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Rnps1-KO 基因敲除小鼠

Rnps1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Rnps1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-04108

品系全称

C57BL/6JCya-Rnps1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-19826-Rnps1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Rnps1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-04108) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
KO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
RNA binding protein with serine rich domain 1
基因别称
-
染色体号
Chr 17 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_009070 | Ensembl: ENSMUST00000163717
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~8
敲除长度
~6.4 kb
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
更多信息
RNA-binding protein with serine-rich domain 1（RNPS1），是一种含有富含丝氨酸结构域的RNA结合蛋白，在多种生物学过程中发挥着重要作用。RNPS1属于RNA结合蛋白家族，能够与RNA分子相互作用，参与调控RNA的转录、剪接、翻译和降解等过程。

RNPS1在细胞凋亡和剪接相关蛋白复合物（ASAP）中发挥着重要作用。ASAP复合物包含RNPS1、Acinus和SAP18等亚基，它们在RNA代谢过程中具有多种功能，包括转录、剪接、翻译和无义介导的mRNA降解（NMD）。RNPS1在转录过程中能够防止R-loop的形成，而Acinus和SAP18则通过与组蛋白脱乙酰酶的相互作用抑制转录。在剪接过程中，RNPS1和Acinus可以作为剪接激活剂，而ASAP复合物则表现为剪接抑制因子。此外，ASAP复合物的各个成员还可以与外显子连接复合物（EJC）相互作用，参与剪接和翻译过程。RNPS1通过参与mRNA的3'端加工和多聚体关联，提高翻译效率。在NMD过程中，RNPS1通过与EJC相互作用，招募降解因子[1]。

RNPS1的丝氨酸富集结构域（S结构域）在剪接过程中发挥重要作用。研究发现，RNPS1或其S结构域的结合可以导致HIV-1剪接底物的外显子包含，而RNPS1的RRM结构域的过表达则以显性负性方式导致内源性凋亡前mRNA（Bcl-X和MCL-1）的外显子跳跃。进一步的研究发现，核心EJC蛋白eIF4A3、MAGOH或Y14的结合并不导致HIV底物的外显子包含。这些结果表明，RNPS1及其结构域在选择性剪接中具有不同的作用[2]。

RNPS1在宫颈癌细胞中发挥致癌剪接因子的作用。研究发现，RNPS1在宫颈癌组织中的表达水平高于正常组织，且在宫颈癌细胞中的表达也高于正常细胞系。RNPS1的表达与宫颈癌细胞的增殖、集落形成能力、迁移和侵袭能力密切相关。此外，RNPS1的敲低可以增加宫颈癌细胞对化疗药物阿霉素的敏感性。RNPS1通过选择性剪接调节关键基因（如Rac1b、RhoA、MDM4和WDR1）的肿瘤相关异构体的生成，从而促进宫颈癌细胞的侵袭和转移[3]。

RNPS1与外显子连接复合物（EJC）相关，并核形成剪接调控复合物，以维持转录组监控。研究发现，RNPS1可以抑制隐秘剪接位点的误剪接，并激活细胞质中的NMD。在转录组范围内分析EJC和RNPS1敲低的影响，发现RNPS1可以适度影响NMD活性，但并非NMD的全球必需因子。然而，大量的异常剪接事件强烈表明，RNPS1的主要功能是剪接调控。RNPS1的RRM和C末端结构域都对RNPS1依赖性剪接事件的调控发挥部分作用。通过免疫沉淀和邻近标记，确定了RNPS1核心互作组，鉴定了与剪接调控因子相互作用的蛋白质，这些相互作用依赖于RNPS1的C末端或RRM结构域。因此，RNPS1作为一种多功能的剪接调节因子，通过形成不同的剪接促进复合物，促进正确和高效的剪接，以维持转录组的监控[4]。

转移相关肺腺癌转录本1（MALAT1）lncRNA与RNPS1结合，在泛癌剪接和基因表达中发挥调控作用。MALAT1是一种高度保守的lncRNA，其过表达可以促进癌症发展。研究发现，MALAT1与RNPS1结合，并共定位于核斑点中，可能通过调节选择性剪接来调控基因表达。通过分子动力学（MD）模拟，观察到MALAT1的M区域、E区域和全长结构能够与RNPS1的RS/P结构域结合，形成稳定的复合物。能量分解分析表明，RNPS1蛋白中的精氨酸是结合自由能的主要贡献者，而在核苷酸中，G和A核苷酸是主要的贡献者，这表明特定的嘌呤在复合物形成中发挥着重要作用。这些研究为进一步理解lncRNA-蛋白相互作用、稳定性和结合提供了新的视角[5]。

