOCMP-243308-A430033K04Rik-B6J-VA
产品编号
S-KO-07431
基因名
A430033K04Rik
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
ObI-1; ObI1
NCBI号
修饰方式
全身性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
活体
环境标准
SPF
供应地区
全球范围
品系详情
A430033K04Rik位于小鼠的5号染色体,采用基因编辑技术,通过应用高通量电转受精卵方式,获得A430033K04Rik基因敲除小鼠,性成熟后取精子冻存。
A430033K04Rik-KO小鼠模型是由赛业生物(Cyagen)采用基因编辑技术构建的全身性基因敲除小鼠。该模型用于研究A430033K04Rik基因在小鼠体内的功能。A430033K04Rik基因位于小鼠5号染色体上,由4个外显子组成,其中ATG起始密码子在1号外显子,TAA终止密码子在4号外显子。敲除区域位于2至3号外显子,包含220个碱基对的编码序列。敲除该区域会导致小鼠A430033K04Rik基因功能的丧失。A430033K04Rik-KO小鼠模型的构建过程包括将核糖核蛋白(RNP)和靶向载体共同注入受精卵。随后,对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。
基因研究概述
基因A430033K04Rik是小鼠基因组中一个非编码RNA基因,它属于假基因家族。假基因是指在基因组中与已知基因具有高度序列相似性,但由于突变或插入缺失导致其功能丧失的基因副本。A430033K04Rik基因与其它基因家族成员的序列相似度很高,但功能上可能已发生改变或完全丧失。非编码RNA基因在调控基因表达、维持基因组稳定性、发育过程和疾病发生中发挥着重要作用,尽管它们不编码蛋白质,但通过转录可以影响细胞的功能和表型。
基因复制和丢失是动物基因组进化的常见事件,这两个动态过程的平衡导致了物种间基因数量的显著差异[1]。在基因复制后,通常两个副本基因会以大致相等的速率积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累是非常不均匀的,其中一个副本会从其同源基因中显著分化出来。这种“不对称进化”在串联基因复制后比在基因组复制后更为常见,并可以产生实质性的新基因。例如,在蛾、软体动物和哺乳动物中,已观察到不对称进化的例子,在每种情况下都产生了新的同源框基因,这些基因被招募到新的发育作用中[1]。
乳腺癌是一种异质性疾病,大多数乳腺癌病例(约70%)被认为是散发性的。家族性乳腺癌(约30%的患者)通常见于乳腺癌发病率高的家庭,与多种高、中、低外显率的易感基因相关。家系连锁研究已经确定了高外显率基因,如BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,这些基因负责遗传综合征。此外,家系和人群相结合的方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中度乳腺癌风险相关[2]。基因组关联研究(GWAS)在乳腺癌中发现了一系列常见的低外显率等位基因,这些等位基因与乳腺癌风险略有增加或减少相关。目前,只有高外显率基因在临床实践中得到广泛应用。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将纳入遗传测试。然而,在多基因面板测试完全融入临床工作流程之前,需要对中度和低风险变异的临床管理进行额外研究[2]。
基因调控网络是一个复杂的系统,其中基因和蛋白质的连通性生成分子网络图,类似于复杂的电路。对这种连通性的系统理解需要发展一个数学框架来描述电路。从工程的角度来看,这种框架的自然路径是通过构建和分析构成网络的底层模块来实现的。近年来,在测序和基因工程方面的实验进展使得这种途径成为可能,通过设计和实施合成基因网络,这些网络易于数学建模和定量分析。这些发展标志着基因电路学科的兴起,该学科提供了一个预测和评估细胞过程动力学的框架。合成基因网络还将导致细胞控制的新逻辑形式,这可能对功能基因组学、纳米技术和基因和细胞治疗有重要应用[3]。
基因敲除是一种常用的方法,用于探索基因功能,它产生了一种完全的功能丧失基因型。基因敲除的最严重表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因称为必需基因。基于酵母的基因组范围敲除分析表明,基因组中多达四分之一的基因可能是必需的。与其它基因型-表型关系一样,基因必需性受背景效应的影响,并且可能由于基因-基因相互作用而发生变化。特别是,对于某些必需基因,由敲除引起的致死性可以通过外基因抑制因子来挽救。这种“必需性旁路”(BOE)基因-基因相互作用是一种未被充分研究的遗传抑制类型。最近的一项系统分析显示,令人惊讶的是,裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用来绕过[4]。
综上所述,基因A430033K04Rik作为小鼠基因组中的一个非编码假基因,其在基因复制和丢失的进化过程中可能发挥了作用。非编码RNA基因在基因表达调控、基因组稳定性维持、发育和疾病发生中扮演着重要角色。随着对基因功能研究的深入,非编码RNA基因在生物医学研究中的应用前景日益广阔。此外,合成基因网络和基因调控网络的研究为我们提供了新的工具和方法,以更好地理解基因表达和细胞过程的动态,为疾病的治疗和预防提供了新的思路和策略[3,4]。
参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/