RNPS1调节子宫体子宫内膜腺癌（UCEC）的微卫星不稳定性。研究发现，RNPS1在UCEC组织中的表达水平高于正常组织，且与UCEC患者的预后不良相关。RNPS1的敲低可以抑制UCEC细胞的增殖，促进细胞凋亡，并降低肿瘤体积。此外，RNPS1的敲低还可以增加MMR蛋白MSH2和MSH6的表达水平，而抑制Notch信号通路可以逆转这种作用。RNPS1还与UCEC中NAA11、C2orf57、NUPR1等基因的突变相关。这些结果表明，RNPS1可能通过Notch信号通路调节MMR蛋白的表达水平，进而影响UCEC的增殖、发展和预后[6]。

RNPS1作为剪接激活剂，可以抑制前mRNA剪接中的错误，是mRNA质量控制的关键因子。研究发现，RNPS1的细胞敲低导致野生型AURKB蛋白的减少，表明AURKB前mRNA剪接的保真度降低。主要的异常AURKB mRNA来源于内含子5的上游伪5'和3'剪接位点，导致产生非功能性的截短AURKB蛋白。AURKB是一种重要的有丝分裂因子，其缺失会导致多核现象。RNPS1的敲低表型可以通过AURKB的过表达来挽救，表明AURKB是RNPS1的主要功能靶点。此外，RNPS1的敲低还在另一个完全不同的前mRNA（MDM2）中诱导了平行的异常剪接模式，表明RNPS1是剪接保真度的全球守护者[7]。

综上所述，RNPS1作为一种重要的RNA结合蛋白，在RNA代谢过程中发挥着重要作用。RNPS1通过参与转录、剪接、翻译和降解等过程，调控基因表达和生物学过程。RNPS1在多种癌症中发挥致癌作用，通过调节选择性剪接促进肿瘤细胞的侵袭和转移。此外，RNPS1还具有独立的染色质调控功能，影响基因表达和干细胞的多能性维持。RNPS1的研究有助于深入理解RNA代谢的生物学功能和疾病发生机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献：
1. Deka, Bhagyashree, Singh, Kusum Kumari. 2017. Multifaceted Regulation of Gene Expression by the Apoptosis- and Splicing-Associated Protein Complex and Its Components. In International journal of biological sciences, 13, 545-560. doi:10.7150/ijbs.18649. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28539829/
2. Kumari, Sweta, Deka, Bhagyashree, Singh, Kusum Kumari. 2023. Serine-rich domain of RNPS1 functions in activation of alternative splicing. In Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms, 28, 615-623. doi:10.1111/gtc.13036. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37204171/
3. Deka, Bhagyashree, Chandra, Pratap, Yadav, Priyanka, Kunnumakkara, Ajaikumar B, Singh, Kusum Kumari. 2022. RNPS1 functions as an oncogenic splicing factor in cervical cancer cells. In IUBMB life, 75, 514-529. doi:10.1002/iub.2686. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36300671/
4. Schlautmann, Lena P, Lackmann, Jan-Wilm, Altmüller, Janine, Boehm, Volker, Gehring, Niels H. . Exon junction complex-associated multi-adapter RNPS1 nucleates splicing regulatory complexes to maintain transcriptome surveillance. In Nucleic acids research, 50, 5899-5918. doi:10.1093/nar/gkac428. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35640609/
5. Mishra, Aanchal, Mishra, Seema. 2024. Metastasis-Associated Lung Adenocarcinoma Transcript 1 (MALAT1) lncRNA Conformational Dynamics in Complex with RNA-Binding Protein with Serine-Rich Domain 1 (RNPS1) in the Pan-cancer Splicing and Gene Expression. In ACS omega, 9, 42212-42226. doi:10.1021/acsomega.4c04467. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39431102/
6. Liu, Xiaojuan, Ma, Hui, Ma, Lisha, Li, Kun, Kang, Yanhua. 2021. RNA-binding protein with serine-rich domain 1 regulates microsatellite instability of uterine corpus endometrial adenocarcinoma. In Clinics (Sao Paulo, Brazil), 76, e3318. doi:10.6061/clinics/2021/e3318. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34817046/
7. Fukumura, Kazuhiro, Inoue, Kunio, Mayeda, Akila. 2018. Splicing activator RNPS1 suppresses errors in pre-mRNA splicing: A key factor for mRNA quality control. In Biochemical and biophysical research communications, 496, 921-926. doi:10.1016/j.bbrc.2018.01.120. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29366779/

资料下载

S-KO-04108_6J_19826_Rnps1_Exon 3~8_strategy.pdf
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